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Solanum lycopersicum polypeptide Solyc09g009090.2.1
![]() ![]() |
Name | Type |
Length
838
|
Organism |
Description
polypeptide feature inferred from GFF3 feature
|
Location(s)
SL2.50ch09:2427492..2441977
|
GFF source
ITAG_eugene
|
![]() ![]() | translated polypeptide sequence |
>Solyc09g009090.2.1 Protein kinase (AHRD V1 *-** Q1SMZ9_MEDTR); contains Interpro domain(s) IPR002290 Serine/threonine protein kinase
MEMSTRRSNYTLLSQVADDNYLPPPPKYSVTGGGGGGGGVAPYYESHSGEKGKGKTGDNRGFDWDLSDHRSNMMQASNRIGAAAFPGSIGLQRQSSGSSFGESSISGEYYMPSLSNAEASFGYLNDGGGGAEVRMKPLEANLFGGSSSKSWAQQTEESYQLQLALALRLSSEATCADDPNFLDHVPDESASRASASAASAETLSHRFWVNGCLSYFDKVPDGFYLIHGMDPYVWIVCSDLQENARVPSIESMRAVDPSVVPSVEVILIDRRTDPSLKELQNRIHSLSPTCGTTKEVVDQLAQLVCSHMGGATSAGEDELVPLWKECSYELKDCLGSTVLPIGSLSVGLCRHRALLFKVLADAIGLPCRIAKGCKYCNRADASSCLVRFGPDREYLVDLIGSPGCLCEPDSSLNGPSSISISSPLRFPRFREVEPTTDFRSLAKQYFSDCQSLNLVFEESSAGAAVDGDAGQTDRNNIERNSAVTGPSNRDEVSRLPVPAIRDMAPVKYVRPVLHGDTQLSDPRDIGNDMRFLERGSQLVPSKISRDIALEIEDFDIPWEDLVLKERIGAGSFGTVHRADWNGSDVAVKILMEQDFHAERFKEFLREVAIMKRLRHPNIVLFMGAVTQRPNLSIVTEYLSRGSLYRLLHKPGAREVLDERCRLSMAYDVAKGMNYLHKRNPPIVHRDLKSPNLLVDKKYTVKVCDFGLSRLKANTFLSSKSAAGTPEWMAPEVLRDEPSNEKSDVYSFGVILWELATLQQPWSNLNPAQVVAAVSFKGKRLDIPRDLTPQVASIIEACWAKEPWKRPSFAAIMDMLRPLIKPPVTPPQPGRTDTQLIA*
MEMSTRRSNYTLLSQVADDNYLPPPPKYSVTGGGGGGGGVAPYYESHSGEKGKGKTGDNRGFDWDLSDHRSNMMQASNRIGAAAFPGSIGLQRQSSGSSFGESSISGEYYMPSLSNAEASFGYLNDGGGGAEVRMKPLEANLFGGSSSKSWAQQTEESYQLQLALALRLSSEATCADDPNFLDHVPDESASRASASAASAETLSHRFWVNGCLSYFDKVPDGFYLIHGMDPYVWIVCSDLQENARVPSIESMRAVDPSVVPSVEVILIDRRTDPSLKELQNRIHSLSPTCGTTKEVVDQLAQLVCSHMGGATSAGEDELVPLWKECSYELKDCLGSTVLPIGSLSVGLCRHRALLFKVLADAIGLPCRIAKGCKYCNRADASSCLVRFGPDREYLVDLIGSPGCLCEPDSSLNGPSSISISSPLRFPRFREVEPTTDFRSLAKQYFSDCQSLNLVFEESSAGAAVDGDAGQTDRNNIERNSAVTGPSNRDEVSRLPVPAIRDMAPVKYVRPVLHGDTQLSDPRDIGNDMRFLERGSQLVPSKISRDIALEIEDFDIPWEDLVLKERIGAGSFGTVHRADWNGSDVAVKILMEQDFHAERFKEFLREVAIMKRLRHPNIVLFMGAVTQRPNLSIVTEYLSRGSLYRLLHKPGAREVLDERCRLSMAYDVAKGMNYLHKRNPPIVHRDLKSPNLLVDKKYTVKVCDFGLSRLKANTFLSSKSAAGTPEWMAPEVLRDEPSNEKSDVYSFGVILWELATLQQPWSNLNPAQVVAAVSFKGKRLDIPRDLTPQVASIIEACWAKEPWKRPSFAAIMDMLRPLIKPPVTPPQPGRTDTQLIA*
![]() ![]() | unprocessed genomic sequence underlying each location of this polypeptide |
>Solyc09g009090.2.1 SL2.50ch09:2427492..2441977
GATGGAAATGTCTACTAGACGATCGAATTATACTTTGTTGAGTCAAGTTGCAGATGACAATTACCTTCCTCCGCCACCGAAGTACTCCGTCACTGGCGGTGGCGGTGGAGGTGGAGGAGTAGCACCGTATTATGAGTCTCATTCTGGTGAAAAGGGTAAAGGCAAAACAGGTGATAATAGAGGATTTGATTGGGATTTGAGTGATCACCGTAGTAATATGATGCAAGCGTCGAATCGGATCGGTGCGGCGGCATTTCCAGGTTCGATTGGCTTGCAGAGGCAATCAAGTGGGAGCAGCTTTGGTGAAAGTTCGATCTCCGGGGAGTATTACATGCCGTCGTTGTCTAATGCGGAGGCGTCATTTGGATATCTCAATGATGGCGGTGGCGGTGCTGAAGTGAGGATGAAGCCGTTGGAAGCTAATTTGTTCGGTGGCTCGTCTTCTAAGAGCTGGGCGCAGCAGACTGAGGAGAGTTATCAGCTGCAGTTAGCTTTGGCTTTACGGCTTTCTTCCGAAGCTACCTGTGCTGATGATCCAAATTTTTTGGATCATGTGCCTGATGAATCCGCATCCCGTGCTTCAGCTTCAGCTGCTTCGGCGGAGACCCTTTCCCATCGATTCTGGGTATGGTTGGGTTATTGTTTTGTGTTGATTTTCCTTGTCGTCTATATTTATTTTCTCTGTCAATTGCCTTAATCCAATTATGATTTTAGCTGCAACAGAGGGAAATGTGTTCCTATTATGCTTAAGGTATGTGTTGAATAATTAGCATTGTACACACAAAAAAAATAGCTTGGTTTAGATTACAAATGATTCCAGGCTTTGAATTAGGTAACAGTTTGATGTAAAGGAAATGTTTTCCTTGGATCAACTAGGACTGTTTCGTTGGGTATATGTAGGTGACATAGACTACTTTTAGTCTTGTAGAAGTGGACTATATGGTGTTATGGTAGTGTTTTGGTGATACTTCTGAGTTCTGAGTATTAATAAAGGTTGACAATAATGTAGTAGTGTGGAAAAGTGGGAAAATGACTTCTGTCAAGAAGCAAGGGAAGCCATCTTTTTGTTTGCTGAGAAACTATTTATTGGGTAAGGTGATATTTTCCTGGAAAGTGTTTTCCGTCATACCAAACACAGAATCGACAAATGGATGTGTTCCTTCAAATGTAAGTGCACTGAATCAGTTTTGATAATATTTAAACTACTAGATCCTTTCATAATTTAAAGAAAGATATGTAGCTTCTATATTATTACTGCATCCGGATAGTTCTAGAATACTAGAATATGTCGAGACTAATGCGTCAAGTAATGTGGAGGTCAAGAACAAATTTAATGCTTTTAGTTTCTCAGATGTTTGCGAACATCTCAAGCTACTCTGGAAGTGGAATTGTTGTAGTCGATATAACTGATGCCCATTTTTGTTCTCCACAAAGAAATTGGATGTTTTCTCTATGTAAAGTCTGTATGTCAGTTCTCTTTCTCATTATATAATGCTACACCAATGTGGAATGGGTTCTTTCTAAACCTGCAGTATATAATTAGGGATCATTTGGTAGAGTGTATAAGAATAATTCTAAATAAGGTGTATTGGTATTACTGATATTGGTTATGCTTGCATTAGTTATGCGGAGCTTATGCAGTGTTTAGTTTGGTGTATTAAAAACAACATTCATTGCATATTTCAAAAAAAGTTTTATTTATTACAAAAATACCTTTATTTTGAAAATTGAGAAATCCGTCGGTTACCCGCCGCCATTTGGACAATGGAAAGGATGTGAAGAGATTTTGAGGGGTAATAGTGTCTTTACCCTTGCTAATGTATGCATCAGATCCCTTGACTCTCTGCACTTGATGCACCTACAACTTGAGCACTATTTTATAAGGGAGCTATGTTTACCTGTTCTGACGTGAATTCTTTGCAACAAATTCATATCCTTACTGAAACTGTGATGTCAATGAACTTTCATTTATACATAGTTCAACTAGTAAAACACGTAGAAGTTAATAAATGTCTAAGCCCTTTACTCTATGTTGCTCACACTCTTCGATAATGTCGACGTGTGCGTGTAAGATCCTCCAAAATAGTGTATTTTTGAAGGATACAACACAGGTGCGACACATTTTTGGAGAGTCCGAGCAACCTAGCTTTTACTGTTTTGAAACATTGTATAATGAATCAATGTGTATGACACAAACTATCGAGATTATTCCCTTTATCAGTCTATCATGAGATCCATACTCGTTTTACGTACATCATGTACATATTGATGAAAATGAATCTAAGATCCATTTTCCAGCTAACACACCCTATATCCAAAATAATATTGCAATATGGGAATTAATGCAAAATTTATGACCACTCCAACAATTAGTTAAAAAGAGGATTATAAAAATTCCTTGCAATTGTGTTTTAGTAAAAGAGGTCTAGAAGTAGAATAAATTGATTTGTTTTGAGTTTGAATTTTAATTTTTTAGTATGAAGTAGATCAAACTATATTCATCAAAGAAGATAAAGGATTTTACATTACACGGTTTCACAAGATGTTAAGGGAAATCTTTTGGTTATTGATCAATAATCATGTTTTTCATTATGTGTTAATGAAATCTTTTGCGTACTAACTAAAAAGAAAACATATTTGTGGAAATGGAGAAGAACTAAAGAGTGTAGATAAAAGTTTCTCTTTTGGAGAAGTGGACAAAGGTTTGGATAAGTGAAAAAAGAAGGGGTTTTATTTTCGGATCAGATGAGTAGAAGATATCTACAAATATTATAGTGTATGAGATTGTTTGTTGTTGTATTGCATTTAACACATAAATATTCATTTTTTGGGTGTTGATTGCCTAGGTTAGACTTAGATTAGTTCAAGTCTAATGACATACATATTTCGGGTGTTGATTACCCTTTTGATCGTTTCTCTTATTCCCAAACCTTACAAATGTCGGCAGGAATGTAAGGGTGAAATGAAGTAATTCCATAAAAAATAGATTATAGAAGAAAATGGCTAGAAGACGATTCACTATTTGGCGCCCTAGATAAATATGCAAAGAATCTTGAAGCCGAAGGTCACAAATCACAATTTAAAACAATGTTATTTGTGTGGTAGAAAAAATTGGAAGAACATAGTAAAAATGGAACCCATGTCCAACAACAATAACATACCCAATGTAGTGTAGTCCCACAAGGTGGGATCAGGGGTTAGGGTATATACAAACTTCACCCATATCTCACACATAGAGAGTTGTTCCCGAAAAGACTCCGACTCAGTAACGCATATCAAAGAACATATAGAAGAAAAGTGTTATAACAAGTACTGGAGGAAAAATCAAATGACATATAGGAAAAGAAATAATAACATAAAAAGGTAGTGCAATAATCAAACAACAAGACACAATTGGTAGTAACATAAATCGTAGAATAAAGAATTACGCCAAAAAGTTAATACTACTAGTATTAAAAGAGAAACAAAACGGGGTGCCAAACTACCACCGAGCGTGATCATAGGAAAGCGAGACAACAATCAACTATCTATTAACCTTTTATCCTAGTCAACAACCTCCAAATCCTTCTATTTAAGGTCATGTTCTCGCTGAGCTGAAAATGCGCCATAACTTGTCTAATTACCTCTCCCAATACTTTTTCAGCCTACCTTTACACTTCCTCGAACCCATTATTACCAACTTTCTGCACGTCTCACTAGGCCTCTCCACATACTTGAATCGTCTCTATCTCACTTCTATTCTTGTCCACCACAGTGGCTACTCCGACCTTCTCCTGGATGTCTTCATTCCTAATTTTATTCTTCCTAGTATGTCCACATATCCACCATCACCGATCTCCCCATTTTCTTGGAATAAAGACCTAAGATACATGAACTTTCTTTCCTGGGGATGACTTGCATACCAAGCTTTACTTACACGATAAGTTCTAGTGTTCCAAGCATCATACTATTTGAATGTCTAGTTTTTATTCAGCATGAACTAAATTAGGAGTAGAACTTGTGAATTATATTAAATATCAATTGCGAGCATGTTGAGTTAATAGTCGTCTTTTACTGTGTGGTTAAATTAGGACAGAAGAAGACAAGAAGTGGAATATAACAATTTGTTAAATTACCTTTATGGAAAGAGGAATGTGTAGTTTGATAGAATGTTGAAGTGAGTAAAAATGTGAAATTTTCACATATGAAGTAAAAAGCATATCGAGTTTGTAGCTCCTTTTTACCCTTTGAAATTTAAGATGGATGAAGGTGGAATTATAATAAATAGTTTAACCTCCCCTTTAAGACATTATAAGTTATGTACTAAATTGAATGCTCAGATTAGTGGCTCTATCATAAAGATTAGAACATTCATTCTCTTTCTTCTATTCTATATTAACAGAAGTCTAGACAATGTCCCATACAAAGAAATAATCATTAACTATTGAAAATATTAATATTGTTTTCATCATACGAATGTCAAATATCTACTAACCATAGGCTTGATATTTGACCATGAATCTTGCCAAAACTATTGGCAGCATATAGTAGAAGTATTTGGTAGCGGATTCACAGGTGCCATTGCAAAAAGCAAATGTAATGAAGAGGTGGAAGTTGGGACATTGATGACTTCACATTTTACATGATAAGTTAGGGAGGGCCTTTCTACTCTATCAAAGCAAAAAGACTCGAGAGACGCTTATAATGCCTGTGAAGAACATGTCTCTACCCTCGATCAGTGATCTTGACATCGAGTTTTGGAATAGAGAAACTGTTGGCAAGGAGTGTTACCCCTTTTTGTGGGCCATATGTGAGGTGATTGGTATTCTCATGCCAATGGGTTTTGCATACTAGATGGTTCGACTATTCCATCGAGTACATGCTATTTCCATTTAGCACAAGTATTGAGTAATTTTGTTTAAGGCTTAAGACATGGGCAGATGTGAAGAAATTACTTATCGTCCTTTGTGTCTGCTACTAGGATTTGAATCCTGATCTTTTATGTTTTTCACCCTTGTTGT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Download sequence region |
Get flanking sequences on SL2.50ch09
|
![]() ![]() |
Features this polypeptide derives from |
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---|---|---|---|---|---|
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