BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Tomato Genome CDS (ITAG release 4.0) 34,075 sequences; 34,993,605 total letters Query= Untitled_sequence Length=1806 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Solyc11g069090.2.1 3336 0.0 Solyc06g074940.4.1 1781 0.0 >Solyc11g069090.2.1 Length=1806 Score = 3336 bits (1806), Expect = 0.0 Identities = 1806/1806 (100%), Gaps = 0/1806 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGTGTCGGATGCGGCGAAGAAGAGAGATGCGCAGAAGAAGGCGGCGGCAGCTGCTAGG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGTGTCGGATGCGGCGAAGAAGAGAGATGCGCAGAAGAAGGCGGCGGCAGCTGCTAGG 60 Query 61 AGAGGAGGTAAAGGTGCGGCAGCGCCTAAATCGGCTGCAACCGCGTCTAAATCGGCGGTG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AGAGGAGGTAAAGGTGCGGCAGCGCCTAAATCGGCTGCAACCGCGTCTAAATCGGCGGTG 120 Query 121 GAAAGTAACGGGGTTGATAATTTGACGAATGGAGTAGGGGATCTACAGATATCTGATCGG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GAAAGTAACGGGGTTGATAATTTGACGAATGGAGTAGGGGATCTACAGATATCTGATCGG 180 Query 181 ACTTGTACGGGTGTTTTGTGTTCACATCCGCTATCGAGGGATATTCGGATAGAGTCATTA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ACTTGTACGGGTGTTTTGTGTTCACATCCGCTATCGAGGGATATTCGGATAGAGTCATTA 240 Query 241 TCAGTCACTTTCCACGGACATGATCTCATCGTTGATTCTGAACTGGAGCTCAACTATGGC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TCAGTCACTTTCCACGGACATGATCTCATCGTTGATTCTGAACTGGAGCTCAACTATGGC 300 Query 301 AGACGTTATGGTTTGTTGGGATTGAATGGCTGCGGGAAGTCTACTCTTCTTACTGCTATA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AGACGTTATGGTTTGTTGGGATTGAATGGCTGCGGGAAGTCTACTCTTCTTACTGCTATA 360 Query 361 GGGTTGAGGGAACTTCCCATCCCAGACCACATGGATATTTTTCATCTTTCTCGGGAGATT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GGGTTGAGGGAACTTCCCATCCCAGACCACATGGATATTTTTCATCTTTCTCGGGAGATT 420 Query 421 GAAGCCTCTGACATGACCTCTCTCGAGGCTGTCATTAATTGTGATGAAGAGAGGTTGCAA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GAAGCCTCTGACATGACCTCTCTCGAGGCTGTCATTAATTGTGATGAAGAGAGGTTGCAA 480 Query 481 TTGGAGAAAGAAGCTGAAGCTTTGGCTGGACAGGACGATGGTGGTGGAGAGCAACTTGAA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TTGGAGAAAGAAGCTGAAGCTTTGGCTGGACAGGACGATGGTGGTGGAGAGCAACTTGAA 540 Query 541 CGGATCTATGAGCGTTTAGAAGCTATGGATGCTGCCACTGCTGAGAAACGTGCTGCTGAA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CGGATCTATGAGCGTTTAGAAGCTATGGATGCTGCCACTGCTGAGAAACGTGCTGCTGAA 600 Query 601 ATCTTGTTTGGGCTTGGATTTGATAAGAAAATGCAAGCAAAGAAAACACGTGATTTTTCC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 ATCTTGTTTGGGCTTGGATTTGATAAGAAAATGCAAGCAAAGAAAACACGTGATTTTTCC 660 Query 661 GGTGGCTGGAGGATGAGGATTGCTCTTGCCCGTGCCCTCTTTATGAATCCAACAATTTTG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GGTGGCTGGAGGATGAGGATTGCTCTTGCCCGTGCCCTCTTTATGAATCCAACAATTTTG 720 Query 721 TTGCTTGATGAGCCAACAAACCATCTTGACCTAGAGGCCTGTGTGTGGTTAGAAGAATCC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TTGCTTGATGAGCCAACAAACCATCTTGACCTAGAGGCCTGTGTGTGGTTAGAAGAATCC 780 Query 781 TTGAAGAACTTTGAGCGCATTCTGGTTGTCATTTCACACTCACAGGATTTTCTCAATGGT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TTGAAGAACTTTGAGCGCATTCTGGTTGTCATTTCACACTCACAGGATTTTCTCAATGGT 840 Query 841 GTGTGTACCAATATCATCCACATGCAAAACAAGAAGTTAAAACTCTATACAGGTAACTAC 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 GTGTGTACCAATATCATCCACATGCAAAACAAGAAGTTAAAACTCTATACAGGTAACTAC 900 Query 901 GACCAATATGTGCAAACCCGTTCAGAGCTGGAAGAAAACCAGATGAAACAGTACAAGTGG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 GACCAATATGTGCAAACCCGTTCAGAGCTGGAAGAAAACCAGATGAAACAGTACAAGTGG 960 Query 961 GAGCAGGAGCAGATTTCTGCAATGAAGGAATACATTGCTCGCTTTGGGCACGGTTCAGCT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GAGCAGGAGCAGATTTCTGCAATGAAGGAATACATTGCTCGCTTTGGGCACGGTTCAGCT 1020 Query 1021 AAACTAGCCCGTCAAGCACAGAGTAAAGAGAAGACATTGGCTAAGATGGAGCGTGGTGGG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 AAACTAGCCCGTCAAGCACAGAGTAAAGAGAAGACATTGGCTAAGATGGAGCGTGGTGGG 1080 Query 1081 CTTACTGAGAAGGTGGGGAGGGACAGTGTCCTGGTTTTCCGGTTTACTGATGTCGGCAAA 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 CTTACTGAGAAGGTGGGGAGGGACAGTGTCCTGGTTTTCCGGTTTACTGATGTCGGCAAA 1140 Query 1141 CTTCCTCCTCCAGTTCTACAGTTTTCAGAAGTTGCTTTTGGCTACACACCTGATAACCTC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 CTTCCTCCTCCAGTTCTACAGTTTTCAGAAGTTGCTTTTGGCTACACACCTGATAACCTC 1200 Query 1201 ATCTACAAGAACCTTGATTTTGGTGTAGATCTCGACTCCAGGATAGCACTTGTGGGGCCT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 ATCTACAAGAACCTTGATTTTGGTGTAGATCTCGACTCCAGGATAGCACTTGTGGGGCCT 1260 Query 1261 AATGGAGCTGGAAAGAGCACACTGCTTAAGCTGATGATAGGGGATTTATTTCCCACTGAT 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 AATGGAGCTGGAAAGAGCACACTGCTTAAGCTGATGATAGGGGATTTATTTCCCACTGAT 1320 Query 1321 GGCATGGTTAAGCGGCATAATCACCTAAAAATTGCGCAGTACCACCAGCACTTGGCTGAG 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 GGCATGGTTAAGCGGCATAATCACCTAAAAATTGCGCAGTACCACCAGCACTTGGCTGAG 1380 Query 1381 AAGCTAGACATGGAGGTGTCAGCTCTTTTGTTTATGATGAGAGAGTACCCTGGGAACGAG 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 AAGCTAGACATGGAGGTGTCAGCTCTTTTGTTTATGATGAGAGAGTACCCTGGGAACGAG 1440 Query 1441 GAGGAGAAGATGAGGGCAGCAATTGGGAGGTTTGGACTCACAGGTAAAGCTCAAGTAATG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 GAGGAGAAGATGAGGGCAGCAATTGGGAGGTTTGGACTCACAGGTAAAGCTCAAGTAATG 1500 Query 1501 GCAATGAAGAACTTGTCAGATGGTCAACGTAGTCGAGTGATTTTTGCATGGTTGGCTTTT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 GCAATGAAGAACTTGTCAGATGGTCAACGTAGTCGAGTGATTTTTGCATGGTTGGCTTTT 1560 Query 1561 AGGCAACCCCACATGCTGCTGTTGGATGAGCCAACCAACCATCTTGATATTGAAACCATT 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 AGGCAACCCCACATGCTGCTGTTGGATGAGCCAACCAACCATCTTGATATTGAAACCATT 1620 Query 1621 GACTCACTTGCAGAGGCCTTGAACGCATGGGATGGTGGGATGGTTCTAGTGAGTCACGAC 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 GACTCACTTGCAGAGGCCTTGAACGCATGGGATGGTGGGATGGTTCTAGTGAGTCACGAC 1680 Query 1681 TTTAGGCTCATAAACCAGGTGGCCCATGAGATATGGGTATGTGAAAATCAGGCTGTGACA 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 TTTAGGCTCATAAACCAGGTGGCCCATGAGATATGGGTATGTGAAAATCAGGCTGTGACA 1740 Query 1741 CGATGGGAGGGTGGCATCATGGATTTCAAGAAACACTTGAAGAAAAGGGCTGGATTGGGT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 CGATGGGAGGGTGGCATCATGGATTTCAAGAAACACTTGAAGAAAAGGGCTGGATTGGGT 1800 Query 1801 GATTAA 1806 |||||| Sbjct 1801 GATTAA 1806 >Solyc06g074940.4.1 Length=1959 Score = 1781 bits (964), Expect = 0.0 Identities = 1530/1810 (85%), Gaps = 11/1810 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGTGTCGGATGCGGCGAAGAAGAGAGATGCGCAGAAGAAGGCGGCGGCAGCTGCTAGG 60 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | | Sbjct 148 ATGGTGTCGGATGCGAGTAAGAAGAGAGAGGCGCAGAAGAAGGCAGCAGCAGCTGCGAAG 207 Query 61 AGAGGAGGTAAAGGT---GCGGCAGCGCCTAAATCGGCTGCAACCGCGTCTAAATC--GG 115 |||||||| || | ||||| | | | || ||| ||| | || | | ||| Sbjct 208 AGAGGAGGGAAGTCTAAGGCGGCGGTG-ATGAA--GGCGGCAGCGGCTGCAACATCTACT 264 Query 116 CGGT-GGAAAGTAACGGGGTTGATAATTTGACGAATGGAGTAGGGGATCTACAGATATCT 174 | || ||| |||||||| || ||| | ||||||||||| ||||| || | ||| | ||| Sbjct 265 CCGTCGGAGAGTAACGGTGTCGATGAATTGACGAATGGTGTAGGAGAAATTCAGTTGTCT 324 Query 175 GATCGGACTTGTACGGGTGTTTTGTGTTCACATCCGCTATCGAGGGATATTCGGATAGAG 234 |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| Sbjct 325 GATCGGACCTGTACCGGCGTTTTATGTTCACATCCACTTTCCAGGGATATTCGGATAGAA 384 Query 235 TCATTATCAGTCACTTTCCACGGACATGATCTCATCGTTGATTCTGAACTGGAGCTCAAC 294 || |||||| | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 385 TCGTTATCACTTACTTTTCATGGACATGATCTTATAGTTGATTCTGAACTGGAGCTTAAC 444 Query 295 TATGGCAGACGTTATGGTTTG-TTGGGATTGAATGGCTGCGGGAAGTCTACTCTTCTTAC 353 || || ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct 445 TACGGAAGACGTTATGGTTTGCTTGGGCTT-AATGGCTGTGGGAAGTCTACTCTTCTTTC 503 Query 354 TGCTATAGGGTTGAGGGAACTTCCCATCCCAGACCACATGGATATTTTTCATCTTTCTCG 413 ||||||||| | | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | || Sbjct 504 TGCTATAGGATGTCGTGAACTTCCCATCCCAGATCATATGGATATCTTTCATCTAACGCG 563 Query 414 GGAGATTGAAGCCTCTGACATGACCTCTCTCGAGGCTGTCATTAATTGTGATGAAGAGAG 473 |||||||||||| ||||||||| |||| || | ||||| |||| ||| ||||||||||| Sbjct 564 GGAGATTGAAGCGTCTGACATGTCCTCACTTCAAGCTGTTATTAGTTGCGATGAAGAGAG 623 Query 474 GTTGCAATTGGAGAAAGAAGCTGAAGCTTTGGCTGGACAGGACGATGGTGGTGGAGAGCA 533 |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct 624 GTTGAGATTGGAGAAAGAAGTTGAAGTCTTGGCTGCACAGGATGATGGTGGTGGAGAGCA 683 Query 534 ACTTGAACGGATCTATGAGCGTTTAGAAGCTATGGATGCTGCCACTGCTGAGAAACGTGC 593 ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||||||| ||||| Sbjct 684 ACTTGAACGCATCTATGAGCGTTTGGAAGCTTTGGACGCATCAACTGCTGAGAAGCGTGC 743 Query 594 TGCTGAAATCTTGTTTGGGCTTGGATTTGATAAGAAAATGCAAGCAAAGAAAACACGTGA 653 |||||||| |||| || ||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||| || Sbjct 744 AGCTGAAATACTGTTCGGTCTTGGATTTAACAAGAAAATGCAAGAACAAAAAACACGAGA 803 Query 654 TTTTTCCGGTGGCTGGAGGATGAGGATTGCTCTTGCCCGTGCCCTCTTTATGAATCCAAC 713 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || Sbjct 804 TTTTTCCGGTGGATGGAGGATGAGGATTGCTCTTGCTCGTGCCCTGTTTATGAATCCGAC 863 Query 714 AATTTTGTTGCTTGATGAGCCAACAAACCATCTTGACCTAGAGGCCTGTGTGTGGTTAGA 773 |||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 864 CATTTTGCTGCTTGATGAACCCACCAATCATCTAGACCTAGAGGCTTGCGTGTGGTTAGA 923 Query 774 AGAATCCTTGAAGAACTTTGAGCGCATTCTGGTTGTCATTTCACACTCACAGGATTTTCT 833 |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| || || || || Sbjct 924 AGAAACCTTGAAGAAGTTTGACCGTATTCTGGTTGTTGTTTCACACTCGCAAGACTTCCT 983 Query 834 CAATGGTGTGTGTACCAATATCATCCACATGCAAAACAAGAAGTTAAAACTCTATACAGG 893 |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| || || Sbjct 984 AAATGGTGTGTGTACTAACATCATCCATATGCAAAATAAGACGTTGAAGCTCTACACTGG 1043 Query 894 TAACTACGACCAATATGTGCAAACCCGTTCAGAGCTGGAAGAAAACCAGATGAAACAGTA 953 ||| || || |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1044 TAATTATGATCAATATGTCCAAACCCGTGAGGAGTTGGAAGAAAATCAGATGAAACAGTA 1103 Query 954 CAAGTGGGAGCAGGAGCAGATTTCTGCAATGAAGGAATACATTGCTCGCTTTGGGCACGG 1013 || ||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| || || Sbjct 1104 CAGATGGGAGCGGGAGCAGATTGCTTCAATGAAGGAGTACATTGCTCGTTTTGGACATGG 1163 Query 1014 TTCAGCTAAACTAGCCCGTCAAGCACAGAGTAAAGAGAAGACATTGGCTAAGATGGAGCG 1073 || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct 1164 ATCTGCCAAACTAGCCCGTCAAGCACAAAGTAAAGAGAAAACACTGGCTAAGATGGAGCG 1223 Query 1074 TGGTGGGCTTACTGAGAAGGTGGGGAGGGACAGTGTCCTGGTTTTCCGGTTTACTGATGT 1133 ||| |||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||| || |||| Sbjct 1224 TGGAGGGCTTACAGAGAAGGTGGCAAAGGACAAGGTCCTGGTCTTCCGTTTTCCTAATGT 1283 Query 1134 CGGCAAACTTCCTCCTCCAGTTCTACAGTTTTCAGAAGTTGCTTTTGGCTACACACCTGA 1193 ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| || Sbjct 1284 TGGCAAACTTCCCCCTCCTGTTCTGCAGTTTGTGGAAGTGACATTTGGCTACACACCCGA 1343 Query 1194 TAACCTCATCTACAAGAACCTTGATTTTGGTGTAGATCTCGACTCCAGGATAGCACTTGT 1253 || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||| ||||||| || Sbjct 1344 GAATCTCATCTACAAGAACCTAGATTTTGGTGTAGACCTTGATTCAAGGGTAGCACTGGT 1403 Query 1254 GGGGCCTAATGGAGCTGGAAAGAGCACACTGCTTAAGCTGATGATAGGGGATTTATTTCC 1313 ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||| Sbjct 1404 GGGACCTAATGGAGCTGGAAAGAGCACGCTACTTAAGCTGATGACAGGGGAGTTGGTTCC 1463 Query 1314 CACTGATGGCATGGTTAAGCGGCATAATCACCTAAAAATTGCGCAGTACCACCAGCACTT 1373 | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| Sbjct 1464 CCTTGATGGCATGGTTAGGCGGCATAATCACCTGCGGATTGCACAGTTCCACCAGCACTT 1523 Query 1374 GGCTGAGAAGCTAGACATGGAGGTGTCAGCTCTTTTGTTTATGATGAGAGAGTACCCTGG 1433 |||||||||||| |||||||| | || |||||| ||| ||||| | |||||| ||||| Sbjct 1524 GGCTGAGAAGCTTGACATGGAATTATCTGCTCTTCAGTTCATGATAAAAGAGTATCCTGG 1583 Query 1434 GAACGAGGAGGAGAAGATGAGGGCAGCAATTGGGAGGTTTGGACTCACAGGTAAAGCTCA 1493 ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| Sbjct 1584 GAATGAGGAGGAGAAGATGAGGGCATCAATTGGGAGGTTTGGCCTTACTGGTAAAGCTCA 1643 Query 1494 AGTAATGGCAATGAAGAACTTGTCAGATGGTCAACGTAGTCGAGTGATTTTTGCATGGTT 1553 ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||| Sbjct 1644 AGTAATGCCTATGAAAAACTTGTCAGATGGTCAACGTAGCCGGATTATATTTGCGTGGTT 1703 Query 1554 GGCTTTTAGGCAACCCCACATGCTGCTGTTGGATGAGCCAACCAACCATCTTGATATTGA 1613 |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1704 AGCTTTTAGACAACCTCACATGCTGCTTCTCGATGAGCCAACCAACCATCTCGATATTGA 1763 Query 1614 AACCATTGACTCACTTGCAGAGGCCTTGAACGCATGGGATGGTGGGATGGTTCTAGTGAG 1673 || |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || || Sbjct 1764 GACAATTGACTCACTTGCCGAGGCTTTGAATGAATGGGATGGTGGAATGGTTCTTGTTAG 1823 Query 1674 TCACGACTTTAGGCTCATAAACCAGGTGGCCCATGAGATATGGGTATGTGAAAATCAGGC 1733 ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct 1824 TCATGATTTCAGGCTCATAAACCAGGTCGCCCATGAGATATGGGTATGTGAAAATAAAAC 1883 Query 1734 TGTGACACGATGGGAGGGTGGCATCATGGATTTCAAGAAACACTTGAAGAAAAGGGCTGG 1793 ||||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| || Sbjct 1884 TGTGACACGGTGGAAGGGTGACATTATGGACTTCAAGCTACATTTGAAGGCGAGGGCCGG 1943 Query 1794 ATTGGGTGAT 1803 |||||||||| Sbjct 1944 ATTGGGTGAT 1953 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 60711625900 Database: Tomato Genome CDS (ITAG release 4.0) Posted date: Mar 21, 2024 4:17 PM Number of letters in database: 34,993,605 Number of sequences in database: 34,075 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5