BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Tomato Genome CDS (ITAG release 4.0) 34,075 sequences; 34,993,605 total letters Query= Solyc03g005680.2.1 Length=1811 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Solyc03g005680.3.1 2372 0.0 Solyc09g090520.3.1 1031 0.0 Solyc09g072790.3.1 69.4 8e-11 >Solyc03g005680.3.1 Length=1284 Score = 2372 bits (1284), Expect = 0.0 Identities = 1284/1284 (100%), Gaps = 0/1284 (0%) Strand=Plus/Plus Query 164 ATGGATTCAGATCAAGGAAAACTATTTATTGGTGGGGTATCATGGGAAACATCAGAGGAG 223 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGATTCAGATCAAGGAAAACTATTTATTGGTGGGGTATCATGGGAAACATCAGAGGAG 60 Query 224 AAGATGAAGGAGTATTTTCAAGGGTATGGTGATGTTGTACAGACTGTAGTAATGAGGGAT 283 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AAGATGAAGGAGTATTTTCAAGGGTATGGTGATGTTGTACAGACTGTAGTAATGAGGGAT 120 Query 284 AAGATTACAGGGAAGCCTAGAGGATTTGGGTTTGTTGTATTTGCAGATCCTAGTGTTATT 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AAGATTACAGGGAAGCCTAGAGGATTTGGGTTTGTTGTATTTGCAGATCCTAGTGTTATT 180 Query 344 GATAGGGTTCTTCAGGATACCCATGTAATTGATGGACGTACGGTTGAGGCTAAGAGGGCC 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GATAGGGTTCTTCAGGATACCCATGTAATTGATGGACGTACGGTTGAGGCTAAGAGGGCC 240 Query 404 TTGTCCAGAGAGGAACAACAGGGTCCAAAATCTGGAAATATGGGTGGTGGTAGAAGTTTT 463 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TTGTCCAGAGAGGAACAACAGGGTCCAAAATCTGGAAATATGGGTGGTGGTAGAAGTTTT 300 Query 464 GGAGGCAGTGGAAATACCAGGACTAAGAAAATATTTGTTGGGGGATTGCCTCCCACTCTG 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GGAGGCAGTGGAAATACCAGGACTAAGAAAATATTTGTTGGGGGATTGCCTCCCACTCTG 360 Query 524 ACTGAGGATGACTTTAGAATTTACTTTGAAACTTATGGTAATGTCACTGATGTAGCAATT 583 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 ACTGAGGATGACTTTAGAATTTACTTTGAAACTTATGGTAATGTCACTGATGTAGCAATT 420 Query 584 ATGTATGATCAACAGACCAACCGACCTCGTGGGTTTGGCTTCATTTCATTTGATTCCGAA 643 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATGTATGATCAACAGACCAACCGACCTCGTGGGTTTGGCTTCATTTCATTTGATTCCGAA 480 Query 644 GATGCAGTAGATAGGGTTTTACACAAGGCATATCATGATCTCAGTGGGAAACAAGTAGAA 703 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GATGCAGTAGATAGGGTTTTACACAAGGCATATCATGATCTCAGTGGGAAACAAGTAGAA 540 Query 704 GTAAAACGTGCTCTTCCTAAAGATAGTAATTCTGGTTTTGGTGGTCGTTCCACGGGCAAT 763 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GTAAAACGTGCTCTTCCTAAAGATAGTAATTCTGGTTTTGGTGGTCGTTCCACGGGCAAT 600 Query 764 GGTGGTAGTGGTATGGGTGGTGGAAGTTACCAGGGGTATGGTGACAATCCCAGTTCTTAT 823 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GGTGGTAGTGGTATGGGTGGTGGAAGTTACCAGGGGTATGGTGACAATCCCAGTTCTTAT 660 Query 824 GACAGAATGGATACCAACAGATACATGCAATCACAAAACACTGGAGGTGGTTATCCATCT 883 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GACAGAATGGATACCAACAGATACATGCAATCACAAAACACTGGAGGTGGTTATCCATCT 720 Query 884 TATGGTTCCTCTGGATATGGTACCGCAGGTTATGGTTATGGATCGTCCAACAATGGCATG 943 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TATGGTTCCTCTGGATATGGTACCGCAGGTTATGGTTATGGATCGTCCAACAATGGCATG 780 Query 944 GGTTATGGTGCTTATGGAAGTTACGGTGGAGCCAATCCTGGCTATGGGGGTGTCAATCCT 1003 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 GGTTATGGTGCTTATGGAAGTTACGGTGGAGCCAATCCTGGCTATGGGGGTGTCAATCCT 840 Query 1004 GGATATGGTGGTGCTGCAGGTGCTGCCTTTGGAAATCCAAATGTGCCTGGTACCGGTTAT 1063 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 GGATATGGTGGTGCTGCAGGTGCTGCCTTTGGAAATCCAAATGTGCCTGGTACCGGTTAT 900 Query 1064 GGTAGTGGTCAAGCTGGTGGACCAAGAAGCTCGTGGGGCTCTCAGGTTTCTTCTGGATAT 1123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 GGTAGTGGTCAAGCTGGTGGACCAAGAAGCTCGTGGGGCTCTCAGGTTTCTTCTGGATAT 960 Query 1124 GGTAATATGGGCTATGGTAATGTATCCTGGGGTGCTTCAAGTGCTGGTGGTGGAGGTGGG 1183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GGTAATATGGGCTATGGTAATGTATCCTGGGGTGCTTCAAGTGCTGGTGGTGGAGGTGGG 1020 Query 1184 CCTGCTAACGGTGGATCTGCTGCTGGCCAGTCTCCAACTGGAGCCACAGGATATGGAAAT 1243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 CCTGCTAACGGTGGATCTGCTGCTGGCCAGTCTCCAACTGGAGCCACAGGATATGGAAAT 1080 Query 1244 CAAGGTTATGGCTATGGTGGATATGGCGGAAATGATGGGTCTTATGGAGGTGGTGCATCG 1303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 CAAGGTTATGGCTATGGTGGATATGGCGGAAATGATGGGTCTTATGGAGGTGGTGCATCG 1140 Query 1304 GGAGATATGCAATCAGGTGGAGGTTACATGGGCAGTGGCTATGGCGATGCTAGTGGAAAT 1363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 GGAGATATGCAATCAGGTGGAGGTTACATGGGCAGTGGCTATGGCGATGCTAGTGGAAAT 1200 Query 1364 TCACAAGGTTCTGGTAATTATGGTGCTCAGCAAAATGGACCTTATGGTGGTGGTGCCCCA 1423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 TCACAAGGTTCTGGTAATTATGGTGCTCAGCAAAATGGACCTTATGGTGGTGGTGCCCCA 1260 Query 1424 AGTCGGCAGGCTCAACAACACTGA 1447 |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 AGTCGGCAGGCTCAACAACACTGA 1284 >Solyc09g090520.3.1 Length=1428 Score = 1031 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 959/1151 (83%), Gaps = 34/1151 (3%) Strand=Plus/Plus Query 164 ATGGATTCAGATCAAGGAAAACTATTTATTGGTGGGGTATCATGGGAAACATCAGAGGAG 223 |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| | || ||| Sbjct 1 ATGGATTCAGATCAAGGAAAGCTTTTTATTGGTGGGATTTCATGGGAAACAACTGAAGAG 60 Query 224 AAGATGAAGGAGTATTTTCAAGGGTATGGTGATGTTGTACAGACTGTAGTAATGAGGGAT 283 ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||||||||| Sbjct 61 AAGCTTAAGGAGTATTTTCAAGGATATGGGGATGTTTTGCAGACAGTTGTTATGAGGGAT 120 Query 284 AAGATTACAGGGAAGCCTAGAGGATTTGGGTTTGTTGTATTTGCAGATCCTAGTGTTATT 343 |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || Sbjct 121 AAGATTTCTGGGAAGCCAAGAGGATTTGGGTTTGTTGTTTTTGCAGATCCTAATGTTCTT 180 Query 344 GATAGGGTTCTTCAGGATACCCATGTAATTGATGGACGTACGGTTGAGGCTAAGAGGGCC 403 ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 181 GATAGGGTTCTACAAGATGAACATGTTATTGATGGACGTACGGTTGATGCTAAGAGGGCC 240 Query 404 TTGTCCAGAGAGGAACAACAGGGTCCAAAATCTGGAAATATGGGTGGTGGTAGAAGTTTT 463 ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| | | ||| |||| |||| Sbjct 241 TTGTCGAGAGAGGAGCAGCAGGGCTCAAAATCTGGAAACACAAATAGTGCCAGAAATTTT 300 Query 464 GGAGGCAGTGGAAATACCAGGACTAAGAAAATATTTGTTGGGGGATTGCCTCCCACTCTG 523 ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || Sbjct 301 GGAGGTGGTGGAAACACCAGGACTAAGAAAATTTTTGTTGGGGGATTGCCTCCCACTTTG 360 Query 524 ACTGAGGATGACTTTAGAATTTACTTTGAAACTTATGGTAATGTCACTGATGTAGCAATT 583 || ||||| | || || || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 361 ACCGAGGAAGGATTCCGACAATATTTTGAAAGTTTTGGTAATGTCACTGATGTAGTAATT 420 Query 584 ATGTATGATCAACAGACCAACCGACCTCGTGGGTTTGGCTTCATTTCATTTGATTCCGAA 643 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| Sbjct 421 ATGTATGACCAGCAGACCAACCGACCTCGTGGGTTTGGTTTCATCTCATTTGATTCTGAA 480 Query 644 GATGCAGTAGATAGGGTTTTACACAAGGCATATCATGATCTCAGTGGGAAACAAGTAGAA 703 |||||||||||||| |||||||| ||| | | ||||||||| | ||| ||||| |||||| Sbjct 481 GATGCAGTAGATAGAGTTTTACAGAAGCCCTTTCATGATCTGAATGGTAAACAGGTAGAA 540 Query 704 GTAAAACGTGCTCTTCCTAAAGATAGTAATTCTGGTTTTGGTGGTCGTTCCACGGGCAAT 763 ||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||| |||| Sbjct 541 GTAAAGAAAGCTCTTCCTAAAGATGCTAACCCCGGTGCTGGTGGCCGTTCCATGGGCGGC 600 Query 764 GGT---GGTAGTGGTATGGGTGGTGGAAGTTACCAGGGGTATGGTG-A-CAA-T--C--- 812 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | | Sbjct 601 GGAGGCGGTAGTGGTATGGGTGGTGGAAGTTATCAGGGGTATGGTGGATCAGGTAACAAT 660 Query 813 CC-AGTTCTTATGAC---AGAATGGATACCAACAGATACATGCAATCACAAAACACTGGA 868 || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||| Sbjct 661 CCAAGTTCTTATGACAGTAGAATGGATTCCAACAGGTACATGCAAACTCAAAATGCTGGA 720 Query 869 GGTGGTTATCCATCTTATGGTTCCTCTGGATATGGTACCGCAGGTTATGGTTATGGATCG 928 | ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| | Sbjct 721 GCTGGCTATC---CTTATGGTTCGTCTGGGTATGGTACCCCAGGCTATGGCTATGGGCCA 777 Query 929 TCCAACAATGGCATGGGTTATGGTGCTTATGGAAGTTACGGTGGAGCCAATCCTGGCTAT 988 ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||| Sbjct 778 TCCAACAATGGTATGGGCTATGGAGGTTATGGAAGTTATGGCGGAGCAAATCCGGGCTAT 837 Query 989 GGGGGTGTCAATCCTGGATATGGTGGTGCTGCAGGTGCTGC--CTT-TGGAAATCCAAAT 1045 ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||| Sbjct 838 GGGGGTGCCAATCCTGGCTATGGTGCTGCTGCAGTTGCTGCAGCCTATGGAAATCCAAAT 897 Query 1046 GT-GCCTGGTACCGGTTATGGTAGTGGTCAAGCTGGTGGACCAAGAAGCTCGTGGGGCTC 1104 | ||| || | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| Sbjct 898 GCAGCCA-GTGCTGGTTATGGAAGTGGTCCAGCGGGTGGACCAAGAAGCACATGGGGCTC 956 Query 1105 TCAGGTTTCTTCTGGATATGGTAATATGGGCTATGGTAATGTATCCTGGGGTGCTTCAAG 1164 ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| Sbjct 957 TCAGGGTCCTTCTGGGTATGGGAATATGGGCTATGGTAATGCCCCTTGGGGTGCTGCAAA 1016 Query 1165 TGCTGGTGGTGGAGGTGG-G--CCTGCTAACGGTGGATCTGCTGCTGGCCAGTCTCCAAC 1221 |||||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||| | | | | |||||||| Sbjct 1017 TGCTGGTGGTGGTGGTGGTGGACCTGCTAGTGGAGGATCTG--G-T--CAA-TCTCCAAC 1070 Query 1222 TGGAGCCACAGGATATGGAAATCAAGGTTATGGCTATGGTGGATATGGCGGAAATGATGG 1281 |||| || |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||| || ||||| || Sbjct 1071 TGGAACCGCAGGATATGGGAACCAAGGTTATGGTTATGGGGGTTATGCTGGTAATGA-GG 1129 Query 1282 GT-CTTATGGA 1291 || | |||||| Sbjct 1130 GTGCCTATGGA 1140 Score = 69.4 bits (37), Expect = 8e-11 Identities = 65/78 (83%), Gaps = 3/78 (4%) Strand=Plus/Plus Query 1288 TGGAGGTGGTGCATCGGGAGATATGCAATCAGGTG--GA-GGTTACATGGGCAGTGGCTA 1344 |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| Sbjct 1203 TGGAGGTGGTGCTGCAGGAGACATGCAATCAGGTGCTGGGGGTTACATGAACAGTGGCTA 1262 Query 1345 TGGCGATGCTAGTGGAAA 1362 || ||||| |||||||| Sbjct 1263 TGCTGATGCAAGTGGAAA 1280 >Solyc09g072790.3.1 Length=1185 Score = 69.4 bits (37), Expect = 8e-11 Identities = 97/125 (78%), Gaps = 7/125 (6%) Strand=Plus/Plus Query 302 AGAGGATTTGGGTTTGTTGTATTTGCAGATCCTAGTGTTATTGATAGGGTTCTTCA-G-G 359 |||||||| | ||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||| | | Sbjct 139 AGAGGATTCGCGTTTGTTGTCTTCTCCGATCCTTCTGTTATTGATGCCATTCTTCAGGAG 198 Query 360 ATACCCATGTAATTGATGGACGTACGGTTGAGGCTAAGAGGGCCTTGTCCAGAGAGGAAC 419 | || || | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||| | | Sbjct 199 AAACACA-CT-ATTGATGGCCGTCCGGTTGAAGCTAAGAGGGCTTTA-CCA-AGAGCA-C 253 Query 420 AACAG 424 ||||| Sbjct 254 AACAG 258 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 60882164175 Database: Tomato Genome CDS (ITAG release 4.0) Posted date: Mar 21, 2024 4:17 PM Number of letters in database: 34,993,605 Number of sequences in database: 34,075 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5