Solanum lycopersicum mRNA Solyc01g111080.2.1
mRNA details
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| Name | Type |
Length
23,220
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Organism |
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Description
Gibberellin-regulated protein 2 (AHRD V1 *--- B6UGG6_MAIZE); contains Interpro domain(s) IPR003854 Gibberellin regulated protein
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Location(s)
SL2.50ch01:97442484..97466164
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| Ontology term(s) |
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GFF source
ITAG_eugene
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- Length
- 23681
- Sifter term
- GO:0005515
mRNA sequence
| spliced mRNA sequence, including UTRs |
>Solyc01g111080.2.1 Gibberellin-regulated protein 2 (AHRD V1 *--- B6UGG6_MAIZE); contains Interpro domain(s) IPR003854 Gibberellin regulated protein
TTTCATAAATCAATTTTTTGGAGAAAAAATCTCAAAAATATTTCAAATTCCAATGGCCATTTCTAAAGCTCTCTTTGCTTCATTACTTCTCTCCTTGCTCCTTCTCGAGCAAGTCCAATCTATTCAGACTGATCAAGTGAGCAGCAATGCTATTTCTGAAGGCGCTGATTCCTACAAGAAAATTGACTGTGGGGGAGCTTGTGCAGCAAGGTGCCGATTATCATCAAGGCCAAGATTGTGTCATAGGGCATGTGGAACTTGTTGTGCTAGATGCAACTGTGTTCCTCCTGGTACTTCTGGCAACACTGAGACTTGCCCTTGCTATGCCAGTTTGACTACTCATGGCAACAAACGTAAATGCCCTTAAATTTCTTCTAAAAATATCGTATATCGTGTGATTACCACGGATATGTTATTATTGTAGTGTATTATTTTGTCATATATTGTGTCAATAATCAAAATCCAGTAAAATATCTTTAGCGTGGGTAATTTATTTTTTGGGGTGTTGTCTTTGTAATTTTGAGGAAATTTTATTTGTGTGTTGATTAGTACATCTGGTGTAATATTTATTCTGGTTTGCATTGTATTGTATAATAAGATGAGGAATAAATGAAGTTTGAGTATATTATTTTATATGTGTTTTATTCTTGGATGTTAAGTTTTATAGTACGGAATTAAATAAAGATTATTTGTCTCATTCGCAGCTCATTATTTTTCATACTATCGCATTGCTTCTAATATACTTCTAGACACGAATGGTTTAAAAGAACTTTTATAACATCATGTTACCTGTGGTATTGAATACATCAGTAAATGAAAATTATAAAACAAATTGAACCAGAAGGAATATAGTAAACACCAAAAAAAAAAAGTTCAACAATTGGACTTGCATCGAGTACTCTTTTAACATATTCGAATGATGAGACTCTTTTTCGTTTATTTTGTCGAAAAATTTTCAAAGATCAGTGACGCACGATTCAAATAGTGAGATTCTTTGTAAGAATACCCTCAAAGGTAATCCCAGGGCCAAATGCGAGAATCAATCCCCAATCAGTGATGTCTTTTTTCTCCTCCAACATGTATTCCAGCACATACACAATTGTATTGCTACTTGCATTACCATAATCTGCCAAAGCTCTTCTACTAGCACTCAATTTATCAGGAGACAAATCTAGCTTTTTCTCTAGCCTGTTTAAAATAGCAGGACCACCTGGATGAACTGCCCAAAACAATTTGTTGTATTCTCTATCTTTGATTCCAGAAATATTTATTAACTTGTCACAGAAATCCTCAATATTATCTTCAATTATCTGAGGTAGTTCCCTTTCTAGCTTGAAGCTAATTCCCTCTTCAGTAAGCCTGCAAATTTAGAGGTGGCTAAATTAATCTATTAAAGTAATTTGTCTAAGTTTAAACAGGCTTGACTGAGGCTTGGACAATCCTCCTCCCTATAAGCTAGTTAGTTTTTGGGGCCATAAGTTAGGCCTATGACTTAATTTAACAAATTTATCAGAGCAGAGCTCGTCTCACTTGATGTTGAGATCTCCAAAATCAAAATTGTCCACGCACCAGATACTGAGCACTGGGAGTGAGATGGGGTGTTAAAGAATGACAAAAATCTCACATGATTAATGAGATGGGTGTAAAGCTTGGATAATTCTCTTCTCTATGAGCTAACTTTTGGGGCATGAGTTAAGTGTAAGACTTAATTTAACAGGTTATAACATTGGTTTCTCAGAACTAAAAATATACTCGCTATACCTGCCATCAATGATCTTTTCTGTATCAGGCAAGAAATGCTGAATAGCAGTATGCAATTCAAAAAGAGGTCTTTCGATATCTCGAATCGGGTTAGATCCGATTATCATAGCTCCAGCACCATCACCAAAAAGAGCAACACCAACTAAATCATATGGCCTATCAACACTAGGTGGTTTGAACCCAATTATAGTAGTCTCTGAAGTAGCTAACAGGACTCTGCTTCCTGGATTATTCTCAGCAATGTCCTTAGCAACACGAAGGCCCGCCACACCACCAGAACAACCAGCAAAATACAGCATAACACGTTTAGTTTCCGGGTTTAAACCAAGTCCTTTGGCTAAGTAAAGATCTCCTCCTGGTAATCTAGCTTCACTTGAAGAAACATAGACTACATGTGTAATGTCTGAAATTGGCCTTCCCCATTTCTTAATACAAGATTGTGAGGCTTCAATTGCCATTTCTGTAACTGCTGCATTGCATATGTCTAATCTTTGTTTTACTGTTGGAAGTCCTTCAACTGCTAGTTCAGGATATTTCTTTAGGATCTCCTCTGACATTACCACGTACCGCGTTTTCACTGTAGTCGTCTTGCCTGCAAAGTTAAAGGAAACGAAGAACAAGATAATTAAATCCGCTCAAGAGGCAAATTCAGGATCCAAAAAAATATTGCACTAACTAGTTATTCATGAACATAAAGTATCTATAAAATATATGAACTATGTTTAGGCAGGTAGCTGGAAGACGCAAAAAATGGGCATTAGACTTGTAAGTTAATATCAAAATTTTAATCATGAGATAAAAATTGTTTGATACGAGACATCAACACATTCTCTCAATCAAAGGGCATTGGACTTGTAACTTAATCTCAACAAGAAGCATGAATTACTCATGAGTCTGACTCTGATGTCATTGTTAAGAAAATGAACCTCAAAAGCTAGCTCACGAGAAGAGGATTACCCAAGATAATATAACGAGAAAACAATCATGCTATCAGCACCTTACAGCTGCTAAATAGATGTTTACGGTTAAAAGAGTGAAAGAAAGGAAAAGATTACAGAGTCGAGTGAGCCTCTGCTTGAGTTCTGGATCATCACAGTTGGTGTTTTTGAAATAGCCATCAACCAAAAACTCTTGCATAACAAGCTGATGAGGGAAAGCTTTGCCCAGAGCAAGAATGGTGGCGTTTCCAAAGTTGATTTCATTCCTTCCTTCCATTTTCTCTAATATCCCCATTTACTCACTACTTGATCCTTTGAAGGTGGATATAACTTTGTGTTTATAACACGTACTAAATAGTTTTATGTTACTCAATACTTGCCACTTTGAAGTTGCACAACTTTCTATTTATAACAGGTATTGAATAGTTTATGTTAGATAATTTAAGCGGTTTTAGATGTATCATCAAACTGTAGAGGGGCTCAAATATTGTTGACTATTGAGTTTTTGGGGATTAGTTGAGGAACAAGATGTTCATGATTTTGACAGTCCACAAGTTCTATCTCAATTTAGTAATGTTGAATCTTGATACGTGGTTGGTGGCATTCTGGTTAGAAGAAGTTCAAGATACAACCTTGAGCAGAATGAATCTGTTACTGCAAGAACAAATAGACACAAATAATTCCCTCACGTAATGTGCAGTCTAGGCTCTTTTATGAGTTGGAACTTTTGCCCTACTCATAGCTCACCCGCTCTTGAAACAATTACTAAGCCACTAATAATGATACAACATCATTAATTGCGATACGAAAGTCGACAATTAAAATCAATGTATTTAACTAAAAAAATTAAACAATCTCATGATCAATAGGAAAGAGCAAATGGAGGTTGTAAACTTTGAACCTCAAAGGAACTTAAACGTTGTTCAAGTGCTTTGCAGATAATTTCCCAACTAGTATATAGGAACACCGCTTTCTTCCCTGACTAAAATTTCCATAAATCTTATAACTCATTCATTAGTTTTACAACGATTACAGAATATCAGCTATGTTTAGAGAAACTAGCTGGAACAATGTGGGCCGATGAATTGTACACCTGGACGAAAGTGGACATATCGAACCAACATTAAATTTCAGAGTGACATCTTGATACACTAATTTACCATAATATAATAAAAATTAGAGTCACTGGTGACTTAGTATAATGCAGTTCGAAGGAAGTAACATTCTCACTGCCCAGAAGTCTAATAATTGCCTAGACACAAATGTCATAGGTTCTTTCCACTGAAGCATGCACGAGATGAAATAAGATTAGATCACAGCTCCACTAAGCACTTCCCACTGATGTAATCAACAACTTGGGTGGCAGTTTGATCAAGTGCAGCGGTTACTGCCACCAGATTTTCCAAAAATTCTTCCGGTGTTGGTTTATCACCATCCACAATGTCTGTCACAGCTTTCACAAAAATGGCAGGAACTTTTAACAGATCTGCCACATAAGCTACGGCTGCTCCCTAAAACCCAAAAAACAAATTGGAACAGAAAAAGGAGTGAAAATGTATATCCTAACAAGAAAGAGCAAGGCTAAATGAGCACAGTGATTAGGAAACAAAACAGAAGTACATTGAACACTTGGCACAATTGCAGTCTTGAATTAGAGGGGAAAGACGGAAGCTACATTGAAAACTTGGCACAATTTCAGTCTTGAATTAGGTTTCCAAATATCATGCCTAGCACTAGCATCAAACATGCCTGGGAGGGAACAAGTTATTTTTTATTATTGAAAAGGTCAACTTTGAGATATTAAATATCTTAGACGACAATCTTTCTCAAAAAAAAAAAAAATATATCTTAGACAACAAGAGTTTATCTAATCGACGAAGTATGTGGAGCTCAAGGACAACCAGGAAAGACATGTTGATGGCCAGAATAACACTATTTGACCAATCTCTACAGGGGACTACAGAATGACCAGCGGACTAATTTCTCCAAGTCTTCACAAAAGCAATCATACTAAACTTAGACATTTAGATGTTACCTCCATGTCTTTGATTGTTGCGTCATTTGCAATGATAGATGCTTCATCCATTGGAGACATATCTAGAGAGTCACCAGTAGACAGCTTGCCTACCTGTAATGAGGAGATAAATTACATGACAAATTAATTCAATGTCTTTTTTAATCAGGAAAGCTTTTTGCTATTAAATATACCTAATGACTTTCCAAGTACATGGGCACTATAAGCTAGGCAGGAAACAATCAGATGTTATTGTGGAAGAAAGTATATACATGAACATTAACAAG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Genomic sequence(s)
| unprocessed genomic sequence underlying each location of this mRNA |
Related features
|
| Features that derive from this mRNA |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| polypeptide | Solyc01g111080.2.1 | SL2.50ch01:97465336..97466112 | 105 | - | n/a |
Add items to a list:
| Features this mRNA is a part of |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| gene | Solyc01g111080.2 | SL2.50ch01:97442484..97466164 | 23,681 | - | n/a |
Add items to a list:
| Features that are parts of this mRNA |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| exon | exon:Solyc01g111080.2.1.1 | SL2.50ch01:97466026..97466164 | 139 | - | n/a |
| exon | exon:Solyc01g111080.2.1.2 | SL2.50ch01:97465726..97465771 | 46 | - | 2 |
| exon | exon:Solyc01g111080.2.1.3 | SL2.50ch01:97442484..97465518 | 23,035 | - | n/a |
| intron | intron:Solyc01g111080.2.1.2 | SL2.50ch01:97465772..97466025 | n/a | - | n/a |
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