BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Tomato Genome CDS (ITAG release 4.0) 34,075 sequences; 34,993,605 total letters Query= Untitled_sequence Length=1049 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Solyc10g049530.3.1 1618 0.0 Solyc12g039050.3.1 1367 0.0 Solyc04g150145.1.1 176 2e-43 >Solyc10g049530.3.1 Length=2196 Score = 1618 bits (876), Expect = 0.0 Identities = 904/918 (98%), Gaps = 0/918 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CTAATGCTAAGTGGGATAATGATGCTCATCTCAAATTTATAGAGTTACGTGAATTAGAGA 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 17 CTAATGCTAAGTGGGATAATGATGCTCATCTCAAATTTATAGAGTTATGTGAATTAGAGA 76 Query 61 TTAGGAAATGAAATAGACCAAACACTCATTTATCTAAAGATGGATGGAAAAATACGATTA 120 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 77 TTAGGAAAGGAAATAGACCAAACACTCATTTATCTAAAGATGGATGGAAAAATACGATTA 136 Query 121 AAGCATTCTATGAAAAAACGGGAAGACGTTATACAAAAATACAAATGAAAAATCATTGGG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 137 AAGCATTCTATGAAAAAACGGGAAGACGTTATACAAAACTACAAATGAAAAATCATTGGG 196 Query 181 ATGGCATGAAAGCTGAGTGGACTCTTTTTAAGCAATTGATGAGAGGAGATACAGGTATAG 240 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 197 ATGGCATGAAAGCTGAGTGGACTTTTTTTAAGCAATTGATGAGAGGATATACAGGTATAG 256 Query 241 GATGGGATGCCACTAAAAATACAATTATGGCAGATGATGATTGGTGGAAGCGAAAAATTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 257 GATGGGATGCCACTAAAAATACAATTATGGCAGATGATGATTGGTGGAAGCGAAAAATTA 316 Query 301 AGGAGGATGTTCGATATAGAAAATTTAGGAATAAGGATCTTTCACTGATATGGTTTCGCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 317 AGGAGGATGTTCGATATAGAAAATTTAGGAATAAGGATCTTTTACTGATATGGTTTCGCT 376 Query 361 ATGATGCATTATTTTCAGATATTGTTGCTACGGGGGGAAGAGCACGTGCCTCAAATCAAT 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 377 ATGATGCATTATTTTCTGATATTGTTGCTACGGGGGAAAGAGCACGTGCCTCAAATCAAT 436 Query 421 CCCAATTTTTTGAAAGTGAGGTAGATTGTGACGAAGAAAGACAAAATGGTATTGATAATG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 437 CCCAATTTTTTGAAAGTGAGGTAGATTGTGACGAAGAAAGACAAAATGGTATTGATAATG 496 Query 481 ATGATATGGAGCACTTCATTAATACTAATAATGAAGGGGGTGATGAAAGTGATGATCCAG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 497 ATGATATGGAGCACTTCATTAATACTAATAATGAAGGGGGTGATGAAAGTGATGATCCAG 556 Query 541 AAGAGATGAATTCTTCTATGTTTCCTAAACAATCAGTAAAAAGACCAAATTCAACTGATG 600 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 557 AAGAGATGAATTCTTCTATGTTTCCTAAACCATCAATAAAAAGACCAAATTCAACTGATG 616 Query 601 GTATTGGAACTAGTAATCAAGTGGAAAAAAGTAAGACAAAATCTACAGCTGCATCAATGA 660 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 617 GTATTGGAACTAGTAATCAAGTGAAAAAAAGTAAGACAAAATCTACAGCTGCATCAATGA 676 Query 661 AAGAAGATATGCAATCTTTACTAGAGTTAATGTCTAACAAAAGTACTGCTACATCTCATG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 677 AAGAAGATATGCAATCTTTACTAGAGTTAATGTCTAACAAAAGTACTGCTACATCTCATG 736 Query 721 CGGTAGATGATCCCACCATTGACAAGTGTATGGATTTTTTGGCAAATATTCCCAATATTT 780 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 737 AGGTAGATGATCCCACCATTGATAAGTGTATGGATTTTTTGGCAAATATTCCCAATATTT 796 Query 781 TTGAAAGGGGTGAAATGTACAACTACTTTGTGAACATGTTTCTTAAAAAAGACATTCGAC 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 797 TTGAAAGGGGTGAAATGTACAACTACTTTGTGAACATGTTTCTTAAAAAAGACATTCGAC 856 Query 841 AAGTGTTTCTTAAGATGCCTACGGATGAAGTTCGAAAGTCTTGGATGGAGTATAACTATG 900 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 857 AAGTGTTTCGTAAGATGCCTACGGATGAAGTTCGAAAGTCTTGGATGGAGTATAACTATG 916 Query 901 AGTTATACCTTAAGAAAG 918 |||||||||||||||||| Sbjct 917 AGTTATACCTTAAGAAAG 934 >Solyc12g039050.3.1 Length=801 Score = 1367 bits (740), Expect = 0.0 Identities = 768/782 (98%), Gaps = 0/782 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CTAATGCTAAGTGGGATAATGATGCTCATCTCAAATTTATAGAGTTACGTGAATTAGAGA 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 17 CTAATGCTAAGTGGGATAATGATGCTCATCTCAAATTTATAGAGTTATGTGAATTAGAGA 76 Query 61 TTAGGAAATGAAATAGACCAAACACTCATTTATCTAAAGATGGATGGAAAAATACGATTA 120 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 77 TTAGGAAAGGAAATAGACCAAACACTCATTTATCTAAAGATGGATGGAAAAATACGATTA 136 Query 121 AAGCATTCTATGAAAAAACGGGAAGACGTTATACAAAAATACAAATGAAAAATCATTGGG 180 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 137 AAGCATTCAATGAAAAAACGGGAAGACGTTATACAAAAATACAAATGAAAAATCGTTGGG 196 Query 181 ATGGCATGAAAGCTGAGTGGACTCTTTTTAAGCAATTGATGAGAGGAGATACAGGTATAG 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 197 ATGGCATGAAAGCTGAGTGGACTCTTTTTAAGCAATTGACGAGAGGAGATACAGGTATAG 256 Query 241 GATGGGATGCCACTAAAAATACAATTATGGCAGATGATGATTGGTGGAAGCGAAAAATTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 257 GATGGGATGCCACTAAAAATACAATTATGGCAGATGATGATTGGTGGAAGCGAAAAATTA 316 Query 301 AGGAGGATGTTCGATATAGAAAATTTAGGAATAAGGATCTTTCACTGATATGGTTTCGCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 317 AGGAGGATGTTCGATATAGAAAATTTAGGAATAAGGATCTTTCACTGATATGGTTTCGCT 376 Query 361 ATGATGCATTATTTTCAGATATTGTTGCTACGGGGGGAAGAGCACGTGCCTCAAATCAAT 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 377 ATGATGCATTATTTTCTGATATTGTTGCTACGGGGGAAAGAGCACATGCCTCAAATCAAT 436 Query 421 CCCAATTTTTTGAAAGTGAGGTAGATTGTGACGAAGAAAGACAAAATGGTATTGATAATG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 437 CCCAATTTTTTGAAAGTGAGGTAGATTGTGACGAAGAAAGACAAAATGGTATTGATAATG 496 Query 481 ATGATATGGAGCACTTCATTAATACTAATAATGAAGGGGGTGATGAAAGTGATGATCCAG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 497 ATGATATGGAGCACTTCATTAATACTAATAATGAAGGGGGTGATGAAAGTGATGATCCAG 556 Query 541 AAGAGATGAATTCTTCTATGTTTCCTAAACAATCAGTAAAAAGACCAAATTCAACTGATG 600 |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 557 AAGAGAGGAATTCTTCTATGATTCCTAAACCATCAATAAAAAGACCAAATTCAACTGATG 616 Query 601 GTATTGGAACTAGTAATCAAGTGGAAAAAAGTAAGACAAAATCTACAGCTGCATCAATGA 660 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 617 GTATTGGAACTAGTAATCAAGTGAAAAAAAGTAAGACAAAATCTACAGCTGCATCAATGA 676 Query 661 AAGAAGATATGCAATCTTTACTAGAGTTAATGTCTAACAAAAGTACTGCTACATCTCATG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 677 AAGAAGATATGCAATCTTTACTAGAGTTAATGTCTAACAAAAGTACTGCTACATCTCATG 736 Query 721 CGGTAGATGATCCCACCATTGACAAGTGTATGGATTTTTTGGCAAATATTCCCAATATTT 780 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 737 CGGTAGATGATCCCACCATTGATAAGTGTATGGATTTTTTGGCAAATATTCCCAATATTT 796 Query 781 TT 782 || Sbjct 797 TT 798 >Solyc04g150145.1.1 Length=306 Score = 176 bits (95), Expect = 2e-43 Identities = 108/114 (95%), Gaps = 1/114 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 CTAATGCTAAGTGGGATAATGATGCTCATCTCAAATTTATAGAGTTACGTGAATTAGAGA 60 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct 191 CTAATGCTAAGTGGGGTAATGATGCTCATCTCAAATTTATAGACTTATGTGAATTAGAGA 250 Query 61 TTAGGAAATGAAATAGACCAAACACTCATTTATCTAAAGATGGATGGAAAAATA 114 ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 251 TTAGG-AAGGAAATAAACCAAACACTCATTTATCTAAAGATGGATGGAAAAATA 303 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 34961131520 Database: Tomato Genome CDS (ITAG release 4.0) Posted date: Mar 21, 2024 4:17 PM Number of letters in database: 34,993,605 Number of sequences in database: 34,075 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5