BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Tomato Genome CDS (ITAG release 4.0) 34,075 sequences; 34,993,605 total letters Query= Untitled_sequence Length=2286 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Solyc09g013080.3.1 4222 0.0 Solyc01g094340.3.1 316 3e-85 >Solyc09g013080.3.1 Length=2286 Score = 4222 bits (2286), Expect = 0.0 Identities = 2286/2286 (100%), Gaps = 0/2286 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCTTCAACTTCACATCCTCCCGTGGCATTCAGTGGAAGTTTGGCTTCTAAAACTTCA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGCTTCAACTTCACATCCTCCCGTGGCATTCAGTGGAAGTTTGGCTTCTAAAACTTCA 60 Query 61 GCTTCAGACCTTCTTCGTAGCTCAAGAAATGGTGTTTGTGGTGTGCCATTGAAAACCTTA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GCTTCAGACCTTCTTCGTAGCTCAAGAAATGGTGTTTGTGGTGTGCCATTGAAAACCTTA 120 Query 121 GGGAGAGCACAATTGGGTTCTAAGAAGAGAGATTTTACAATCTCTGCCAAGGTTAGAAAG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GGGAGAGCACAATTGGGTTCTAAGAAGAGAGATTTTACAATCTCTGCCAAGGTTAGAAAG 180 Query 181 GTAAAGAAGCACGAGTACCCCTGGCCAGAGGATCCTGACCTTAATGTCAAGGGTGGAGTC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GTAAAGAAGCACGAGTACCCCTGGCCAGAGGATCCTGACCTTAATGTCAAGGGTGGAGTC 240 Query 241 CTCAGTCACTTATCACCTTTCAAGCCATTGAAAGAAAAGCCAAAACCGGTGACTTTGGAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTCAGTCACTTATCACCTTTCAAGCCATTGAAAGAAAAGCCAAAACCGGTGACTTTGGAT 300 Query 301 TTTGAGAAACCTCTCATGGATCTGCAGAAAAAAATCATTGATGTTCAAAAGATGGCAAAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TTTGAGAAACCTCTCATGGATCTGCAGAAAAAAATCATTGATGTTCAAAAGATGGCAAAT 360 Query 361 GAAACTGGGTTGGATTTCAGTGATCAAATTATCTCACTTGAGAACAAATACCAACAGGCT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GAAACTGGGTTGGATTTCAGTGATCAAATTATCTCACTTGAGAACAAATACCAACAGGCT 420 Query 421 CTAAAAGATCTATACACACATCTGACTCCTATACAACGAGTGAATATTGCAAGGCATCCT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CTAAAAGATCTATACACACATCTGACTCCTATACAACGAGTGAATATTGCAAGGCATCCT 480 Query 481 AACAGGCCAACTTTCCTTGATCATATCTTTAATATTACTGAGAAGTTTGTGGAGCTTCAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 AACAGGCCAACTTTCCTTGATCATATCTTTAATATTACTGAGAAGTTTGTGGAGCTTCAT 540 Query 541 GGTGACCGAGCTGGGTATGACGATCCTGCCATTGTCACTGGACTTGGCACAATAAATGGT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GGTGACCGAGCTGGGTATGACGATCCTGCCATTGTCACTGGACTTGGCACAATAAATGGT 600 Query 601 AGAAGCTATATGTTTATGGGTCATCAAAAAGGACGAAACACAAAGGAGAACATACAACGT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 AGAAGCTATATGTTTATGGGTCATCAAAAAGGACGAAACACAAAGGAGAACATACAACGT 660 Query 661 AACTTTGGGATGCCTACTCCCCATGGTTATAGGAAGGCTCTGCGGATGATGTACTATGCT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AACTTTGGGATGCCTACTCCCCATGGTTATAGGAAGGCTCTGCGGATGATGTACTATGCT 720 Query 721 GATCATCACGGATTCCCGATCATCACTTTCATTGACACACCAGGGGCATATGCTGATCTC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GATCATCACGGATTCCCGATCATCACTTTCATTGACACACCAGGGGCATATGCTGATCTC 780 Query 781 AAATCAGAGGAACTAGGTCAAGGAGAAGCCATAGCTCATAACTTGAGGAGTATGTTTGGT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 AAATCAGAGGAACTAGGTCAAGGAGAAGCCATAGCTCATAACTTGAGGAGTATGTTTGGT 840 Query 841 TTGAAAGTACCAATTATTTCTATTGTTATGGGAGAAGGGGGTTCTGGTGGAGCTCTGGCT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TTGAAAGTACCAATTATTTCTATTGTTATGGGAGAAGGGGGTTCTGGTGGAGCTCTGGCT 900 Query 901 ATTGGTTGTGCTAATAAATTGTTGATGCTTGAAAATGCTGTCTTCTATGTTGCCAGCCCA 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 ATTGGTTGTGCTAATAAATTGTTGATGCTTGAAAATGCTGTCTTCTATGTTGCCAGCCCA 960 Query 961 GAAGCATGTGCAGCAATTTTGTGGAAGACTGCAAAAGCTTCTCCTAAGGCAGCTGAGAAA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GAAGCATGTGCAGCAATTTTGTGGAAGACTGCAAAAGCTTCTCCTAAGGCAGCTGAGAAA 1020 Query 1021 CTCAAGATAACAGCTCAAGAGCTGTGCAGGCTTCAAATTGCTGATGGTTCCATCCCTGAG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 CTCAAGATAACAGCTCAAGAGCTGTGCAGGCTTCAAATTGCTGATGGTTCCATCCCTGAG 1080 Query 1081 CCTCTTGGTGGTGCACATGCTGATCCGTATTGGACTTCACAGCAGATAAAAATTGCTATT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 CCTCTTGGTGGTGCACATGCTGATCCGTATTGGACTTCACAGCAGATAAAAATTGCTATT 1140 Query 1141 GAAGAATCAATGGATGAACTTACAAAAATGGACACCCAAGAGTTGTTAAGGCACAGGATG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 GAAGAATCAATGGATGAACTTACAAAAATGGACACCCAAGAGTTGTTAAGGCACAGGATG 1200 Query 1201 CTAAAGTTCCGAAAACTTGGTGGCTTCCAGGAGGGAGTTCCCATTGATCCAAAAAGGAAG 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 CTAAAGTTCCGAAAACTTGGTGGCTTCCAGGAGGGAGTTCCCATTGATCCAAAAAGGAAG 1260 Query 1261 GTCAACATGAAAAAGAAAGAAGAACCTCTTCTTCCACCTGGAATTCCGGATGTGGAATTA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 GTCAACATGAAAAAGAAAGAAGAACCTCTTCTTCCACCTGGAATTCCGGATGTGGAATTA 1320 Query 1321 ATGGATGAGGTTGAGAAATTGAAGCAGGAGATCCTGAAAGCAACGGAATCAACTGGGAAG 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 ATGGATGAGGTTGAGAAATTGAAGCAGGAGATCCTGAAAGCAACGGAATCAACTGGGAAG 1380 Query 1381 ATTCCAGACACAGGCCTGAATGAGATGATAGAAAAATTAAGAAGAGAAATTGATTATGAA 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 ATTCCAGACACAGGCCTGAATGAGATGATAGAAAAATTAAGAAGAGAAATTGATTATGAA 1440 Query 1441 TTTTCTGAGGCTGTTAAAGCTTTGGGTTTGGAGGAAAAACTTGTCATGGCGCGAGAAGAA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 TTTTCTGAGGCTGTTAAAGCTTTGGGTTTGGAGGAAAAACTTGTCATGGCGCGAGAAGAA 1500 Query 1501 TTTGCAAAAACAAGGAACTCAAATGACCAGTCAATGCATCCTGTTCTGAAGGAAAAACTT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 TTTGCAAAAACAAGGAACTCAAATGACCAGTCAATGCATCCTGTTCTGAAGGAAAAACTT 1560 Query 1561 GACCAGCTTAAGGATGAATTCAACAGAAACATTTCTGCTGCTCCAAATTATGCTAGCCTA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 GACCAGCTTAAGGATGAATTCAACAGAAACATTTCTGCTGCTCCAAATTATGCTAGCCTA 1620 Query 1621 ACGAATAAGCTTGAGATGTTGCAAGAAATGTCTAAAGCCCAGAAACTCTCAGAGAAATAT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 ACGAATAAGCTTGAGATGTTGCAAGAAATGTCTAAAGCCCAGAAACTCTCAGAGAAATAT 1680 Query 1681 AGCAAGGTAAACAACTTGAAGGAGGAGATCAATAAGAGGTTAAAAGAAGTCATGAACCGC 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 AGCAAGGTAAACAACTTGAAGGAGGAGATCAATAAGAGGTTAAAAGAAGTCATGAACCGC 1740 Query 1741 CCAGATTTGAAGGAGAAGATGGACGCATTGAAGGCTGAGATCAAGAGTACTGGTGTATCG 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 CCAGATTTGAAGGAGAAGATGGACGCATTGAAGGCTGAGATCAAGAGTACTGGTGTATCG 1800 Query 1801 AGAGTCATGGATCTAGACCAGGGGATAAAGGATAAACTTGTGCAACTGAAGGATGAAATA 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 AGAGTCATGGATCTAGACCAGGGGATAAAGGATAAACTTGTGCAACTGAAGGATGAAATA 1860 Query 1861 TGTATGGAATTTTCTGGTGTTTTCGAATCCCTAGGCTTAAACGTCAACCCAGCATCACTT 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1861 TGTATGGAATTTTCTGGTGTTTTCGAATCCCTAGGCTTAAACGTCAACCCAGCATCACTT 1920 Query 1921 CCTACTGATGCCAAGAGAAGAATCAATGAATTTAACAATGAAATTACAACGGTTATGGAA 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1921 CCTACTGATGCCAAGAGAAGAATCAATGAATTTAACAATGAAATTACAACGGTTATGGAA 1980 Query 1981 GACCTCGTGAACTCCACGGATTTGAAAAACAAGATTGAGTTGTTAAAGATGGAGGTAACA 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1981 GACCTCGTGAACTCCACGGATTTGAAAAACAAGATTGAGTTGTTAAAGATGGAGGTAACA 2040 Query 2041 AAGGCTGGAAAGACAGCAGATGCTGAGTCAAAGGCAAAAATTCAGGCCTTAGAACAGCAA 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2041 AAGGCTGGAAAGACAGCAGATGCTGAGTCAAAGGCAAAAATTCAGGCCTTAGAACAGCAA 2100 Query 2101 ATAAAGCAAAGTCTTGCACAGGCTATGAGTTTTCCAGAGTTAAAGGAGAAACACGAGAAG 2160 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2101 ATAAAGCAAAGTCTTGCACAGGCTATGAGTTTTCCAGAGTTAAAGGAGAAACACGAGAAG 2160 Query 2161 CTGAAGGAAGAGATTGTGGAAACCATTGAATCCCTTCAAGGATCCAATGGAAGTTTGCTA 2220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2161 CTGAAGGAAGAGATTGTGGAAACCATTGAATCCCTTCAAGGATCCAATGGAAGTTTGCTA 2220 Query 2221 GCAGATAACGGTGGTGCCAATTCAGGAGTAGGAGTAAATGTAGATGCAAACCGTAGCTTT 2280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2221 GCAGATAACGGTGGTGCCAATTCAGGAGTAGGAGTAAATGTAGATGCAAACCGTAGCTTT 2280 Query 2281 GCCTGA 2286 |||||| Sbjct 2281 GCCTGA 2286 >Solyc01g094340.3.1 Length=2178 Score = 316 bits (171), Expect = 3e-85 Identities = 588/794 (74%), Gaps = 10/794 (1%) Strand=Plus/Plus Query 352 ATGGCAAATGAAACTGGGTTGGATTTCAGTGATCA-AATTATCTCACTTGAGAA-C-AAA 408 ||||| | || ||||| | ||||||| ||||| | |||| | ||| ||| | || Sbjct 367 ATGGCCGAAGACACTGGACTAGATTTCACCGATCAGATTTAT-GC-TTTG-GAAGCTAAG 423 Query 409 TACCAACAGGCTCTAAAAGATCTATACACACATCTGACTCCTATACAACGAGTGAATATT 468 || |||||||| || | ||| | ||||| ||| |||| || || ||||| | | ||| Sbjct 424 TATCAACAGGCCCTGAGGGATTTGTACACTCATTTGACACCCATCCAACGGCTCCAAATT 483 Query 469 GCAAGGCATCCTAACAGGCCAACTTTCCTTGATCATATCTTTAATATTACTGAGAAGTTT 528 || | || ||||| || |||||| | || |||||||| | ||||| || ||||||| Sbjct 484 GCTCGACACCCTAATAGACCAACTGTACTAGATCATATACTAAATATGACAGAGAAGTGG 543 Query 529 GTGGAGCTTCATGGTGACCGAGCTGGGTATGACGATCCTGCCATTGTCACTGGACTTGGC 588 || ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||| Sbjct 544 GTAGAGCTCCATGGAGATCGTGCTGGCTATGATGATCCAGCCATGGTGACTGGCATTGGG 603 Query 589 A-CAATAAATGGTAGAAGCTATATGTTTATGGGTCATCAAAAAGGACGAAACACAAAGGA 647 | || | || |||||||| || | || || |||||||| ||||| |||| ||||| || Sbjct 604 AGCATTGAA-GGTAGAAGTTACCTCTTCATTGGTCATCAGAAAGGTAGAAATACAAAAGA 662 Query 648 GAACATACA-ACGTAACTTTGGGATGCCTACTCCCCATGGTTATAGGAAGGCTCTGCGGA 706 ||||| || || ||||||| ||||| || || ||||| || || |||||| || | | Sbjct 663 AAACAT-CATGCGGAACTTTGCAATGCCAACCCCTCATGGCTACAGAAAGGCTTTGAGAA 721 Query 707 TGATGTACTATGCTGATCATCACGGATTCCCGATCATCACTTTCATTGACACACCAGGGG 766 ||||| | |||||||||||||| || ||||| || | || || | ||||| ||||||| Sbjct 722 TGATGAAATATGCTGATCATCATGGCTTCCCTATTGTTACATTTGTAGACACTCCAGGGG 781 Query 767 CATATGCTGATCTCAAATCAGAGGAACTAGGTCAAGGAGAAGCCATAGCTCATAACTTGA 826 | | ||||||| | | ||| || || |||||||| || || || ||||| | || || | Sbjct 782 CTTTTGCTGATTTAAGATCTGAAGAGCTAGGTCAGGGTGAGGCAATAGCCTACAATTTAA 841 Query 827 GGAGTATGTTTGGTTTGAAAGTACCAATTATTTCTATTGTTATGGGAGAAGGGGGTTCTG 886 || ||||| || ||||||| ||||| || | |||| | || ||||| ||||| | Sbjct 842 GGGCAATGTTCGGCCTGAAAGTTCCAATCATAACGGTTGTAACTGGTGAAGGTGGTTCAG 901 Query 887 GTGGAGCTCTGGCTATTGGTTGTGCTAATAAATTGTTGATGCTTGAAAATGCTGTCTTCT 946 | || ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||| | ||||| | | || | Sbjct 902 GCGGCGCTCTTGCCATTGGATGTGCAAACAAGTTGTTAATGTTGGAAAACTCAGCATTTT 961 Query 947 ATGTTGCCAGCCCAGAAGCATGTGCAGCAATTTTGTGGAAGACTGCAAAAGCTTCTCCTA 1006 ||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||| | Sbjct 962 ATGTTGCTAGTCCTGAAGCTTGTGCTGCAATATTATGGAAATCTTCACAAGCAGCTCCAA 1021 Query 1007 AGGCAGCTGAGAAACTCAAGATAACAGCTCAAGAGCTGTGCAGGCTTCAAATTGCTGATG 1066 ||||||||||||| || | ||| |||||||| || | | |||||| | || || |||| Sbjct 1022 AGGCAGCTGAGAAGCTGAGGATCACAGCTCAGGAACATTACAGGCTCCGGATAGCGGATG 1081 Query 1067 GTTCCATCCCTGAGCCTCTTGGTGGTGCACATGCTGATCCGTATTGGACTTCACAGCAGA 1126 | || ||||| || || |||||||||||||||||||| | ||| | || ||||||| Sbjct 1082 GAATTATTCCTGAACCGCTCGGTGGTGCACATGCTGATCCTTTCTGGGCATCTCAGCAGA 1141 Query 1127 TAAAAATTGCTATT 1140 | ||| ||||||| Sbjct 1142 TTAAACATGCTATT 1155 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 77083300300 Database: Tomato Genome CDS (ITAG release 4.0) Posted date: Mar 21, 2024 4:17 PM Number of letters in database: 34,993,605 Number of sequences in database: 34,075 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5