BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Nitab v4.5 cDNA Edwards2017 69,500 sequences; 76,611,276 total letters Query= Untitled_sequence Length=1218 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Nitab4.5_0001907g0020.1Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, ... 2250 0.0 Nitab4.5_0002649g0050.1Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, ... 2039 0.0 >Nitab4.5_0001907g0020.1 Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, Aspartate carbamoyltransferase, Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, Asp/Orn-binding domain, Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, carbamoyl-P binding Length=1218 Score = 2250 bits (1218), Expect = 0.0 Identities = 1218/1218 (100%), Gaps = 0/1218 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCTATTTCCTCAACATTTTCTTCACATGTATTCCATGGGAAAAGACTTGTGTCACCT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGCTATTTCCTCAACATTTTCTTCACATGTATTCCATGGGAAAAGACTTGTGTCACCT 60 Query 61 CCGAGAATGAGTTATTCTAACTTTGGAGGCAATAATTTATGGTTAAAGCAACCTGTGCAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CCGAGAATGAGTTATTCTAACTTTGGAGGCAATAATTTATGGTTAAAGCAACCTGTGCAC 120 Query 121 TGTAAACCTACTTGTTTACTTGCCGACATGTCAAAATCACAGTTGCTACTCGCAGTTGAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TGTAAACCTACTTGTTTACTTGCCGACATGTCAAAATCACAGTTGCTACTCGCAGTTGAA 180 Query 181 TTGTTTACAAAGTGCGGAAATCAATGCATTATGCCGACAAGTAGGGGAGGATTCCAATGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTGTTTACAAAGTGCGGAAATCAATGCATTATGCCGACAAGTAGGGGAGGATTCCAATGC 240 Query 241 AGAGCATTGGAGGTGAAAAATAAGTCTTTAACTATGGTGGGGAGTAAGTTTCAACTTGAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AGAGCATTGGAGGTGAAAAATAAGTCTTTAACTATGGTGGGGAGTAAGTTTCAACTTGAT 300 Query 301 GATGTAATTGAAGCTCAGCAGTTTGATAGAGATACTCTCAGTGCCATATTTGAAGTGGCG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GATGTAATTGAAGCTCAGCAGTTTGATAGAGATACTCTCAGTGCCATATTTGAAGTGGCG 360 Query 361 CAGGAGATGGAGAAAATTGAGAAGAACTCGATGGGAAGCGAGATTCTTAAGGGTTATCTA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CAGGAGATGGAGAAAATTGAGAAGAACTCGATGGGAAGCGAGATTCTTAAGGGTTATCTA 420 Query 421 ATGGCCACTCTCTTCTATGAACCCTCAACTAGGACTAGGCTTTCATTTGAATCTGCCATG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATGGCCACTCTCTTCTATGAACCCTCAACTAGGACTAGGCTTTCATTTGAATCTGCCATG 480 Query 481 AAGCGTTTAGGTGGGGAAGTATTGACTACGGAAAATGCTCGCGAATTTTCATCTGCCGCA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 AAGCGTTTAGGTGGGGAAGTATTGACTACGGAAAATGCTCGCGAATTTTCATCTGCCGCA 540 Query 541 AAAGGAGAGACGCTTGAAGATTCAATTAGAACTGTTGAAGGGTACTCTGACATCATTGTT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AAAGGAGAGACGCTTGAAGATTCAATTAGAACTGTTGAAGGGTACTCTGACATCATTGTT 600 Query 601 ATGAGACATTTTGAAAGTGGTGCTGCTAAAAGAGCTGCAGCCACTGCCAGTATTCCAATT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 ATGAGACATTTTGAAAGTGGTGCTGCTAAAAGAGCTGCAGCCACTGCCAGTATTCCAATT 660 Query 661 ATAAATGCTGGAGATGGCCCTGGACAACACCCAACTCAGGCCCTTTTAGACGTGTATACC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ATAAATGCTGGAGATGGCCCTGGACAACACCCAACTCAGGCCCTTTTAGACGTGTATACC 720 Query 721 ATTGAAAGAGAAATAGGAAAACTTGATGGTATTAAAGTTGCTCTTGTTGGTGATTTAGCT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 ATTGAAAGAGAAATAGGAAAACTTGATGGTATTAAAGTTGCTCTTGTTGGTGATTTAGCT 780 Query 781 TATGGGAGGACAGTTCGTTCACTTGCTTACTTGCTCGCGAAGTACCAAGATGTGAAAATT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TATGGGAGGACAGTTCGTTCACTTGCTTACTTGCTCGCGAAGTACCAAGATGTGAAAATT 840 Query 841 TACTTTGTGTCCCCTGATGTAGTTAAAATGAAGGATGATATAAAGGATTATTTGACGTCA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TACTTTGTGTCCCCTGATGTAGTTAAAATGAAGGATGATATAAAGGATTATTTGACGTCA 900 Query 901 ATGGGGGTTCAGTGGGAAGAAAGTGCTGATCTGGTGGATGTGGCTTCTAAATGTGATGTG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 ATGGGGGTTCAGTGGGAAGAAAGTGCTGATCTGGTGGATGTGGCTTCTAAATGTGATGTG 960 Query 961 GTATATCAAACTCGTATTCAAAGAGAAAGATTTGGAGAGAGGGTTGATTTGTATGAAGAA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GTATATCAAACTCGTATTCAAAGAGAAAGATTTGGAGAGAGGGTTGATTTGTATGAAGAA 1020 Query 1021 GCTCGAGGGAAGTATATCGTGGATCTAGCTGTCTTAAATGCTATGCAGAAACATGCAGTA 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 GCTCGAGGGAAGTATATCGTGGATCTAGCTGTCTTAAATGCTATGCAGAAACATGCAGTA 1080 Query 1081 GTGATGCATCCTTTGCCAAGACTTGATGAGATAACTGTTGATGTGGATGAAGATCCAAGG 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 GTGATGCATCCTTTGCCAAGACTTGATGAGATAACTGTTGATGTGGATGAAGATCCAAGG 1140 Query 1141 GCTGCTTATTTCAGACAAGCTAAGAATGGTCTTTATATTCGTATGGCACTTTTGAAGCTT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 GCTGCTTATTTCAGACAAGCTAAGAATGGTCTTTATATTCGTATGGCACTTTTGAAGCTT 1200 Query 1201 CTACTTCTTGGTTGGTGA 1218 |||||||||||||||||| Sbjct 1201 CTACTTCTTGGTTGGTGA 1218 >Nitab4.5_0002649g0050.1 Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, Aspartate carbamoyltransferase, Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, Asp/Orn-binding domain, Aspartate/ornithine carbamoyltransferase, carbamoyl-P binding Length=1218 Score = 2039 bits (1104), Expect = 0.0 Identities = 1180/1218 (97%), Gaps = 0/1218 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCTATTTCCTCAACATTTTCTTCACATGTATTCCATGGGAAAAGACTTGTGTCACCT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1 ATGGCTATTTCCTCAACATTTTCTTCACATGTATTCCATGGGAAAATACTTGTGTCACCT 60 Query 61 CCGAGAATGAGTTATTCTAACTTTGGAGGCAATAATTTATGGTTAAAGCAACCTGTGCAC 120 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CCTAGAATGAGTTATTCTAACTTTGGAGGCAATAATTTATGGTTAAAGCAACCTGTGCAC 120 Query 121 TGTAAACCTACTTGTTTACTTGCCGACATGTCAAAATCACAGTTGCTACTCGCAGTTGAA 180 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| Sbjct 121 TGTAAACCTACTTGTTTACTTGCTGACATGTCAAAATCACAGTTGTCATTCGCTGTTGAA 180 Query 181 TTGTTTACAAAGTGCGGAAATCAATGCATTATGCCGACAAGTAGGGGAGGATTCCAATGC 240 ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTGTTTAAAAAAGGCGGAAATCAATGCGTTATGCCAACAAATAGGGGAGGATTCCAATGC 240 Query 241 AGAGCATTGGAGGTGAAAAATAAGTCTTTAACTATGGTGGGGAGTAAGTTTCAACTTGAT 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 241 AGAGCATTGGAGGTGAAAAATAAGTCTTTAACTATGGTGGGAAGTAAGTTTCAGCTTGAT 300 Query 301 GATGTAATTGAAGCTCAGCAGTTTGATAGAGATACTCTCAGTGCCATATTTGAAGTGGCG 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GATGTAATTGAAGCTCAGCAGTTTGATAGAGATACTCTCAGTGCCATATTTGAAGTGGCA 360 Query 361 CAGGAGATGGAGAAAATTGAGAAGAACTCGATGGGAAGCGAGATTCTTAAGGGTTATCTA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CAGGAGATGGAGAAAATTGAGAAGAACTCGATGGGAAGCGAGATTCTTAAGGGTTATCTA 420 Query 421 ATGGCCACTCTCTTCTATGAACCCTCAACTAGGACTAGGCTTTCATTTGAATCTGCCATG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATGGCCACTCTCTTCTATGAACCCTCAACTAGGACTAGACTTTCATTTGAATCTGCCATG 480 Query 481 AAGCGTTTAGGTGGGGAAGTATTGACTACGGAAAATGCTCGCGAATTTTCATCTGCCGCA 540 || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 481 AAACGTTTAGGCGGGGAAGTATTAACAACGGAAAATGCTCGCGAATTTTCATCTGCAGCA 540 Query 541 AAAGGAGAGACGCTTGAAGATTCAATTAGAACTGTTGAAGGGTACTCTGACATCATTGTT 600 |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AAAGGAGAGACGCTGGAAGATACAATTAGAACTGTTGAAGGGTACTCTGACATCATTGTT 600 Query 601 ATGAGACATTTTGAAAGTGGTGCTGCTAAAAGAGCTGCAGCCACTGCCAGTATTCCAATT 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| Sbjct 601 ATGAGACATTTTGAAAGTGGTGCTGCTAAAAGAGCCGCAGCTACTGCCAGTATTCCAATT 660 Query 661 ATAAATGCTGGAGATGGCCCTGGACAACACCCAACTCAGGCCCTTTTAGACGTGTATACC 720 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct 661 ATAAATGCTGGAGATGGTCCTGGACAACACCCAACTCAGGCCCTTCTAGATGTGTATACC 720 Query 721 ATTGAAAGAGAAATAGGAAAACTTGATGGTATTAAAGTTGCTCTTGTTGGTGATTTAGCT 780 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 721 ATCGAAAGAGAAATAGGAAAACTTGATGGTATTAAAGTTGCTCTTGTTGGTGATCTAGCT 780 Query 781 TATGGGAGGACAGTTCGTTCACTTGCTTACTTGCTCGCGAAGTACCAAGATGTGAAAATT 840 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TATGGGAGGACAGTTCGTTCACTTGCCTACTTGCTCGCGAAGTACCAAGATGTGAAAATT 840 Query 841 TACTTTGTGTCCCCTGATGTAGTTAAAATGAAGGATGATATAAAGGATTATTTGACGTCA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 841 TACTTTGTGTCCCCTGATGTAGTTAAAATGAAGGATGATATAAAGGATTATTTGACATCA 900 Query 901 ATGGGGGTTCAGTGGGAAGAAAGTGCTGATCTGGTGGATGTGGCTTCTAAATGTGATGTG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 901 ATGGGGGTTCAGTGGGAAGAAAGTGCTGATCTGGTGGAGGTGGCTTCTAAATGTGATGTG 960 Query 961 GTATATCAAACTCGTATTCAAAGAGAAAGATTTGGAGAGAGGGTTGATTTGTATGAAGAA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GTATATCAAACTCGTATTCAAAGAGAAAGATTTGGAGAGAGGGTTGATTTGTATGAAGAA 1020 Query 1021 GCTCGAGGGAAGTATATCGTGGATCTAGCTGTCTTAAATGCTATGCAGAAACATGCAGTA 1080 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 GCTCGAGGGAAGTATATCGTGGATCTGGGTGTCTTAAATGCTATGCAGAAACATGCAGTA 1080 Query 1081 GTGATGCATCCTTTGCCAAGACTTGATGAGATAACTGTTGATGTGGATGAAGATCCAAGG 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 GTGATGCATCCTTTGCCAAGACTTGATGAGATAACTGTTGATGTGGATGAAGATCCAAGG 1140 Query 1141 GCTGCTTATTTCAGACAAGCTAAGAATGGTCTTTATATTCGTATGGCACTTTTGAAGCTT 1200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1141 GCTGCTTATTTCAGACAAGCTAAGAATGGTCTTTATATTCGGATGGCTCTTTTGAAGCTT 1200 Query 1201 CTACTTCTTGGTTGGTGA 1218 |||||||||||||||||| Sbjct 1201 CTACTTCTTGGTTGGTGA 1218 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 89166696992 Database: Nitab v4.5 cDNA Edwards2017 Posted date: Mar 21, 2024 4:12 PM Number of letters in database: 76,611,276 Number of sequences in database: 69,500 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5