BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Tomato Genome cDNA (ITAG release 4.0) 34,075 sequences; 44,419,890 total letters Query= Solyc07g005650.2.1 Length=1804 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Solyc07g005650.4.1 3326 0.0 >Solyc07g005650.4.1 Length=1830 Score = 3326 bits (1801), Expect = 0.0 Identities = 1804/1805 (99%), Gaps = 1/1805 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CATTTTTTTCACAAAAACACTCACTGTGTGTTCATCGGAATCCGCCATGGATGACGAAAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 26 CATTTTTTTCACAAAAACACTCACTGTGTGTTCATCGGAATCCGCCATGGATGACGAAAA 85 Query 61 CGAGAGCTCCAAATCAGCCGGACTCAAAAATTCAAATCTAGAAGAAGAAGAAGAAGATAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 86 CGAGAGCTCCAAATCAGCCGGACTCAAAAATTCAAATCTAGAAGAAGAAGAAGAAGATAA 145 Query 121 AATCAGCAACAAAATCGAAAATTCCTCCGTACACAACGACGAAAACGGTGACGACGATAG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 146 AATCAGCAACAAAATCGAAAATTCCTCCGTACACAACGACGAAAACGGTGACGACGATAG 205 Query 181 AGTAATTGACGGTAGCAGTGGAGCTGAGAGTTTACGAGAATCAAAGACGGGAGCTTTAAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 206 AGTAATTGACGGTAGCAGTGGAGCTGAGAGTTTACGAGAATCAAAGACGGGAGCTTTAAT 265 Query 241 TTCAGAAACCCTAGCTCATCCTAATGCAGAATCATCCGTACAAATTGAAATTGATGGCCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 266 TTCAGAAACCCTAGCTCATCCTAATGCAGAATCATCCGTACAAATTGAAATTGATGGCCA 325 Query 301 ATCCGAATTCGATTCAGAGTTTTCTCCCTCTTATCAACTTTCTGAAGTACCAGTGGAATA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 326 ATCCGAATTCGATTCAGAGTTTTCTCCCTCTTATCAACTTTCTGAAGTACCAGTGGAATA 385 Query 361 TGAACTGCCCTCGTTTGGTTTCTCGGAAAAAATCAAGGATAGAATTAGTGTTACCAAACC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 386 TGAACTGCCCTCGTTTGGTTTCTCGGAAAAAATCAAGGATAGAATTAGTGTTACCAAACC 445 Query 421 TGGAACTTTGAATGCTCAAGCACGAACAGAACATCAACGACGTGTTCCTGATGCAGCATC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 446 TGGAACTTTGAATGCTCAAGCACGAACAGAACATCAACGACGTGTTCCTGATGCAGCATC 505 Query 481 CTCATTGGAGCTGTCCTCTTTATCTGTTGCACAGTCCATTTCATCAGTGCCAAGTGCAAC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 506 CTCATTGGAGCTGTCCTCTTTATCTGTTGCACAGTCCATTTCATCAGTGCCAAGTGCAAC 565 Query 541 TCTAGCAGAAAGACGATCAGCAGCAGCAGTAAATTGTAGTACAGGAGAAGTGGTTAAGCA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 566 TCTAGCAGAAAGACGATCAGCAGCAGCAGTAAATTGTAGTACAGGAGAAGTGGTTAAGCA 625 Query 601 GAGTTCTGACGCCCAGGTTCTAGCTCTTGTACCAGTTCTAAAGAGACCAACTCGCGATGG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 626 GAGTTCTGACGCCCAGGTTCTAGCTCTTGTACCAGTTCTAAAGAGACCAACTCGCGATGG 685 Query 661 GTACAATTGGCGGAAGTATGGTCAAAAGCAAGTTAAAAGTCCTCAAGGTTCTCGAAGTTA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 686 GTACAATTGGCGGAAGTATGGTCAAAAGCAAGTTAAAAGTCCTCAAGGTTCTCGAAGTTA 745 Query 721 TTACCGATGCACTCATTCTGAGTGTTGTGCCAAGAAGATTGAGTGCTCTGATCACACTAA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 746 TTACCGATGCACTCATTCTGAGTGTTGTGCCAAGAAGATTGAGTGCTCTGATCACACTAA 805 Query 781 TCGTGTTATGGAGATTATTTATAGAACTCAACACAATCATGATCCACCCCCAAGAGTAAA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 806 TCGTGTTATGGAGATTATTTATAGAACTCAACACAATCATGATCCACCCCCAAGAGTAAA 865 Query 841 TTGCCCAAGGGAAAGCAAGTCTGCATTATTGTCTTCACCTACCAATGGCAAAAGTATAAT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 866 TTGCCCAAGGGAAAGCAAGTCTGCATTATTGTCTTCACCTACCAATGGCAAAAGTATAAT 925 Query 901 AGCTCATCCAAGGAGAAATTCTATTGAGACCGTAGTATCCCCCTTAAATGAAAATTTGCA 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 926 AGCTCATCCAAGGAGAAATTCTATTGAGACCGTAGTATCCCCCTTAAATGAAAATTTGCA 985 Query 961 AGAAAGTTTACCAATTGCTGAGACAGCAAATCAGGATTCAGGTGGGTCTGACACTGACAC 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 986 AGAAAGTTTACCAATTGCTGAGACAGCAAATCAGGATTCAGGTGGGTCTGACACTGACAC 1045 Query 1021 TGAAATCACTATTAGAGAGGAGCACCGTGACGAGGCTGGACAAAAGAAGAGGTCAAGGAA 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1046 TGAAATCACTATTAGAGAGGAGCACCGTGACGAGGCTGGACAAAAGAAGAGGTCAAGGAA 1105 Query 1081 AAGTGACACAAGTTGTTTGGAATCTGTTTCTAAACCTGGAAAGAAACCCAAGCTTGTGGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1106 AAGTGACACAAGTTGTTTGGAATCTGTTTCTAAACCTGGAAAGAAACCCAAGCTTGTGGT 1165 Query 1141 GCATGCTGCTTGTGATGTAGGAATCTCAAGTGATGGCTACAGATGGCGAAAGTATGGACA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1166 GCATGCTGCTTGTGATGTAGGAATCTCAAGTGATGGCTACAGATGGCGAAAGTATGGACA 1225 Query 1201 AAAAATAGTGAAGGGAAATCCCCATCCAAGGAACTACTATCGCTGTACATCAGCTGGATG 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1226 AAAAATAGTGAAGGGAAATCCCCATCCAAGGAACTACTATCGCTGTACATCAGCTGGATG 1285 Query 1261 TCCCGTTCGAAAGCACATTGAGAGGGTTTTAGATACCACAAGTGCTTTAACAATAACATA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1286 TCCCGTTCGAAAGCACATTGAGAGGGTTTTAGATACCACAAGTGCTTTAACAATAACATA 1345 Query 1321 CAAGGGAGTACACGATCATGACATGCCAGTACCCAAAAAACGTCATGGTCCACCGAGTGC 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1346 CAAGGGAGTACACGATCATGACATGCCAGTACCCAAAAAACGTCATGGTCCACCGAGTGC 1405 Query 1381 ACCTCTTATTGCTGCTACTGCCCCTGCTTCCGTAACCACTATGCATGCTAACAAACCCGA 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1406 ACCTCTTATTGCTGCTACTGCCCCTGCTTCCGTAACCACTATGCATGCTAACAAACCCGA 1465 Query 1441 ACCCCTACAACATCAAAAATCGACCACACAATGGTCCGTGGACAAAGAAGGTGAGTTGAC 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1466 ACCCCTACAACATCAAAAATCGACCACACAATGGTCCGTGGACAAAGAAGGTGAGTTGAC 1525 Query 1501 TGGTGAGAAATTGGATGTTGGAGGAGAAAAAGCAATGGAATCGGCTCGAACTCTATTGAG 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1526 TGGTGAGAAATTGGATGTTGGAGGAGAAAAAGCAATGGAATCGGCTCGAACTCTATTGAG 1585 Query 1561 TATTGGATTTGAAATTAAGCCTTGCTAAAATTGCTTAGCTGCTCTGATTTTATTTTTTTC 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1586 TATTGGATTTGAAATTAAGCCTTGCTAAAATTGCTTAGCTGCTCTGATTTTATTTTTTTC 1645 Query 1621 TGCATTTATTTAGTTTTCCTCCATAGGGCTTTCTTGTAGAAGTTTAGAAGAGTACACC-T 1679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1646 TGCATTTATTTAGTTTTCCTCCATAGGGCTTTCTTGTAGAAGTTTAGAAGAGTACACCTT 1705 Query 1680 TTTTTTTTATAGTCCTCCAATATATAGATGGTCTATACTCAGTTATGTACATTATTGTGG 1739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1706 TTTTTTTTATAGTCCTCCAATATATAGATGGTCTATACTCAGTTATGTACATTATTGTGG 1765 Query 1740 ATCAAAATAAGTAACATAGAACTTAGAATAACATATTGTGATGTTTGTCAATTTGCATCT 1799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1766 ATCAAAATAAGTAACATAGAACTTAGAATAACATATTGTGATGTTTGTCAATTTGCATCT 1825 Query 1800 GTTTC 1804 ||||| Sbjct 1826 GTTTC 1830 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 77403345320 Database: Tomato Genome cDNA (ITAG release 4.0) Posted date: Mar 21, 2024 4:18 PM Number of letters in database: 44,419,890 Number of sequences in database: 34,075 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5