Sol Genomics Network

>Solyc04g055000.2 SL2.50ch04:53533608..53530227 (sequence from reverse strand)
ATGGGTGATGAAAGGAAAACAGGTTGTGGCCTGTTGAACGCTGTTTTTGGAAGGAAAACTATGTGGACAAAAAGATCGACATCAACAGGTTCGCTTCCAACTCCAAATTCCAGCAATGGTAACAATTTAACGCGATCATCTAGTACTCAAAATTCTAAAAAGCATCGGAATGGATCCAACGAGGCTTTTTTAGACAACGAGAAACAAGCTGATAGGATCATACCAAGACCTAATCCAAATCAATCCAAAGTAGCTGCGAATAAGGGTAATGTGCAAGGTGCTGCTGCTGCACCTGTTTATAATCAGCAGAAAACTAATGGTCAAGGGTATAATAATCAAGGAAGAAAAGTAGTTCCGCCATCAACCGGGATATCAGGGGAGCTTGAAAACATGATACAAGATCATCAAAGATCAAATGGTGCTAATACATTAGTTCGTGCATCGTCTAGCAATGTGATGTTGTTTGGTAATTTGGGTAACATAAGGCAGCAAGGTGGGGGCAATGCTACAACAACTTCAACAGCGAATCATGTTCTTGATTATTTACCAAGAACGGCTAAAGAAGAACCACAACAACAACCATCTCAGAATGGGAAATACCCGACGAGTGTTATGGGTAATGTAGTAAAGAAAAAGGGTGATCAAGAACAGGGGAAAACAGGGGGCTCTGTTTCCCTTTGTCGCGCTTTATCCACTAGAATGGACCCTGAGCAATTGAAGATTCTTGGAAATGAAGATTACAAGAATGGAAGATTTGCTGAGGCTTTAGCTTTGTATGATGCTGCAATTTCAATTGATCCAAATAAGGCTTCTTATCGAAGCAACAAATCCGCTGCTTTGACTGCTTTAGGAAGGCTTCTAGAAGCTGTTTTTGAGTGCAGAGAAGCTATATCAATTGATCCTCATTATCAAAGAGCTCATAATCGTTTGGCCACTCTATGTGTCAGGTAAATGTGACAAAAAAATAAATCATTTCGTCGTTAATTTCATTATATTATTATTACAATTGTTGAAATGACCAATGTTTTCGTGTTTAGATTAGGAGATACAGAGAAAGCTATGTACCATTACAAACTAGCTGCATCAGAAGCTGATCCTGATGTTGTGACAAAGTCTAAATCTATTCAAATGCATCTTAGCAAGTGTACTGAAGCGAAGAGGCAAAGAGATTGGAACACTCTTCTTAAAGAATCTGCCCTCGCCATATCGGCTGGTGCAGATTCTGCACCACAGGTTAACTATCTACGCATTAAAAAACCATACCAAATTGTTCTTTTCTCTAGTGTCATGAGCTAAACTTTTTTTTTTTTTGGTCCTTTATGGATAACAAAAAAAAGATATTTGCTTTGAAAGCGGAGGCATTGGTGAAGCTCCATAGATACCATGAAGCAGATCAAACTCTGAAGCATGGTCCGAATTTTGATATCGATGAATGTATAAAGTTCTTTGGCCCTATTGGCAACGCAGGCTTGTTAGTCATTCAAGCTCAAGTTGACATGGCTGCTGGCAGGTTAGTTAGTTCTCATGTTTTGAATTATTCAACATTTAATTAAAAATTGTATTCAATCTAGGTCATAGTTGTGGTCCTAAAGATGCCAATAACCAAGATTAGGACAGAAAGTAAAGACTTAATTGGTATTAGATTATTGTCAATAAATAAAGTGTTTGGTTTAGCTAACAACTCAAAAGGAGAAATGTTTGTAGGAGAAAAGAGAAACCAAAAAGAAGAGTACTTGAGTATGTATTTGGTAGTTAGGTTCAATTTCACCCTCAATCAATATTCATGCTTGACATCCATGCTAACACGAGTAGTTTAAAAACCTTTTACAAGGTTTTCAAGATATTGCTTATTAATAGTCCTTCTATGGATAATAAAATACAAAATAATGTGACTCATTCAGTCATATCATCTTAAATAAAATACAAAATAACAGACACAATCAATAAGTTATGTCCCTATTTCAAACTAATTGAACTCGGCCATACGAATGCTATAAATATGTATGCCATAAATCAACTAAACACATTATATTTTCATTGTTACTATCAACTTATTATGATTGCTACATGATAGGATTGACGATGCCCTAGCAGCGGCTCAACGAGCATCGCAACTAGATGGGAATAACAAGGAAGTGAACATGATAGTTAGGAGGACAAGGGGAGTAGCAAGTGCTAGAACAAAGGGAAATGAGTTGTTTAAAGGTGGAAAATATGGAGATGCTAGTGTTGCTTATGGTGAAGGACTAGAGCATGATCCACACAACTCAGTTTTATTGTGCAACAGAGCAGCTTGCAGATCAAAACTTGGCCAATTTGAGAAAGCACTTGAGGATTGCAATACTGCCCTTAATGTTAGACCATCTTTCACCAAAGCTAGGTTGAGGAAGGCTGATTGTTACTTTAAGGTAACTTTTCATTTTCCTTATGCTATGATACTAAGTTTAACAGTTATCTTTGTAATAATTTTTCACTATAATAATCACATTCTATATGAAATCGGTCTTACACGTTATATTATATGTCCTCTAGCTACATTTTCTATCATAACCAACAATGTATTATAAAGGCATAACACATAAATATGACCCTAAATTTGGCATCAGCTGACAACTATGACCTTTAACTTTGGATGTGCACAAGTAGACACTTAAACTTGTATAAAATTAAACAAATAGACACATTCGTCCTACATGGCACCCTAGATGACAAATTTATGTCATATGTGTGTCTACTTGTTCAATTTTATATAAGTTCAAATGACTACTTGTGCAGAATCAAAGTTGAAGGGCATAATTATCCGCTGAAAGGATCATTTTTATGTATCATTAGTTTTTCTTTTTTAATATTAAACAATCATGATATGACATGTCCATGGTAGCTACGTCCCTAAAAAATAGTTGGCCTATTGGTTCTATACATTATCGTTTGACAGGGCTTTTAACAACATTACTGAATATGGTGTATTAATAATGCTGGTATTAGATATATTTGTATCAATTATGTAGAGATTATTTTTTATGCAGTGTTAGATTTAGTATATGATAGCATTTAGTTGATTTTTTTTTTCTTTGATTGAAATAATTGAAGATTTTGATGTATATTATTTTATGTGTGATATACTAGATGGGAAAATGGGAAGCATGCGTACAAGAATGTGAAGTGTTGATAAAGGAGACACCAGAAAATGAGGATGTGGGACAAATGATTAAGGATGCCCAACAACAACTCAAAAAATGAGGAATTTGTCAAAGACATGAAGAGCATGAACACCACACAATGACATTTATGGTTGTCCATAACAAAGTAATTTGAATTGTATCATCACTTGTTTGTTCAATTCCAATCCCTCCATAAAAGGAAACAAAAGGGTCAAATATAG

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Get flanking sequences on SL2.50ch04

mRNA Solyc04g055000.2.1

Ontology terms

terms associated with this mRNA

GO:0030544 – Hsp70 protein binding

cDNA sequence

spliced cDNA sequence, including UTRs

>Solyc04g055000.2.1 Tetratricopeptide repeat protein 4 homolog (AHRD V1 *--- TTC4_DICDI); contains Interpro domain(s) IPR015609 Molecular chaperone, heat shock protein, Hsp40, DnaJ
ATGGGTGATGAAAGGAAAACAGGTTGTGGCCTGTTGAACGCTGTTTTTGGAAGGAAAACTATGTGGACAAAAAGATCGACATCAACAGGTTCGCTTCCAACTCCAAATTCCAGCAATGGTAACAATTTAACGCGATCATCTAGTACTCAAAATTCTAAAAAGCATCGGAATGGATCCAACGAGGCTTTTTTAGACAACGAGAAACAAGCTGATAGGATCATACCAAGACCTAATCCAAATCAATCCAAAGTAGCTGCGAATAAGGGTAATGTGCAAGGTGCTGCTGCTGCACCTGTTTATAATCAGCAGAAAACTAATGGTCAAGGGTATAATAATCAAGGAAGAAAAGTAGTTCCGCCATCAACCGGGATATCAGGGGAGCTTGAAAACATGATACAAGATCATCAAAGATCAAATGGTGCTAATACATTAGTTCGTGCATCGTCTAGCAATGTGATGTTGTTTGGTAATTTGGGTAACATAAGGCAGCAAGGTGGGGGCAATGCTACAACAACTTCAACAGCGAATCATGTTCTTGATTATTTACCAAGAACGGCTAAAGAAGAACCACAACAACAACCATCTCAGAATGGGAAATACCCGACGAGTGTTATGGGTAATGTAGTAAAGAAAAAGGGTGATCAAGAACAGGGGAAAACAGGGGGCTCTGTTTCCCTTTGTCGCGCTTTATCCACTAGAATGGACCCTGAGCAATTGAAGATTCTTGGAAATGAAGATTACAAGAATGGAAGATTTGCTGAGGCTTTAGCTTTGTATGATGCTGCAATTTCAATTGATCCAAATAAGGCTTCTTATCGAAGCAACAAATCCGCTGCTTTGACTGCTTTAGGAAGGCTTCTAGAAGCTGTTTTTGAGTGCAGAGAAGCTATATCAATTGATCCTCATTATCAAAGAGCTCATAATCGTTTGGCCACTCTATGTGTCAGATTAGGAGATACAGAGAAAGCTATGTACCATTACAAACTAGCTGCATCAGAAGCTGATCCTGATGTTGTGACAAAGTCTAAATCTATTCAAATGCATCTTAGCAAGTGTACTGAAGCGAAGAGGCAAAGAGATTGGAACACTCTTCTTAAAGAATCTGCCCTCGCCATATCGGCTGGTGCAGATTCTGCACCACAGATATTTGCTTTGAAAGCGGAGGCATTGGTGAAGCTCCATAGATACCATGAAGCAGATCAAACTCTGAAGCATGGTCCGAATTTTGATATCGATGAATGTATAAAGTTCTTTGGCCCTATTGGCAACGCAGGCTTGTTAGTCATTCAAGCTCAAGTTGACATGGCTGCTGGCAGGATTGACGATGCCCTAGCAGCGGCTCAACGAGCATCGCAACTAGATGGGAATAACAAGGAAGTGAACATGATAGTTAGGAGGACAAGGGGAGTAGCAAGTGCTAGAACAAAGGGAAATGAGTTGTTTAAAGGTGGAAAATATGGAGATGCTAGTGTTGCTTATGGTGAAGGACTAGAGCATGATCCACACAACTCAGTTTTATTGTGCAACAGAGCAGCTTGCAGATCAAAACTTGGCCAATTTGAGAAAGCACTTGAGGATTGCAATACTGCCCTTAATGTTAGACCATCTTTCACCAAAGCTAGGTTGAGGAAGGCTGATTGTTACTTTAAGATGGGAAAATGGGAAGCATGCGTACAAGAATGTGAAGTGTTGATAAAGGAGACACCAGAAAATGAGGATGTGGGACAAATGATTAAGGATGCCCAACAACAACTCAAAAAATGAGGAATTTGTCAAAGACATGAAGAGCATGAACACCACACAATGACATTTATGGTTGTCCATAACAAAGTAATTTGAATTGTATCATCACTTGTTTGTTCAATTCCAATCCCTCCATAAAAGGAAACAAAAGGGTCAAATATAG

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Protein sequence

translated polypeptide sequence