BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Capsicum annuum zunla Genome CDS (v2.0) 35,336 sequences; 36,029,754 total letters Query= Untitled_sequence Length=1760 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Capana01g003145OBG_HERA2 GTPase obg OS=Herpetosiphon aurantiacus ... 2169 0.0 >Capana01g003145 OBG_HERA2 GTPase obg OS=Herpetosiphon aurantiacus (strain ATCC 23779 / DSM 785) GN=obg PE=3 SV=1 Length=2049 Score = 2169 bits (1174), Expect = 0.0 Identities = 1174/1174 (100%), Gaps = 0/1174 (0%) Strand=Plus/Plus Query 17 ATGGCTTTCTCTTTGTTCCCAACTACATCAAGCACCTTCTCTCCTCTCTGCCAAGCTCGA 76 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGCTTTCTCTTTGTTCCCAACTACATCAAGCACCTTCTCTCCTCTCTGCCAAGCTCGA 60 Query 77 CCCAATACAAGTTGCAATAGAACCAACCCAAAGCGCGTGTATACAAATACAAACCGAAAA 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CCCAATACAAGTTGCAATAGAACCAACCCAAAGCGCGTGTATACAAATACAAACCGAAAA 120 Query 137 AAGCAAAACCCCAGTCGCCGTCAACTCAAATCCGGCGAGTTTAGGCCACCACCGCCTGTT 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AAGCAAAACCCCAGTCGCCGTCAACTCAAATCCGGCGAGTTTAGGCCACCACCGCCTGTT 180 Query 197 ACCACCGGCGCCGGTGAAACTGCCACCACCTACACTCGTCTACCCCCTAAAGACGACTTT 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ACCACCGGCGCCGGTGAAACTGCCACCACCTACACTCGTCTACCCCCTAAAGACGACTTT 240 Query 257 TTTCTTCCGTCTCTTCAAGATTCAACTGAAATAACCCTCTCTCAGTTAATCATTCCAACC 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TTTCTTCCGTCTCTTCAAGATTCAACTGAAATAACCCTCTCTCAGTTAATCATTCCAACC 300 Query 317 CCAGCTAAGAAGAATATTAAACGAGAATTCGACTCGTTGGATGATGAGAATGTAGAGAAC 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CCAGCTAAGAAGAATATTAAACGAGAATTCGACTCGTTGGATGATGAGAATGTAGAGAAC 360 Query 377 TTAAGGTTTGATTATGGAAAATTCGAGTTATACGAGGTTAGTGATGATGATGATTTTGAT 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTAAGGTTTGATTATGGAAAATTCGAGTTATACGAGGTTAGTGATGATGATGATTTTGAT 420 Query 437 GAAAATGATGATGATGTGGATGGTGAAATGGAAGGTACTGGAAGTGATGGAAAATTCGAG 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GAAAATGATGATGATGTGGATGGTGAAATGGAAGGTACTGGAAGTGATGGAAAATTCGAG 480 Query 497 CTGTACGAGGTTAACGATGACTTTGAGGATGATTTTGATGAAGATGATGACGTGGGGAAT 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CTGTACGAGGTTAACGATGACTTTGAGGATGATTTTGATGAAGATGATGACGTGGGGAAT 540 Query 557 GAAATGGAAAGGATATTTGAGGGTGGCGATGTGTTTGAAGGGGAAGGGAGTGATATAAAG 616 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GAAATGGAAAGGATATTTGAGGGTGGCGATGTGTTTGAAGGGGAAGGGAGTGATATAAAG 600 Query 617 GAGAAGGAGAAAGGGGTTCCAGCAGTAATGAGGTGTTTCGATAGGGCAAAAATATATGTA 676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GAGAAGGAGAAAGGGGTTCCAGCAGTAATGAGGTGTTTCGATAGGGCAAAAATATATGTA 660 Query 677 AAAGCGGGGGATGGAGGGAATGGGGTGGTGGCATTTAGGAGGGAGAAGTTTGTGCCTTTG 736 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AAAGCGGGGGATGGAGGGAATGGGGTGGTGGCATTTAGGAGGGAGAAGTTTGTGCCTTTG 720 Query 737 GGTGGGCCATCTGGTGGTGATGGAGGTAGAGGAGGGAATGTGTATGTGGAGGTAGATGGG 796 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GGTGGGCCATCTGGTGGTGATGGAGGTAGAGGAGGGAATGTGTATGTGGAGGTAGATGGG 780 Query 797 TCGATGAATTCATTGTTGCCATTTAGGCAGAGTGTGCATATTAAAGCTGGGAGAGGAGGG 856 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TCGATGAATTCATTGTTGCCATTTAGGCAGAGTGTGCATATTAAAGCTGGGAGAGGAGGG 840 Query 857 CATGGTCATGGAAAGAAGCAATTTGGGGCAAAAGGCGAGGATGTAGTGGTAAAGGTGCCA 916 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CATGGTCATGGAAAGAAGCAATTTGGGGCAAAAGGCGAGGATGTAGTGGTAAAGGTGCCA 900 Query 917 CCAGGTACTGTCATTAGGGAGTCTGGGGATGGTGGAATTCAAGGGAACGTACTTCTCGAG 976 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CCAGGTACTGTCATTAGGGAGTCTGGGGATGGTGGAATTCAAGGGAACGTACTTCTCGAG 960 Query 977 TTGTTGCATCCAGGACAGAAGGCATTGCTGTTGCCTGGTGGAAAAGGTGGGAGAGGGAAT 1036 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 TTGTTGCATCCAGGACAGAAGGCATTGCTGTTGCCTGGTGGAAAAGGTGGGAGAGGGAAT 1020 Query 1037 GCCTCTTTTAAGACAGGGTTGAATAGGGTGCCCAAGATCGCGGAGAATGGAGAAGAAGGA 1096 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 GCCTCTTTTAAGACAGGGTTGAATAGGGTGCCCAAGATCGCGGAGAATGGAGAAGAAGGA 1080 Query 1097 CCAGAGATGTGGTTAGACTTGGAGCTTAAGTTGGTTGCTGATGTTGGTATAGTCGGAGCG 1156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 CCAGAGATGTGGTTAGACTTGGAGCTTAAGTTGGTTGCTGATGTTGGTATAGTCGGAGCG 1140 Query 1157 CCAAATGCAGGGAAAAGTACATTTCTCAGTGTTG 1190 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 CCAAATGCAGGGAAAAGTACATTTCTCAGTGTTG 1174 Score = 950 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 514/514 (100%), Gaps = 0/514 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1190 GGGCACACCGAGGTTTTGGTTTAGGCCATGAGTTTCTTCGGCACTCAGAAAGATGTTCCG 1249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1298 GGGCACACCGAGGTTTTGGTTTAGGCCATGAGTTTCTTCGGCACTCAGAAAGATGTTCCG 1357 Query 1250 TCCTGGTGCATGTTGTTGATGGTTCATCTCCACAACCGGAATATGAATTTGAAGCTGTTC 1309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1358 TCCTGGTGCATGTTGTTGATGGTTCATCTCCACAACCGGAATATGAATTTGAAGCTGTTC 1417 Query 1310 GTCTTGAATTGGAAATGTTTAGTCCCAAACTTGCTGAAAAGCCTTATTTAGTGGCTTACA 1369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1418 GTCTTGAATTGGAAATGTTTAGTCCCAAACTTGCTGAAAAGCCTTATTTAGTGGCTTACA 1477 Query 1370 ACAAAATGGACATTCCAGACGCATATGAGAATTGGAAGACATTCAGGGACAGTCTGAGAT 1429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1478 ACAAAATGGACATTCCAGACGCATATGAGAATTGGAAGACATTCAGGGACAGTCTGAGAT 1537 Query 1430 CTCATGGAATTGAACCCTTTTGCATGAGTGCAGTGAAAAGAGAGGGTACACATGAAGTAA 1489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1538 CTCATGGAATTGAACCCTTTTGCATGAGTGCAGTGAAAAGAGAGGGTACACATGAAGTAA 1597 Query 1490 TTTGTGCTGCTTATGAGCTTGTTTGTAGAGGAAGAGAAGCTGCTAAAGAAGAAGTGAGAA 1549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1598 TTTGTGCTGCTTATGAGCTTGTTTGTAGAGGAAGAGAAGCTGCTAAAGAAGAAGTGAGAA 1657 Query 1550 CGGATCCAGTAAACTTGAACTATGTTGCTGACATGGTGAAAAAGCAGCGAAATGCACCCA 1609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1658 CGGATCCAGTAAACTTGAACTATGTTGCTGACATGGTGAAAAAGCAGCGAAATGCACCCA 1717 Query 1610 TAAACGAGTTTGAAATCTCCCATGGTAGTTCTTCCAAAACTTGGTATGTTCAAGGATCAG 1669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1718 TAAACGAGTTTGAAATCTCCCATGGTAGTTCTTCCAAAACTTGGTATGTTCAAGGATCAG 1777 Query 1670 GCCTGGAACGTTTTGTCCAAATGACAAACTGGAG 1703 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1778 GCCTGGAACGTTTTGTCCAAATGACAAACTGGAG 1811 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 60882505212 Database: Capsicum annuum zunla Genome CDS (v2.0) Posted date: Mar 21, 2024 3:56 PM Number of letters in database: 36,029,754 Number of sequences in database: 35,336 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5