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Tomato locus glutamate receptor-like 2.6
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Genomic sequence
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| unprocessed genomic sequence region underlying this gene |
>Solyc08g006500.2 SL2.50ch08:1096757..1106781
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Ontology terms
Ontology terms
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>Solyc08g006500.2.1 Glutamate-gated kainate-type ion channel receptor subunit GluR5 (AHRD V1 **** B9HB97_POPTR); contains Interpro domain(s) IPR017103 Ionotropic glutamate-like receptor, plant
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SGN Unigenes
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AB623200 Solanum lycopersicum SlGLR2.6 gene for glutamate receptor 2.6, complete cds.
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Characterisation of 13 glutamate receptor-like genes encoded in the tomato genome by structure, phylogeny and expression profiles.
Gene (2011)
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Glutamate receptor-like genes (GLRs) are intimately associated with plant development, defence responses and signalling pathways. Structural and expression analyses of SlGLRs were performed to better characterise their roles in fruit development and metabolism. Utilising recently released tomato genomic sequence data, 15 GLRs were identified in the tomato genome (SlGLRs). Thirteen of these genes were represented by full-length sequences. Phylogenetic analysis of the SlGLRs and the AtGLRs indicates the occurrence of a tomato-specific clade (Clade I) that may have diverged prior to the evolving of other clades. Among the Clade II genes, five (SlGLR2.1, SlGLR2.2, SlGLR2.3, SlGLR2.4, and SlGLR2.5) were located proximally on chromosome 6, indicating possible gene duplication events. The expression level of four of these genes was low in all analysed samples. However, SlGLR2.2 expression level was notably higher, indicating that this gene may be functionally important. The results of this study may provide clues to the functions of the SlGLRs and enable future detailed characterisations of each gene.
Aouini, A. Matsukura, C. Ezura, H. Asamizu, E.
Gene.
2011.
().
.
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