BLASTN 2.11.0+


Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb
Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J
Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14.



Database: Tomato Genome cDNA (ITAG release 2.40)
           34,725 sequences; 41,981,568 total letters



Query= Solyc02g077390.1.1

Length=1077
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

Solyc02g077390.1compound inflorescence s                              1989    0.0  


>Solyc02g077390.1 compound inflorescence s
Length=1077

 Score = 1989 bits (1077),  Expect = 0.0
 Identities = 1077/1077 (100%), Gaps = 0/1077 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGGCTTCATCAAATAGACACTGGCCTAGTATGTTTAAATCCAAACCTTGCAATTCTCAT  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGGCTTCATCAAATAGACACTGGCCTAGTATGTTTAAATCCAAACCTTGCAATTCTCAT  60

Query  61    CATCACCAATGGCAACATGACATCAACTCTTCTATCATTCAACAAAGACCTCCATGCAAT  120
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    CATCACCAATGGCAACATGACATCAACTCTTCTATCATTCAACAAAGACCTCCATGCAAT  120

Query  121   CCAGAAGAGCGAAGTCCAGAGCCAAAGCCTCGATGGAATCCAAGACCTGAGCAAATTCGT  180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   CCAGAAGAGCGAAGTCCAGAGCCAAAGCCTCGATGGAATCCAAGACCTGAGCAAATTCGT  180

Query  181   ATACTTGAAGCAATCTTTAATTCAGGCATGGTGAATCCACCAAGGGATGAGATAAGGAAA  240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   ATACTTGAAGCAATCTTTAATTCAGGCATGGTGAATCCACCAAGGGATGAGATAAGGAAA  240

Query  241   ATCCGAGCTAAACTTCAAGAATATGGTCAAGTAGGTGATGCTAATGTGTTTTACTGGTTT  300
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   ATCCGAGCTAAACTTCAAGAATATGGTCAAGTAGGTGATGCTAATGTGTTTTACTGGTTT  300

Query  301   CAAAACAGGAAATCAAGAAGTAAACACAAACAACGTCATTTACAAGCTAAAGCTCAACAA  360
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   CAAAACAGGAAATCAAGAAGTAAACACAAACAACGTCATTTACAAGCTAAAGCTCAACAA  360

Query  361   CAACACCATAATAATAACAATAATTCATCTCATCAACCTATTATTACTTCATCTTCATCA  420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   CAACACCATAATAATAACAATAATTCATCTCATCAACCTATTATTACTTCATCTTCATCA  420

Query  421   TCTTCTGATAAATCTTCACCAAATTCATTGACTTTCTCAATTGGTACCTCCAATGTTATG  480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   TCTTCTGATAAATCTTCACCAAATTCATTGACTTTCTCAATTGGTACCTCCAATGTTATG  480

Query  481   GACTTGCTCAATTCTCCTACTTCTTCGGTGAACCAACAAAACTATAACGAGTTCCTGTCT  540
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   GACTTGCTCAATTCTCCTACTTCTTCGGTGAACCAACAAAACTATAACGAGTTCCTGTCT  540

Query  541   AACGAGCAGCCTTTCTTTTTCACTGTACAACCACCACCAGTAGTACCAACTCATGATCAC  600
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   AACGAGCAGCCTTTCTTTTTCACTGTACAACCACCACCAGTAGTACCAACTCATGATCAC  600

Query  601   TCCGCAGGGTTTTGCTTCCAGGATTCATCTACTTTTACTCCTCATTCTTCTTCTTCTGGA  660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   TCCGCAGGGTTTTGCTTCCAGGATTCATCTACTTTTACTCCTCATTCTTCTTCTTCTGGA  660

Query  661   CTTCTTCTTAATGAATGGATGGGGGGGATAAGTACTCAAGCACCTAATAATTCAAAGAAA  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661   CTTCTTCTTAATGAATGGATGGGGGGGATAAGTACTCAAGCACCTAATAATTCAAAGAAA  720

Query  721   GATGAAAATGACAAAATCAATTTGCAGTCACAGCTCATGAGTTATACAGTTACTTCAACT  780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   GATGAAAATGACAAAATCAATTTGCAGTCACAGCTCATGAGTTATACAGTTACTTCAACT  780

Query  781   GTTTCTCCTCTTGCTACTACCACTATTCCCACCATTAGTCACATTCAAGGGGTTACTGTG  840
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   GTTTCTCCTCTTGCTACTACCACTATTCCCACCATTAGTCACATTCAAGGGGTTACTGTG  840

Query  841   GATCCTAATGATGCGGGTCCCACAAGATCGACAGTGTTTATCAACGACGTTGCTTTTGAG  900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   GATCCTAATGATGCGGGTCCCACAAGATCGACAGTGTTTATCAACGACGTTGCTTTTGAG  900

Query  901   GTTGGGATAGGACCGTTTAACGTGAGGGAAGTGTTCGGTGAAGATGCGGTGCTTATACAT  960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   GTTGGGATAGGACCGTTTAACGTGAGGGAAGTGTTCGGTGAAGATGCGGTGCTTATACAT  960

Query  961   TCATCTGGTGAACCACTTATTACTAATGAATGGGGTATCACAATTCAGCCACTACAGCAT  1020
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   TCATCTGGTGAACCACTTATTACTAATGAATGGGGTATCACAATTCAGCCACTACAGCAT  1020

Query  1021  GGTGCATTTTACTACTTGCTTCGCACGTCAAGTATTGCATCGACTCATCATATATAA  1077
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1021  GGTGCATTTTACTACTTGCTTCGCACGTCAAGTATTGCATCGACTCATCATATATAA  1077



Lambda      K        H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda      K        H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 43251342036


  Database: Tomato Genome cDNA (ITAG release 2.40)
    Posted date:  Mar 21, 2024  3:33 PM
  Number of letters in database: 41,981,568
  Number of sequences in database:  34,725



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5