Solanum lycopersicum mRNA Solyc05g005940.2.1

mRNA details  
Name
Solyc05g005940.2.1
Type
mRNA
Length
3,118
Organism
Solanum lycopersicum
Description
Solute carrier family 15 member 4 (AHRD V1 **-- S15A4_XENLA); contains Interpro domain(s) IPR000109 TGF-beta receptor, type I/II extracellular region
Location(s)
SL2.50ch05:714135..717511
Ontology term(s)
GFF source
ITAG_eugene
From BOGAS
1
Interpro2go term
GO:0016020
Length
3377
Nb exon
4
Sifter term
  • GO:0080054
  • GO:0042936
mRNA sequence spliced mRNA sequence, including UTRs 
>Solyc05g005940.2.1 Solute carrier family 15 member 4 (AHRD V1 **-- S15A4_XENLA); contains Interpro domain(s) IPR000109 TGF-beta receptor, type I/II extracellular region

TACATCTTGTGTGACAATTCACATCTATATAATGTCCTACGTGTAATATGTTCTACATAATTATAATGGTTGAAGTTAGAAAAAATATATTCTATAAAGGCATAATACATAGATATGACTTTAAAGTTTGAACATGCACAAGTAGACACTTAAACTTGTATAAAATTAAGAAAATGAACACATTAATCCTAAATGACATCCTATGTGTATCATGTCATGTAGGATATTTGTATCTATTTTTTCAATTTAATAATAATTTAAGTGTCTACTTGTGTACATTTAAAACTGAAAAACAATTGTTTGTTGACGTTAAGTTAAAAATCGTGTTTATTTATTATGTGTTTTATGAACAAACATAGATTTTGAAATTTCTTAACTAAAAAAAAAAAGAAGATACTCATGGTCAAATGGGGGGGCTTGAAATGGTGCTTCCAATATCCGATAAAAAAAAATGACTCGAATTAAATAAGCTATTGCCTTGTGATTGATATTGAGTTGACATGGTTGGCTACAATTATTAATGTGCATTGTTATGATTGTTCTTATTTCACTATATTAAGTATTTTTTTATTTTAATTTATGTGATATTTTTAAATAATTTAGATTTGAGCGAAGTTTAGTATGAAAGTTTAATTTTTAAAAATAAAATTTACATATATGTATAATATGTAAACAATATTATATATAAGTCATAATATAAACAAATTAAATTATTTAAAAAATATATGAAAAAATTACGATTTAAAATAAACTTGCTTAAATCTCAAAATTCAAAACATGTCACACAAGTTAAGTCGGAGAAAAATATTGTTTTCATTTTAAGACCTTCGACATATTTAATATAATCAATCAAATAATTGAGAAAAGATAATATTAGTATAATTAATATCAAACATAACTAACTCCATGTCACTTTGTATTTTCCTCTTTTAGGTGAGACAAAACAAAACTAGACCATTTTTAAATTATTACATATTCATTGATAACATTAATTATTTATCAATTATCACATCTAAAATATTTCATTCGTTTCATTTTACTTGTTATAATAAAATTTGACATATTTATTAAGAAAATTCTATGCTTTCAGAATATTGAATGAGAATCCGTGATTCTTATTTAATATTTTGGTAGCAATAAATTTAAGGGTGATAAATGTGGGCATGGGTTTTAGTGTTTTTTTCTCTGTCTCTTTGTCTCTGTTAATCATATATTAGAGGCAAGAAGAGAAGTGAAGAGGAAACAGAGAACGAAACTGAAAATGGGCACAGAATCACAAGTTGAAGTGAACACAAGAAAGGGTGGTCTTAGAACCATGCCATTCATCATTATGAATGAAGCATTTGAAATGATAGCAAGTTATGGTTCACAAACAAATCTGATAATTTATTTGATGACATATTATAACATGAGTGCTGCTACGGGTACTAGTATTATTGGTATATGGGGCGCATTTTCAAGTGGATTAGCTATTGTTGGGGCGATTATTGCTGATTGTTATTGGGGTCGATTTAATGCTGTTGCCTATGGAACCATCTTCACTTTTATTGGAATGGTTATTCTTTGGCTAACATCAATGATTCCGCAACTCACGACTTTGGCCTGTTCTCAGTTGCAACATGTTTGTAATGGACCAACAGCATTCCAGCTTGCTGTTCTGTTTTCATCTTTTGTGTTTACGTCTATCGGAGCTGGTTTTGTTAGACCTTGTTCCATAATGTTTGGTGCTGATCAATTGGAACAAAAAGGGAACCCTAAGAATGAGAAGATTATTGAAAGCTATTTCAATTGGTACTATGCTAGCACAGGTGTTTCAACTATGATTGCAGTTACTGTAATTATTTATATTCAAGATCGTTACGGTTGGCAAGTTGGCTTTGGTGTCCCTGTTATACTCATGGTTTTGTCTATCTCAACGTTCCTAATCGGTTCTCCTCTTTATATCAAAGTGAAAACTGATACAAACAACTTGCTAGTAGGATTGTCCCAAGCATGTGTAGCAGCATTTAGAAAAAGAAAAACCCCTCTTTCATTGACTGATTGTGATGACTACTACCATTCGCCATATGAAACAGAGGTCTTAACGCCATCAAAAGACTTCAGGTGTTTAAATAGAGCTTGTATGATTGAAGATCCTGAAAGAGATTTGAATCCTGATGGATCAGTTTCGGATCCTTGGAATCTATGTAGTGTGGAACGAGTTGAATCACTCAAGGCTCTTATTAGAATACTTCCTATGTGGTCTACTGGTTTTATGATGTTTGTAGACATGAATGTATTTGCATTTGCTGTACTTCAAACAAAAACCATGGATAGACATATCTTCCCGCACTTTGAAGTACCAGCAGCATCATTCAGTGTGTTCTTGATTATTGCTTTAACAATCTGGATTACTTTCTACGATCGTGTTTTGGTCCCTTTGCTATCAAAATATACTGGAAGGCCAAGAGGGCTAAGTCCTGTTACCCGAATGGGAATTGGGTTAACAGTCTCTTGTATGTCTATGGCATTGTCAGCAATAACAGAAAGCATAAGACGAAAAAGGGCAATAGCGGAAGGGCATGAAGACGATCCAAATGCTTTAGTAAACATGTCTGCTATGTGGTTCGTGCCACAGTATGCACTACTCGGAATAGCTGAGGCTACCCATGGAGTTGGACAGATTGAGTTTTTCTACACTCTATTACCGAAAAGCATGGCAAGCATCGCGTCAGCTATGTACACCGTTGGGACTGCTGTGTCGAGTTTGACTGGAAGTATTCTGGTGAGTAGTGAAGATTGGCTTACATCAAGGGGAGGTAAAACGAGCTGGCTTTCGAGCAACATTAATAAGGGTCACCTGGATTACCATTTCTGGGTGCTTGCTTCTATGAGTTTTCTCAACCTGCTATATTTTCTAGTTGTCTGCCGGTTTTATGATACTGGGAAGGATGAGATGAGTAGATCACCTCATGTGGCTGATGAGAAAGAATGCGATTATAGACTCTTACATGAATCTTGATGATATATTGTATTGCATCCTTGAATGATCCAACAACTACTAATTGAGTTGGACAATAAAGTTTTTCATATGTTAAGACCTCTACAATCTTCATCTATACATATATTTTTTTATGTA
Genomic sequence(s) unprocessed genomic sequence underlying each location of this mRNA 
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Features that derive from this mRNA 
TypeNameLocationLengthStrandPhase
polypeptideSolyc05g005940.2.1SL2.50ch05:714251..716250580-n/a
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Features this mRNA is a part of 
TypeNameLocationLengthStrandPhase
geneSolyc05g005940.2SL2.50ch05:714135..7175113,377-n/a
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Features that are parts of this mRNA 
TypeNameLocationLengthStrandPhase
exonexon:Solyc05g005940.2.1.1SL2.50ch05:716181..7175111,331-2
exonexon:Solyc05g005940.2.1.2SL2.50ch05:715872..716089218-n/a
exonexon:Solyc05g005940.2.1.3SL2.50ch05:715233..715786554-1
exonexon:Solyc05g005940.2.1.4SL2.50ch05:714135..7151491,015-n/a
intronintron:Solyc05g005940.2.1.2SL2.50ch05:716090..716180n/a-n/a
intronintron:Solyc05g005940.2.1.3SL2.50ch05:715787..715871n/a-n/a
intronintron:Solyc05g005940.2.1.4SL2.50ch05:715150..715232n/a-n/a
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