Solanum lycopersicum mRNA Solyc09g007910.2.1

mRNA details  
Name
Solyc09g007910.2.1
Type
mRNA
Length
7,405
Organism
Solanum lycopersicum
Description
Phenylalanine ammonia-lyase (AHRD V1 **** B5LAW0_CAPAN); contains Interpro domain(s) IPR005922 Phenylalanine ammonia-lyase
Location(s)
SL2.50ch09:1429132..1437334
Ontology term(s)
GFF source
ITAG_eugene
From BOGAS
1
Interpro2go term
  • GO:0009058
  • GO:0005737
  • GO:0003824
Length
8203
Nb exon
3
Sifter term
  • GO:0004397
  • GO:0045548
mRNA sequence spliced mRNA sequence, including UTRs 
>Solyc09g007910.2.1 Phenylalanine ammonia-lyase (AHRD V1 **** B5LAW0_CAPAN); contains Interpro domain(s) IPR005922 Phenylalanine ammonia-lyase

CATAACAAAAATTTTTATAAGTTCACAACATTTTTTTTGTTATATAAAAATAATCTCTAGCCATTTTGTTTTCAGTAAAATTTCTCCATTACAAATCAAACCATTTTTTGTTGGTCCAATGGCATCATCAATTGTACAAAATGGACATGTTAATGGAGAAGCTATGGATTTATGTAAGAAATCAATTAATGTTAATGATCCATTGAATTGGGAAATGGCTGCTGAATCATTAAGAGGGAGTCATTTGGATGAAGTGAAAAAGATGGTGGATGAATTTAGAAAGCCAATTGTGAAACTTGGGGGTGAAACTTTAACAGTTGCACAAGTTGCATCCATTGCAAATGTTGATAACAAAAGTAATGGGGTCAAAGTGGAACTTTCTGAAAGTGCAAGGGCTGGTGTGAAAGCTAGTAGTGATTGGGTAATGGATAGTATGGGGAAAGGTACAGATAGTTACGGTGTGACTACTGGATTTGGTGCAACATCTCATAGAAGAACTAAAAATGGTGGTGCACTTCAAAAGGAACTTATTAGGTTCTTAAATGCTGGAGTTTTTGGAAATGGAACAGAATCATCTCATACTTTGCCACATTCAGCAACAAGGGCAGCTATGCTTGTTAGGATCAACACTTTGCTTCAAGGCTACTCTGGCATTAGATTTGAAATCTTGGAAGCAATTACTAAGTTGATCAACAGCAACATTACCCCGTGTTTGCCCCTCCGTGGGACGATCACTGCCTCGGGTGATCTTGTCCCGTTGTCATACATTGCTGGTTTGCTCACTGGCAGGCCTAATTCAAAGGCTGTTGGACCTAATGGCGAGAAGCTTAATGCTGAGGAAGCGTTTCATGTGGCTGGTGTTACTAGTGGATTTTTCGAGTTGCAGCCTAAGGAAGGACTTGCACTTGTGAATGGAACTGCAGTTGGTTCTGGTATGGCATCAATGGTACTGTTTGAGTCCAACATTCTTGCTGTCATGTCTGAAGTCTTGTCAGCGATTTTCGCTGAAGTGATGAACGGAAAGCCTGAATTCACTGACTATTTGACACACAAGTTGAAGCATCACCCTGGCCAGATTGAGGCTGCTGCTATTATGGAACACATTTTGGATGGCAGCTCTTATGTCAAAGAAGCTCAGAAGCTACATGAAATGGATCCTCTTCAAAAACCAAAGCAAGATCGTTATGCGCTCCGAACATCTCCACAATGGCTTGGACCTCAAATTGAAGTCATCCGTGCAGCAACTAAGATGATCGAGAGGGAAATCAACTCAGTGAACGACAATCCATTGATTGACGTTTCAAGAAACAAGGCCTTACATGGTGGCAACTTCCAAGGAACCCCTATCGGTGTGTCCATGGATAATACAAGATTGGCCCTTGCATCTATTGGGAAATTGATGTTTGCCCAATTCTCGGAGCTTGTCAACGACTATTACAACAATGGATTGCCATCTAATCTCACAGCAGGAAGGAATCCAAGCTTGGACTATGGTTTCAAAGGAGCTGAAATTGCGATGGCTTCTTACTGCTCGGAACTTCAATTCCTTGCAAATCCGGTGACTAACCACGTCCAAAGTGCCGAGCAACACAACCAAGATGTGAATTCGTTGGGCTTAATCTCAGCAAGGAAAACAGCTGAGGCTGTTGACATCTTGAAGCTAATGTCATCAACCTATCTCGTGGCGCTTTGCCAAGCTATCGACTTGAGGCATTTGGAGGAGAATTTGAAGAATGCTGTGAAAAACACTGTAAGCCAAGTAGCCAAAAAGACTCTGGCAATGGGTGCTAATGGCGAACTTCATCCAGCAAGATTCTGCGAAAAGGAATTGCTACAAGTGGTGGAAAGGGAATATTTGTTTACCTATGCTGATGACCCCTGCAGCTCCACCTACCCTTTGATGCAGAAGCTGAGACAAGTCCTTGTTGATCATGCAATGAAGAATGGTGAAAGTGAGAAGAATGTGAACAGCTCAATCTTCCAAAAGATTGTAGCTTTCGAGGACGAATTGAAGGCCGTGTTGCCTAAAGAAGTTGAGAGTGCAAGAGCTGTTGTTGAAAGTGGAAACCCTGCAATTCCTAACAGGATCACAGAATGTAGATCATATCCATTGTACAGGTTGGTTAGACAAGAAGTTGGAACAGAACTATTGACAGGTGAAAAAGTTCGATCGCCCGGTGAGGAGATTGATAAGGTATTCACAGCATTTTGCAATGGACAAATCATTGATCCATTGTTGGAGTGTCTCAAAAGCTGGAATGGTGCTCCTATTCCAATCTGCTAAATGTTTGTCAACTGTTACTTTCAAATTCTTTTTTTTACCTTACAGTAATTTACTATAATCATAATATCATTTTATTGTATTTTGGACCGTATGTAATATTGTCTATCAATATAAGATTTTTGCTATTAGATTGTTTAATCTTAAAAACAACATATTAGATGATTATCATTTAACATTAACAATAACCTACCCAATTTTATATTAAGATTTAACAATTTTTAATCACGCCCACTACGACAAAAACAGCTTTTAGCGATATTAAATATTGACATTGATAAACAGTGTTAAAGTTTTTACTGGTATTAGTTAAGTGTCATTAGAACCAATATCGCTAAAGACTTTAGCGGTAAAAATACATATTTAGCGGCAATTAAGAATTGACTTTCGCTAATGATCATTTTTACTATAGTGGCTTCGTCAAAGTGATTCATAGGTCATTTACGTAGTCATAAGTTTCTGCTATGGTAGTTTATAGTAAAACAACAATATCTTTTTTACTCCAAACTCAAAATAAGATAAACTCGGTGGCGTTGAAAAAAAATCCATAAAAATTTAACTTAATATCTCATAGACTACCTAATTCATTACGTAAGATATGATCATTTAAAGTTAACCTAACATCTTATATCAAAACTTAATCGATAAAAAATGATAGTTGGCAAAACAAAGAGTGTGGGGTCGGGATGACAATCAAGTGATATGGTTGGAGAAATGGTCACTTTCGTTAAAATTTATAATTTACTGTTCAATTTTTTTTAACGAAAGCTAAAGTACTAGTAGGTGATTTTTTTTAACGTACTAAAATATACATGCTTATATTAATGAAGATATCATATACGCATTTAAAATAATTGAAATATACGTAAATTAATTCGATCGTAAAATCATTAAAACATAATCTAGTCCACCCTGGCATGATAGAAGTATGTATTTATTACTCTTAAAAATAATTCTTGGTAGATTTTATGGACTTAAAGAGGACACGTTTGTCCACCCAATACACTTCAAAATAGTGTTTTTATTTTTAATTATGAAAGAATTTTAACTATTACTTAACTAACCATATAATTAATAGAAAAAATAAGTTAATATGCTATTGAAAGTTCAATTTTCTCTTAATAGATCAAAATAAACAGAGAATTTCATTTAATGGAAAGGTGCAATTTTTTAATGTATAATTTGAAATGGCTTAATATTACCTTTGTTATATTTTGGATTCATTCCTACTTTTGCTTTCGTATTTGTTTTTGTCATTAACGAAGTTTCAAGGAATATTCACAATAATTTACATAATTTTAAAATTGTGATCTAACATTTCTCAAAAGAATTACCAATTTGCTCAAAAAAATATTCTTAAGTTATGATTTGAAAGTGATATTCACTTTTGTTGCTTCCACTTCTTTGTTGATATTTCAAAAAGGCATATAATCAGGTAATAAGGAATGTCGTATTTTCATTAAATGATTCAAAAAATAAACATATTGTGCATGATGTTCGAATTTGAAATCTTTATGATGAATGTTGGACTTTGTAAATTATTAACTGAACCTATAATTTTGTGTCAAGTGATTCAAAATCTAAATATATACTTGAGAAAACCTTATATATACAATATAATTTTCTATCGAGGAGGTTTAGAGCTATCAAAACGGACTTAGCCCATGGGGCTGACCCAGCCCAATCTGTTATTAGGGTAGGATTGAGACAGAATTTTTCAAGTCAATCTAGAGCCTATAAGTTCGGCCCATATAAGTCCTTGGTCCTTGAGGCTTGAATGAAGTCGAGCCAGGATCGGCCGATGGGCCAATTTTTTTTATTCAAGGGTACAATACTCTCACTAGTATATAATATAATTACTTAAATACACGTTATATTGTAATATTATGACTTGTCAGATTTTGATATGTCGAGATACATGTATCTCGAACTATGTGGACTCAAAATTAGGTTAATTTGTTTTAGATACACGTTATTCAAGTAGATCCGCATGTGTCTACCATACATGAATATCGCTCCCTCTCctctccctcccccCCCCCCAACCCCCCCAATCTTACTTGTCACTCTCTTTTCTCGTTCACGTATATGGTATGCGAGATTCTTACTAATTACACTAAATTTTTTGCTAGTGTTACTGGAAAAAATACTATTTTTTTGTCATAATTGATTAGAAAATCTTCTCATTTCTTGATGTTATAAAATTATAACTTTGAAATGAAAAAAAGGGCTAACTCACCCAGCTCTCAATCCTTCTAGGGTTGGGTTGAGTTGAGCATTTTCAGGCTCTTCCAAATGAAGAGCCGGCTTGCCCTAGCCCTTCAAGTTCCTTGGCCCGCGGCTAAGGCCGGGTGGGGCTGGGCGAACCCTTTTTGATAGCTCTAACAAGGTTCAAGAATACTTTGATAATTTCTTCAGATCAATTTGAGGAACCCTAAGTAAAAAGTATTTCCTTCTTAAGTTAATTTTACATGACACAAATTTAAATTAATTAAACTTAATTAATAAAAAAAATTTTAAAAAACAATAGTTGACCAATCCAATAAAGTGGAAACTCACTTATAGGTGAACACTCAAGTATAAAAGCAATTTGAAGCATATGTTAAAATTAATTAATAAATATATATGGAACAAAACCTAACAAAATTACATCCACTTGCTTCGCAAAGAAACTTTCTTTAATTTTTATCACCTTATTATCTTCAAGTGTCTTTCCTAT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Genomic sequence(s) unprocessed genomic sequence underlying each location of this mRNA 
Related features  
Features that derive from this mRNA 
TypeNameLocationLengthStrandPhase
polypeptideSolyc09g007910.2.1SL2.50ch09:1429249..1431517722+n/a
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Features this mRNA is a part of 
TypeNameLocationLengthStrandPhase
geneSolyc09g007910.2SL2.50ch09:1429132..14373348,203+n/a
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Features that are parts of this mRNA 
TypeNameLocationLengthStrandPhase
exonexon:Solyc09g007910.2.1.1SL2.50ch09:1429132..1429665534+n/a
exonexon:Solyc09g007910.2.1.2SL2.50ch09:1429768..14360226,255+n/a
exonexon:Solyc09g007910.2.1.3SL2.50ch09:1436719..1437334616+1
intronintron:Solyc09g007910.2.1.1SL2.50ch09:1429666..1429767n/a+n/a
intronintron:Solyc09g007910.2.1.2SL2.50ch09:1436023..1436718n/a+n/a
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