LM-C09HBa0047I13.1 TCAAGCTTGCAATAATCACAATATAGATTCCCACTCTTCTTGAATCTTTT AGTACCATCATTTCTCAAGTACATAGCTAACTTATACGCTTGTTGGACAG AATCAGGATTAGACCCTAATATGCCTGTTGTAGCTACGACTGATTTTTAC TCTCATCAGACATGACCATTAAATATGCTTGATTTACTAATGGAAATGGG ATCATTAACAAGATCTGAGACCTTGCTCATATGTAAGATTCATTTAAACC CATAAGGAACTAAAACAGTTTGAGTTTCTACAGGTTTACTACATACTCTT TTGATCTCTCGCATTCACATGAGGGAGTAGGTACCACAACCTCAAATTTT TCCCACAACCCTTTCGATTTCGAAAAATACACAAACACAGAATTTGTTCC TTGAGTTATATTGGCAATCTCTTGATAGAGATTGAATGTTTATGACCTAT CTATTTTGTTAAATCGTTCATACAAATTCATCCAAACATCTTAAGCACAC GTTGCATACATGATACTTCCAAGAAGACCTTTCTCTACAGAATTCATAAG TCAGGACAATACCACAACATTCACCCTTTCCCAGATACATTCTAATCCTA GAAATTTATCTTTTGGACATGATCCATCTAATAACCCCATTTTGTTTCTT CCTAACATGGCTAATTTCATCAATCTATACCACATAGAATAAAGAATCAG TTAATTGAAACGAAATAATCTGATTTTCACTTACATCAAATGAATAGAGA AACAGGGGATGATTGTAATCAATGACTGAAGTTGAATTTCTATTCCAGTT CCTAAACTTGATTCTACATTAGGGCCAAAAATTGTTGTAGTATTTGTGTC GTTCGTCATTGCATTTATTTGCACACTTGTGATCGATTAATCTTAGAGGA ATTGTTGATTGATTTATTCAACTAGGAATACCAGTTAATTGAGCTCTGAT 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score 337.0

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score 673.0

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score 5716.0

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score 992.0

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score 1095.0

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score 1154.0

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score 1148.0

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score 568.0

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score 3553.0

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score 791.0

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score 4994.0

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score 440.0

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score 758.0

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score 7264.0

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score 484.0

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score 304.0

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score 4874.0

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score 4784.0

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score 912.0

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score 12587.0

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score 1811.0

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score 254.0

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score 8339.0

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score 1688.0

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score 843.0

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score 555.0

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score 4970.0

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score 596.0

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score 229.0

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score 298.0

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score 364.0

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score 1753.0

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score 0.862

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score 0.727

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score 0.801

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score 0.524

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score 0.8

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score 0.682

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score 0.917

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score 0.65

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score 0.714

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score 0.839

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score 0.862

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score 0.568

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score 0.93

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score 0.846

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score 0.667

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score 0.571

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score 0.667

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score 0.805

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score 0.801

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score 0.719

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score 0.792

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score 0.818

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score 0.524

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score 0.916

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score 1.0

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score 0.887

14941 15015 ATTCCACCCACAAACAC-AAAGTTTACGGCTGACTGATATTGCCCATTATCATTTAGCTATTGTATTTATTTTTCT 423 498 ATTCCACCCACAAACGCAAAAGTTTATGGGTGACTGATATTGCCCATCACCATTTAGCTATTGCATTTATTTTTCT LM-SGN-E331220+ LM-SGN-E331220+ 0.947

score 0.947

14835 15148 TTTTTACAGGTCAATGGAATCTTTATGCTCAAAACCCCGATTCAAGTAGTCATTTATTTGGTACCGCCGAAGGGGCGGGAACGACCATTCTAACTCTTCTCGGGGGATTCCACCCACAAACACAAAGTTTACGGCTGACTGATATTGCCCATTATCATTTAGCTATTGTATTTATTTTTCTTGTTGCTGGTCATATGTATAGAACCAATTTCTGGATTGGGCACAATATGAAAGATATTTTAAATGCACATATTCCTCC-GGGGGACGATTGGGGCGTGGACATAAGGGTCTTTGTGATTCAATCATCAATTCGC 262 576 TTTTTACAGGTCAATGGAATCTTTATGCTCAAAACCCCGATTCAAGTAGTCATTTATTTGGTACCGCCGAAGGGGCGGGAACGGCCATTCTAACTCTTCTCGGGGGATTCCACCCACAAACGCAAAGTTTATGGCTGACTGATATTGCCCATCACCATTTAGCTATTGCATTTATTTTTCTTGTTGCTGGTCATATGTATAGAACCAATTTCGGGATTGGGCACAGTATGAAAGATCTTTTAGATGCACATATTCCTCCGGGGGGACGATTGGGGCGTGGACATAAGGGTCTTTATGACACAATCAACAATTCGC LM-SGN-E262289- LM-SGN-E262289- 0.883

score 0.883

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score 0.891

32245 32848 ATGGATTAAGATACTCTTTGCTCAACTCCTAGAGATAGAAATACGTTGTTATGTCAACAAAAATCCAGTGATAGTTATGGTGATCAAACATGTGAGGGGGAACCACCCGTTTGATTATGGAAAGAGCTCAGTCAGAATCTTTCAGGTATGTTGATCCATCTCACATTTTTGTAATATATTCACATTTTCTATAACTTAAAAAAAGACAACTTTTAGCGGCAAT-AACATGCACATTAACAAATAGTGCTAAAGCCATTACATGCATTAATTAATTGTCATTGGATCCTATATCTCAATAGGCTTTAGAGACATTTCCAAAGAATATTAATTGCCTCAAAGAATATATTTAGCAACAATTAAGCTATTTTCATTAATTAATTGCTACTAAAGATCATTTTTGGTGTAGTGTATTATCACAACATT---AAAAAA-ATGCAAACTTGATGATGACAATATTTTGCATTTTGGGCTTG-TAAAATGATTGAGTGGCTTCAACAAGAAAAACAAAGCATTTGGTATCAGTGTTCAAGTTGCAACTGAAGTAATTCAAATTGTTCCACGTGTAAGCACCGTTGTTTTTTGTAAGTTAACGGGTAAAAGATGACAT 1 607 ATAAATTAAGATACTCTTTGCTCAACTCCTAGAGATGGGAATAAGTTGTTATGTCAACAAAAATCTAATGATAGTTATGATGATCGAACATATGAGGGAGAACCACCCGTTTGATTATGGAAAGAGATCAGTCAAAATCTTTCAAGTA--TTGATCCATCTCACA-TTTTGTAATATATTCACAGTAGCTATAACTACAAAAAGAAAAACTATTAGGGGCAATAAACATGCACATTAACAAAGAGTGCTAAAGCCGTTACAAGCATTAGTTAATTGTAATTGGATCCTATGTCTCAATAGGCTTTAGAGACATTTACAAAGAATGTTAATTGCCTCTAAGAACATATTTAGCAACAATTAAGCTCTCTTCACTAATTAATTGCTACTAAAGATCATTTTCGGTGTAGTGTATTATCACAACATTAAAAAAAAAGAAGCAAACTTGATGAGGACAATATTTTGCATTTTGGGCTTGCAAAAAGGATTGAGTGGCTTCAACAAGAAAAACAAAGCATTTGGTATCAGTGTTCAAGTTGCAACTGAAATAATTCAAATTGTTCTACTTGTAAGCACCATTGTTTTTTGTAAGTTAACTGGTAAAAGATGATAT LM-SGN-E252547+ 51983 52352 LM-SGN-E252547+ 0.856

score 0.856

51983 52183 TTGTAAAATCTCCTATGTGCTTGATTGTGTGGTTGTATGTTTAGATTGTGTGGTTTGTGATTGGCCTAAAATTATGAGGCTGTTGAATTTCTAATCTTGAACCCTCTCTATTAAAATGAAGCCTTGAATAAATAAGGTTTCTTGAAACAAAATAATGAGATAATTGGATCGGAGTGTCATGTTCCGACATGGTATTATTGG 2 197 TTGTAAAGTCTCCTATGTACTTTATGGTGTGGTTGTATGTCTTGATTGTATGGTTTCTGGTTGG-CTAAAATTACGAGACTGCTGAATTTCTAATCTTG-NCCATTTCTATTAAAATGACGCCTTGAATAAAGAA-GATTGATGAAATAAAATAATGA-ATAA-TGGATCGCAGTGTCACGTTCCGACATGATATTATTGG LM-SGN-E252547+ 0.904

score 0.904

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score 0.891

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score 0.847

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score 0.836

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score 0.753

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score 0.636

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score 0.667

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score 0.55

46302 46283 AGATTATTGCACCTATACAT 197 216 TGGGTGTTGGAGCTGTCCAA LM-SGN-U221227+ 0.556

score 0.556

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score 0.79

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score 0.878

48222 48133 TTTCTTTTTTCTTCCAAACCTGATTTCTTGGCACTTTTCAGCTCAATTTTACAGTTCTATTGTCTTCTCAACAATATCTTTCGAAATCAG 2 91 TTATTTTTTGCTTCCAAACCTGATTTCTTGGCACCTTGAAGTTCAATTGTACAGTTCTATTGTCTTCTCAACAATATCTTTCGTAATTGG LM-SGN-U231325+ 0.838

score 0.838

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score 0.888

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score 0.831

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score 0.868

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score 0.798

85704 84981 TTCTGATGTCATGGGGAAGGTGGATTATATGAACATGCCTGGTACGCCTAAAAAGGTTGATGTAAAAACTCAACGGTTAAGGGCTTCTCTCACTGCTATAGAAGAGGAGATGGAGGCATTAAAAATGGCTCACTCAGTAGAGATGGAATAGATTCAGCTTGCTCATAAGTTGGAACGAGAGGAATTGATTGCTGAGAACTGTAGGATTAAAGAAGAACTCACTCAGACTAAGGCTATGTTACATCACGAAAGAGAAGTGAATTCTGGGCATCTACAAAGTTTCATGGGTTTGCTAACTAAGGGATCCTCAACCTCTTCCACCTCTGTGGCACCCTCTGCTTAATCTATCATTTCTATATGCATTGTCTTATAA-TTTTTGTTCTTGACTAGTT-AAGACTGAAGTA-A-A-TA-GTA---TGTA--TA--TTGGTTTTATGTCTAACTCTAGATGTAACTAATGACTATGTCTGATGCTCTATTTTTGTATGCATATGTACTTTGGTTTTCAATTTTTGGCTAATGGCAAAAGGGGAAAGTAGCCTGCAGA-T---GATATAAAG-TGTTCT-ATA-TATT-GATA---TG-TTG-TGTA-CCTATTCAAATTCAAATGCAAATTGATTATTTACCATAGTCAAAAAGGGGGAATTTGTTAATCTTGAGATTTTGAAAATGGCAAAATTGTATTGAACAGGTAACGCAACATGTTCCAATGAAATACTGCAGCGTGTATGCAAGTGGCAGC 1 750 TTCTGATGTCATGGGGAAGGTGGACTACATGAACATGCCTGGTACGCCTAAAAGGGTTGATGTGAAAACTCAACGGTTGAGGGCTTCTCTTACTGCTGTAGAAAAGGAGATGGAAGCATTAAAAAGGGCTCATTCAGTAGAAATGGAACAGGTTCAGATTGCTCATAAATTGGAACGTGAGGAATTGATTGCTGAGAATTGCAGGATTAAGGAAGAACTCACTCAAACTCAGGCTGCGTTACATCAAGAAAGAGAAGTGAATTCTGGGCATCTACAAAGTATCATGGGGTTGCTAACACAGGGATCTTCAAACTCTTCCACCTCTATGGCACCCTCTGTTTAATCAATC-CTCATATATGCATTATCTTATAATTTTTTGTTTTTGACTAGTTAAAGACTGAAGTAGACATTACTTATTTTGTATGTATTTTGGTTTGATGTCTAACTCTTGATGTCACTAATGGCTTTGTCTGATTCTCTATTTTAGTATGCATATGTACTTTGGTTTTCAATTTTTGGCTAATGGCAAAAGGGGGAAGCAGCCTGCAGATTGCAGATGTGCAGATGATATGAAAGTGTTCTATATGTTGATTGATGTATTGTGTACCTATTCAAATGCAAGCTGATTATTTGCCATAGTCAAAAAGGGGGAATTTGTTAATCTTGAGATTTTGAAAATGGTAAAATAGTATTGAACAGGTAACGCAACATGTTCCAGTGAAACTATGCAGCAGGTGTGTTAGTGGCGGC LM-SGN-E352898+ LM-SGN-E352898+ 0.842

score 0.842

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score 0.916

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score 0.92

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score 0.922

7193 6664 TCTTGTGTTCTTAATTCATCAAATGTGTGTGTGTGCATTCGATCCAAACAACTGGTATCAGAGCTAAGGAGATTCAACAAGATCACTGAAGATGGATAGTTCGAAGCTTGAAATCGAGAAGTTTGATGGATCCGATTTCAGAATCTGGAAGATGCAGATCGAAGATTATCTGTACCAGAAAGATCTTCACGAATCGTTGACCGGGGTGAAACCAAAATCCATGACGGAGGAGAAGTGGAAACTCAAGGATCGCTAGGCTCTAGGGTTGATTCGGTTGACTTTGTCAAGAAACGTGGCGTTACACATCGTGAAGGAGAAGACTACGTCCGGTCTGTTGAAGGCACTGTCAAACATGTATGAAAAACTATCGGCAATGAACAAGGTATATTTGATGCGTAGA-TGTTCAATTTACAAATGTCTGAGAATGGATCCGTTTCTGATCATATAAACGAGTTCAATATTATTGTGAGTCAACTCAATTCTGTGGATATTAATTTCGAAGATGAAATTAAGGCGTTGATTTTGATGTC 98 628 TCTTGTGTTCTTTATTCATCTAGTGTGTGTGCGTGAATTCGATCCTAACAAATGGTATCAGAGCTAAGGAGATTCAACACGATCACAGAAGATGGATAGTTCGAAGCTTGGAATCGAGAAGTTTGATGGATTCAATTTCAGTTTCTGGAAGATGCAGATCGAAGATTATCTGTACCAGAAAGATTTTCACGAGCCGTTGACCGGGGTGAAGACGAAATCCATGACTGAGGAGAAGTGGAAACTCAAGGATCGCCAGGCTCTAGGGTTGATCCGGTTCACTTTGTCAAGAAACATGGCGTTCAACATCGTGAAGAAGAAGACTACGTCCGGTCTGTTGAAGGCACTATCAAATATGTATGAAAAACCATCGGCTATGAACAAAGTATATTTGATGCGTAGATTGTTCAATTTACAGATGTTTGAAACTGGATACGTTTCTGATCATATAAACGAGTTCAATATGATTGTGAGTCAACTCAATTCTGTGGATATTAATTTCGAAGATGAAATTAAGGCGTTGATTTTGATGTC LM-SGN-E540114- LM-SGN-E540114- 0.919

score 0.919

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score 0.909

7193 6717 TCTTGTGTTCTTAATTCATCAAATGTGTGTGTGTGCATTCGATCCAAACAACTGGTATCAGAGCTAAGGAGATTCAACAAGATCACTGAAGATGGATAGTTCGAAGCTTGAAATCGAGAAGTTTGATGGATCCGATTTCAGAATCTGGAAGATGCAGATCGAAGATTATCTGTACCAGAAAGATCTTCACGAATCGTTGACCGGGGTGAAACCAAAATCCATGACGGAGGAGAAGTGGAAACTCAAGGATCGCTAGGCTCTAGGGTTGATTCGGTTGACTTTGTCAAGAAACGTGGCGTTACACATCGTGAAGGAGAAGACTACGTCCGGTCTGTTGAAGGCACTGTCAAACATGTATGAAAAACTATCGGCAATGAACAAGGTATATTTGATGCGTAGA-TGTTCAATTTACAAATGTCTGAGAATGGATCCGTTTCTGATCATATAAACGAGTTCAATATTATTGTGAGTCAACTC 97 574 TCTTGTGTTCTTTATTCATCTAGTGTGTGTGCGTGAATTCGATCCTAACAAATGGTATCAGAGCTAAGGAGATTCAACACGATCACAGAAGATGGATAGTTCGAAGCTTGGAATCGAGAAGTTTGATGGATTCAATTTCAGTTTCTGGAAGATGCAGATCGAAGATTATCTGTACCAGAAAGATTTTCACGAGCCGTTGACCGGGGTGAAGACGAAATCCATGACTGAGGAGAAGTGGAAACTCAAGGATCGCCAGGCTCTAGGGTTGATCCGGTTCACTTTGTCAAGAAACATGGCGTTCAACATCGTGAAGAAGAAGACTACGTCCGGTCTGTTGAAGGCACTATCAAATATGTATGAAAAACCATCGGCTATGAACAAAGTATATTTGATGCGTAGATTGTTCAATTTACAGATGTTTGAAACTGGATACGTTTCTGATCATATAAACGAGTTCAATATGATTTGGAGTCAACTC LM-SGN-E257955- LM-SGN-E257955- 0.908

score 0.908

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score 0.891

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score 0.847

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score 0.868

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score 0.753

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score 0.636

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score 0.667

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score 0.55

46302 46283 AGATTATTGCACCTATACAT 197 216 TGGGTGTTGGAGCTGTCCAA LM-SGN-E544298+ 0.556

score 0.556

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score 0.792

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score 0.753

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score 0.636

47437 47416 ATTGGTCCTAGTTACTCTTCTG 162 182 ATTGGTCTCAATTGC-ATCCTT LM-SGN-E307423+ 0.667

score 0.667

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score 0.55

46302 46283 AGATTATTGCACCTATACAT 188 207 TGGGTGTTGGAGCTGTCCAA LM-SGN-E307423+ 0.556

score 0.556

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score 0.836

45978 45383 GATGTCCTAGAGTTTGTCTCAATGTACTCTCAATTTGACATAGAGCAAGATCAAATGAATATAGACAACACAACATGAGGACAAAACCAAGAACATGAAAAAGATAACGAGGAACAACTGCCAAATTCATTCCAAACAGTAGTAGCCTTGGTTATTTCATTTTCATTTGGTATCATTGTGTCAATTTTTACTGTTGCA-TTATAGCAAATTATAAGGT--GA--GACTG-G-TTG-TGAATGTGGCTGCAATGAGATTGTCAGTTGTCATTGTTAGCATTTGGAGGAATTGGTACTTTTTTAAGCACAAGTCCTATGGTGAAATCTTGTCCAAGAGTTTTAATTGGAGGCAAGATGGCTATGGTCATTACCTTTTGCCTTACCAAGCTGATTAACTCTACTACAAGTATTTATTTCTGATTTTAATCTACGGTAA--TTTTTT-C--TTAAAATAA-TAATTTAAGGCGTGAATGCTTATTTTGAATGCTGAAAAAAAGAAGTGATTCTAAGTTGCATTTAAAGGAAGCTAATGCTCTATATGATGAATGATTAGGAGCGAATAAAGACAAATTTTTATCATGGGTCTCCTTGAGTACTTCCTATTCAAA 57 664 GATTGCCTAGAGTTTGTCTCAATGTACTCTCAATTAAACATAGATCAAGATCAAATGAAGATAGACAACGCAACATGAGGACAGAACCAAGAACATGAAAAAGATAACGAGGAACAACTGCCAAATTAATTCCAGACAGTAGTAGCCTTGGCTATTTCATTTTTATTGGGTATCATTGTGCCAGTTTTTACTGCTGCATTTATAGCAAATTATAAGGTCAGATTGGCTGTGAATGATGAATGTGGTTGCAATGAGCTTGCCAGTTGTCATTATTAGCATTTGGAGGAATTGGTACTTTTTTAAGCACAAGTCCTATGGTGAAATCTTGTCAAAGAGTTTTAATTGGAGGCAAGATGGCTATGGCCATTACTTGTTGCCTTGCTAAGCTGATTGGCTCTACTACAAGTATTTCTTTCTATTTTGGATCTACGGTAAGTTTTTTTACAAAAAAAAAAATTAATTCAAGAGGTCAATGCTTATTTCAAATGCCG-AAAAAAGAAGTGGTTNTAAGTTTCATTTAAAGCATGTTATTGATGTACATGGTGAATGATTAGGAGTGAATAAATACTAA-TTTTATCAAGGGTCTCCTTGAATACTTCCTATTCAAA LM-SGN-E273665+ 48222 47192 LM-SGN-E273665+ 0.878

score 0.878

48222 48133 TTTCTTTTTTCTTCCAAACCTGATTTCTTGGCACTTTTCAGCTCAATTTTACAGTTCTATTGTCTTCTCAACAATATCTTTCGAAATCAG 2 91 TTATTTTTTGCTTCCAAACCTGATTTCTTGGCACCTTGAAGTTCAATTGTACAGTTCTATTGTCTTCTCAACAATATCTTTCGTAATTGG LM-SGN-E273665+ 0.832

score 0.832

47595 47192 ATGCT-CAAAACCAAGTCTGGGTTACCATTCCTAAAGACCATAATGGCCAGAAGCAAGCCCTTGAGGAGGATTTTGATTATGAGCACAGTGGGTTTGAGCCGTTGTTCTAGGAGCCAATGACGGATCAAAAATTCTAATTCGCAATTTCATAATCCAAAATTGGTCCTAGTTACTCTTCTGGTCAACTCACTGTCGA-TTCAATTTCTCTGCTATTTCTTTGAACTTCCATAAAAACATTTCAAGAGTTTTAGTATTATCTTATGCATTAGTTGACTAATGCTGCTTGTTGTGCTGGTTAGAAAAAAT-TGGATGTATTTGCATGAAAAAGATTAAGTTTGTTT-CAGATATTGTAATTCTTGGGCCCTCTCAAAGATGTTGTGACAAGCATATGCCCTACTATTTCT 92 477 ATGCTCCAAAATCAAGTTTGGATTACCATTCCTAAAGACCATCATGGCCAGAAGCAAGCCATTGAAGAGGATTTTGACTATGAGCACAGTGGGTTCGAGCCACTGTTCTAGGAGCAAATGGCGAAT--TAGTTTCT-ATT-GC-A--TC-T--T------TT-GT-C-AGTT-CTCTATTTGTC--CTCACTGTCGATTTCAATTTCTCTGCTATTTCTTTGAACTTCCATATAATTATTTCAAGAGTTTTAGTTTCCTCTTGTGCATTAATTGACTAATGCTGCTTGTTGTGCTGGTTAGGAAAATTGTGGATGTATTTAGACGAAAAAGATTAAATTTGTTTCCAGATATTGTAATTCTTGGGTCCTCTCAAAGATGTTGTGACAAGCATATGTCCTACAATTTCT LM-SGN-E275852+ LM-SGN-E275852+ 0.888

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score 0.828

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Matrix a_thaliana.mod

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Matrix a_thaliana.mod

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exon_type CDSi

54138 54203 fgenesh -1.19

score -1.19

exon_type CDSi

54465 54549 fgenesh 15.62

score 15.62

exon_type CDSl

55506 55635 RB-Fgenesh_8 fgenesh 12.24

score 12.24

exon_type CDSf

62679 62739 fgenesh 14.57

score 14.57

exon_type CDSi

62815 63007 fgenesh 8.25

score 8.25

exon_type CDSi

63054 63161 fgenesh -0.41

score -0.41

exon_type CDSi

63450 63538 fgenesh 0.01

score 0.01

exon_type CDSi

63624 63763 fgenesh 13.86

score 13.86

exon_type CDSi

64202 64463 fgenesh 29.77

score 29.77

exon_type CDSl

66592 66947 RB-Fgenesh_9 fgenesh 28.0

score 28.0

exon_type CDSl

86393 86056 fgenesh 20.81

score 20.81

exon_type CDSi

86934 86504 fgenesh 25.4

score 25.4

exon_type CDSi

89270 88705 fgenesh 23.59

score 23.59

exon_type CDSf

89423 89307 RB-Fgenesh_10 fgenesh 17.81

score 17.81

exon_type CDSl

92073 91685 fgenesh 3.72

score 3.72

exon_type CDSf

93416 93308 RB-Fgenesh_11 fgenesh 4.58

score 4.58

exon_type CDSl

95716 95477 fgenesh 9.96

score 9.96

exon_type CDSi

96018 95771 fgenesh 16.1

score 16.1

exon_type CDSi

96748 96495 fgenesh 25.22

score 25.22

exon_type CDSf

97273 96810 RB-Fgenesh_12 fgenesh 6.63

score 6.63

exon_type CDSl

97931 97728 fgenesh 7.53

score 7.53

exon_type CDSi

100166 100034 fgenesh 12.32

score 12.32

exon_type CDSf

100433 100300 RepeatMasker repeat_lib_v4.2.lib RB-TOPSCOTCH_LP_I TOPSCOTCH_LP_I 484.0

score 484.0

ident 66.5

Genomic_Match_Length 337

Repeat_Class LTR/Copia

Match_Length 336

Match_Range 461-797

Repeat_Length 4616

487 150 RB-FRSiTERT00100019 FRSiTERT00100019 2225.0

score 2225.0

ident 76.7

Genomic_Match_Length 881

Repeat_Class LTR/Copia

Match_Length 4075

Match_Range 1-4076

Repeat_Length 4076

4729 3848 RB-MtChr8L352 MtChr8L352 1042.0

score 1042.0

ident 66.6

Genomic_Match_Length 1046

Repeat_Class LTR/Copia

Match_Length 1064

Match_Range 2118-3182

Repeat_Length 5290

4730 5776 RB-trep700 trep700 388.0

score 388.0

ident 66.5

Genomic_Match_Length 1072

Repeat_Class LTR/Copia

Match_Length 3019

Match_Range 1704-4723

Repeat_Length 7247

6142 5070 RB-MtChr4L386 MtChr4L386 331.0

score 331.0

ident 96.5

Genomic_Match_Length 56

Repeat_Class LTR

Match_Length 56

Match_Range 1940-1996

Repeat_Length 7625

7330 7274 RB-trep2054 trep2054 344.0

score 344.0

ident 86.4

Genomic_Match_Length 87

Repeat_Class Other

Match_Length 88

Match_Range 1138-1226

Repeat_Length 1399

7367 7280 RB-trep1242 trep1242 342.0

score 342.0

ident 93.0

Genomic_Match_Length 13

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 87

Match_Range 4038-4125

Repeat_Length 8492

7381 7368 RB-ORSiTEMT05300003 ORSiTEMT05300003 281.0

score 281.0

ident 83.5

Genomic_Match_Length 14

Repeat_Class DNA

Match_Length 121

Match_Range 28-149

Repeat_Length 864

7396 7382 RB-Os4_05_6L Os4_05_6L 2538.0

score 2538.0

ident 86.2

Genomic_Match_Length 376

Repeat_Class LTR

Match_Length 377

Match_Range 9115-9492

Repeat_Length 15624

14833 15209 RB-Os4_11_1L Os4_11_1L 230.0

score 230.0

ident 70.9

Genomic_Match_Length 86

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 85

Match_Range 1588-1673

Repeat_Length 9342

29153 29067 RB-GYPSODE1_LTR GYPSODE1_LTR 5221.0

score 5221.0

ident 79.8

Genomic_Match_Length 2341

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 2236

Match_Range 727-2963

Repeat_Length 2963

35622 33281 RB-GYPSODE1_LTR GYPSODE1_LTR 1245.0

score 1245.0

ident 81.7

Genomic_Match_Length 249

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 246

Match_Range 727-973

Repeat_Length 2963

36161 35912 RB-OSHOOTER OSHOOTER 257.0

score 257.0

ident 88.9

Genomic_Match_Length 46

Repeat_Class DNA/En-Spm

Match_Length 44

Match_Range 11473-11517

Repeat_Length 11544

36297 36251 RB-GYPSODE1_LTR GYPSODE1_LTR 3454.0

score 3454.0

ident 82.6

Genomic_Match_Length 637

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 654

Match_Range 1-655

Repeat_Length 2963

36965 36328 RB-GYPSODE1_I GYPSODE1_I 15920.0

score 15920.0

ident 85.2

Genomic_Match_Length 2501

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 2514

Match_Range 2628-5142

Repeat_Length 5142

39467 36966 RB-GYPSODE1_I GYPSODE1_I 9109.0

score 9109.0

ident 83.6

Genomic_Match_Length 1849

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 1894

Match_Range 1-1895

Repeat_Length 5142

41311 39462 RB-GYPSODE1_LTR GYPSODE1_LTR 4870.0

score 4870.0

ident 79.9

Genomic_Match_Length 2315

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 2236

Match_Range 727-2963

Repeat_Length 2963

43627 41312 RB-GYPSODE1_LTR GYPSODE1_LTR 3865.0

score 3865.0

ident 84.1

Genomic_Match_Length 655

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 654

Match_Range 1-655

Repeat_Length 2963

44449 43794 RB-trep2107 trep2107 311.0

score 311.0

ident 96.5

Genomic_Match_Length 57

Repeat_Class Other

Match_Length 58

Match_Range 1573-1631

Repeat_Length 6688

51784 51841 RB-trep2069 trep2069 247.0

score 247.0

ident 94.8

Genomic_Match_Length 57

Repeat_Class DNA/En-Spm

Match_Length 57

Match_Range 331-388

Repeat_Length 7864

51796 51853 RB-GYPSODE1_I GYPSODE1_I 497.0

score 497.0

ident 74.8

Genomic_Match_Length 142

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 150

Match_Range 3-153

Repeat_Length 5142

52953 53095 RB-GENBANK_AF083074.1_7870 GENBANK_AF083074.1_7870 240.0

score 240.0

ident 82.4

Genomic_Match_Length 69

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 70

Match_Range 2222-2292

Repeat_Length 7870

53926 53995 RB-GYPSODE1_I GYPSODE1_I 1166.0

score 1166.0

ident 69.7

Genomic_Match_Length 490

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 488

Match_Range 1614-2102

Repeat_Length 5142

54586 55076 RB-GYPSODE1_I GYPSODE1_I 849.0

score 849.0

ident 65.8

Genomic_Match_Length 608

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 607

Match_Range 1609-2216

Repeat_Length 5142

55705 56313 RB-GYPSODE1_I GYPSODE1_I 4915.0

score 4915.0

ident 68.1

Genomic_Match_Length 1871

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 1873

Match_Range 2151-4024

Repeat_Length 5142

56293 58164 RB-GENBANK_AB196430.1_5710 GENBANK_AB196430.1_5710 319.0

score 319.0

ident 73.8

Genomic_Match_Length 125

Repeat_Class LTR/Copia

Match_Length 125

Match_Range 1189-1314

Repeat_Length 5710

63264 63389 RB-ATCopia61_I ATCopia61_I 271.0

score 271.0

ident 87.0

Genomic_Match_Length 54

Repeat_Class LTR/Copia

Match_Length 54

Match_Range 1125-1179

Repeat_Length 4653

63558 63612 RB-ATCopia61_I ATCopia61_I 278.0

score 278.0

ident 71.5

Genomic_Match_Length 133

Repeat_Class LTR/Copia

Match_Length 131

Match_Range 1479-1610

Repeat_Length 4653

63927 64060 RB-GENBANK_AB196430.1_5710 GENBANK_AB196430.1_5710 826.0

score 826.0

ident 70.1

Genomic_Match_Length 916

Repeat_Class LTR/Copia

Match_Length 1958

Match_Range 1357-3315

Repeat_Length 5200

64513 65429 RB-Os4_05_6L Os4_05_6L 1309.0

score 1309.0

ident 87.4

Genomic_Match_Length 189

Repeat_Class LTR

Match_Length 189

Match_Range 15128-15317

Repeat_Length 15624

65853 66042 RB-GYPSODE1_I GYPSODE1_I 299.0

score 299.0

ident 67.3

Genomic_Match_Length 232

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 236

Match_Range 781-1017

Repeat_Length 5142

66314 66546 RB-GYPSODE1_I GYPSODE1_I 4645.0

score 4645.0

ident 69.0

Genomic_Match_Length 2779

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 2831

Match_Range 1662-4493

Repeat_Length 5142

67192 69971 RB-GYPSODE1_I GYPSODE1_I 336.0

score 336.0

ident 73.1

Genomic_Match_Length 139

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 135

Match_Range 5001-5136

Repeat_Length 5142

69949 70088 RB-GYPSODE1_LTR GYPSODE1_LTR 284.0

score 284.0

ident 83.6

Genomic_Match_Length 62

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 63

Match_Range 2898-2961

Repeat_Length 2963

73270 73332 RB-GYLES1_LTR GYLES1_LTR 1403.0

score 1403.0

ident 78.5

Genomic_Match_Length 557

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 538

Match_Range 247-785

Repeat_Length 785

74415 73858 RB-FRSiOTOT00000009 FRSiOTOT00000009 228.0

score 228.0

ident 71.0

Genomic_Match_Length 12

Repeat_Class Other/Simple

Match_Length 58

Match_Range 731-789

Repeat_Length 832

77555 77567 RB-ATGP2LTR ATGP2LTR 246.0

score 246.0

ident 72.5

Genomic_Match_Length 82

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 79

Match_Range 326-405

Repeat_Length 1287

77568 77650 RB-FRSiOTOT00000009 FRSiOTOT00000009 228.0

score 228.0

ident 71.0

Genomic_Match_Length 6

Repeat_Class Other/Simple

Match_Length 29

Match_Range 790-819

Repeat_Length 832

77651 77657 RB-TOPSCOTCH_LP_I TOPSCOTCH_LP_I 355.0

score 355.0

ident 65.5

Genomic_Match_Length 141

Repeat_Class LTR/Copia

Match_Length 141

Match_Range 171-312

Repeat_Length 4616

81398 81257 RB-PRSiTETNOOT00005 PRSiTETNOOT00005 425.0

score 425.0

ident 82.7

Genomic_Match_Length 74

Repeat_Class DNA

Match_Length 74

Match_Range 1589-1663

Repeat_Length 1663

82430 82504 RB-FRSiOTOT00000009 FRSiOTOT00000009 644.0

score 644.0

ident 75.6

Genomic_Match_Length 300

Repeat_Class Other/Simple

Match_Length 303

Match_Range 1-304

Repeat_Length 304

82504 82804 RB-FRSiOTOT00000009 FRSiOTOT00000009 268.0

score 268.0

ident 73.4

Genomic_Match_Length 226

Repeat_Class Other/Simple

Match_Length 239

Match_Range 646-885

Repeat_Length 885

83296 83522 RB-TORTL1 TORTL1 1675.0

score 1675.0

ident 67.9

Genomic_Match_Length 1574

Repeat_Class LTR/Copia

Match_Length 3679

Match_Range 2439-6118

Repeat_Length 9695

88661 87087 RB-TOPIE1_LE_I TOPIE1_LE_I 1457.0

score 1457.0

ident 71.2

Genomic_Match_Length 1026

Repeat_Class LTR/Copia

Match_Length 1016

Match_Range 3-1019

Repeat_Length 3201

90458 89432 RB-HELITRON7_OS HELITRON7_OS 484.0

score 484.0

ident 87.4

Genomic_Match_Length 149

Repeat_Class RC/Helitron

Match_Length 233

Match_Range 1444-1677

Repeat_Length 10153

98966 99115 RB-GYCUME1_LTR GYCUME1_LTR 260.0

score 260.0

ident 91.6

Genomic_Match_Length 142

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 134

Match_Range 305-439

Repeat_Length 2646

99169 99027 RB-GYCUME1_LTR GYCUME1_LTR 260.0

score 260.0

ident 91.6

Genomic_Match_Length 142

Repeat_Class LTR/Gypsy

Match_Length 134

Match_Range 305-439

Repeat_Length 2646

99169 99027