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Solanum lycopersicum polypeptide Solyc03g013340.2.1
![]() ![]() |
Name | Type |
Length
284
|
Organism |
Description
polypeptide feature inferred from GFF3 feature
|
Location(s)
SL2.50ch03:45899542..45907027
|
GFF source
ITAG_eugene
|
![]() ![]() | translated polypeptide sequence |
>Solyc03g013340.2.1 Aquaporin Z transmembrane water channel (AHRD V1 **** A4SKG8_AERS4); contains Interpro domain(s) IPR000425 Major intrinsic protein
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MESEGGNCSKSINQNELVLKEDPKSNFFQKYYRSGIIKKVIAEIIATYLLVFVTCGAASLSWSDEHKVSKLGASVAGGLIVTVMIYAVGHISGAHMNPAVTFAFAAVRHFPWTQVPVYAAAQVTGAISAAFTLRVLLHPVTKNVGTTTPSGSDIQALIMEIVVTFSMMFITSAVATDTKAIGELAGIAVGSAVCITSILAGPVSGGSMNPARSIGPAMASNDYRAIWVYIIGPVCGTLLGAWSYNFIKVNDKPVQAIVPGQSFSFKLRRMKSNNHDEEQCVTL*
![]() ![]() | unprocessed genomic sequence underlying each location of this polypeptide |
>Solyc03g013340.2.1 SL2.50ch03:45899542..45907027
AATGGAGAGTGAAGGAGGGAACTGTAGCAAAAGCATAAACCAAAATGAATTGGTATTGAAGGAAGATCCGAAATCAAACTTTTTTCAAAAGTATTATCGATCTGGTATTATAAAGAAGGTATTCATATTGTTTAGATAGTAAAATAAAAATAGTATGTATGTTATTGTTGATGGATGATGTGATAATGAATGTTGTGTAGGTGATAGCAGAGATAATAGCGACGTACCTATTAGTGTTTGTGACATGTGGTGCAGCAAGTCTTAGTTGGAGCGATGAACACAAAGTATCAAAGCTTGGAGCGTCCGTAGCTGGTGGACTCATTGTAACTGTCATGATATATGCTGTTGGACATATATCTGGTGCTCATATGAACCCTGCTGTTACCTTTGCTTTTGCCGCCGTTAGACATTTCCCATGGACACAGGTACGTAACCTTTACTATTACTACACTCTCATTGTCACATTAACGTGTAAGGGTAAAATTCTCCAATAAAACTATTACTACTTGTAATATTTTAACATATCAATTTTAGGATTGTCTTATGACCTAATAAGACGCATCAAATTTCGTGCTCGGTGGAAAGCAAATAATAATGTTAGAGAAAATTTTGTGATCTACACACATTTATTCAAGTACAAAAGAATAATTTCACTATGAACTTTCTAGTCATAGTTATATAACCAAAAATATCATGACATTGATATTGTTCAAACATATAGGCTGAAAAGTTTTCAATTTTAAGCTAATTAAAATGACACTAGTTGAAAAGGCACATAGGAAAAACTAAAAGGGACAAAAATCACTAATATTGCTAAAATGACGATATTTGAATTTATAAGTCTTTTTCTTACTTCTCTTAGCTTAGACACAGATTCAAGATTGAAATTTCATTATGTTTCTAAAAGCAAAGTACAAATTGTGTAGTTATTATGAATCTAGCAACACTGGGCTATAGTTTGTCCAGAAGATGAGCTGATACACATCCATGCACCTGCTGATTTTGATAGGCACATGACAATTCTGAAAGTCATAATTCTTCTTTCTACAAGAATAATAATAATGATAATTATGTCTCCCATAATTAATGTAATAAAATCATTCAATTGCCGGTTGTTGCTCCGTCGTATTCAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATATATATATACTAGTTGCAAAAACTAATTCATTCAATTTTTGTTCCGTCGTATTAAGTATACAGATATATACAACTTGTGGCGAAAACTAATTCATACAATTTTTGTTCTGTCGTATTATATATATACTAGTTGCAAAAACTAATTCATTCAATTGCTGGTTGTTGGTCCATCATATTCGGTCTGGATGTACATAGCCAGATCAGTTTGATTTTTAAATATCAAACTAAATGATTTATGAGAGATTTTTAAATCTATAAATCAAATTAAATTAATAATGTTTGGAATTTTCAATCTTGAATTGTTTTAATGTAAATATACAGTTAACTTGTGTTTCAAACACTTTTTTAGTTCCACAAAAATATACTATATAATGTGTTATCTTAAGAAAATAAAACAAATATGAAATGAATGATTACACAAAAATATTAAAAAAACAAAAAGTAATAATAAGATCACATAAAAACAAATGTTACTAATTAATAATTAATAATGAAAATACATAATTTCAAAGTACTAAATAATCATGCTAAAATAAGTCCGACAAATACTAATTGCATGACTAAATATTAAAGAAAAATTAAAATTAGAGTGATTATGTATTTTGACAGAGTAAACTAATATAAATTAAAGAACAAATATTCGACGTTATTGTCATTTCTTAATGTTCTGTTGATTTTTTTTTAAAAAAAAATATTAGTATTGGCTTTTGATTTTGATTTGAGCCTCATTAGAGTTACGGACGTTTATCAATTATAACCTTTATTGGACCACCCAAATTTTAAGTTTCAAATTTAATATAATATGTTTAAAGATAATAATTATGAAAAAGTATAAGAAATATTTAGAAATTACATCAAAGAAATTTTTTGTGTATGAAATAAACATAACCTACCTTCACCAAAGAGTCGATATCAAGTATAATTTTGTGGTGTAAATAGGTACATTTTTCGGCCAATTTGAAAGAAAAATTCATGATATCACACAGTGACTATCAATCACTATTAAGAGTCTATCTATCATATAGAATAAACCATAACCTATCTCCACCAAAAAATTTGATGTCAAGTAAGCTAATTCACCTATGATTTTTCTTTCTTCAATGCCTCAGATGATTTTCAATCCTACGAGTATGCAAAATTTATAAGTAAACGAGTTTATATATACCATATTGCTACATATCTAGTCTAAAGGCAATAACTCACCCTCATCTATAATCAATTTCCTAATGTTTAAACCTAAGATTCAATTTCAATACTTTCAATTAATATAACTTTAATGGAATTCATGTAACACGATATACCTAGTATTTATTTAGCTATCTCAATATACCACAATTTACTTGTAATGATAATTATTCCCTCCGTCCGGTATTATTTGTCATGATTTCGATTTTTAGAGTGAAATTGTAAAAACTTTGACTAATATTTTAAGATATATCTTTTCATCATATTAATATGCAAAAAATTATAATATATAGTACTTTTCATATAGTTTTAGAATATGTAATTTCTTTGATTAAAATATCGAACTAATGTGATCTAGTTTACCTTTAAAAATTAATTAAATTCACTTTAGATAAACGCAACATGACAAATAATTTTGAACGGATATAGTAAAAATGAACACTAATAAAAAAAATAAAAAACAACTGGTTGCGAACCACTGACGAACCATGTTAACTTTAAAATTGTACCATAATCAGAGCCTACCCAATTGCACCTTAATTTAATATTGAATTCTCATTCTTCTTTTACCCATCATCATCACCCAATTACTAACTTTCAGGCCTAACACCACAATTTTAGCACGTTTCTGTTTATCCATCAATATTAACGGTGCACTTCTTTAAAAAATACTGCATATGGAAAATATAACATATAGCTTTAAGAAAAAGTGGGGCTCCCAATTTAAGACCCCAAGTATTATCTTAACGGCCTTATAATCAAGTCATCTCTAATAAGATATTTTAAAATTGAACCTACCTTATATTAGGAAGAATATCAAAATGAATCATGGCGCATACAACTAGATTAACGTAACGCTTAAGTCATAAGTATCCACTTAAAATTTTTCATAAAATTTATTTATTTATTTGAACTAAATTGTGTTTCTATTAGCTAGACACTTAAATTGAAGAAAACTTATAGGTATTAGACATTTTGTAATGACATAGCGAAATGGTAAATAGAATCAAAACATTAGTTGTGAAGATTCAAAACTACTCATGAGTGAAACACACACTTAATTTACTAGGTGTATGGACCAATAAATTTAATCCCAACTTACGTAATACAAGCATAAAATGAAAGCTCAAATCTTATTATGTATCGTTTTTTAAAACTTGCAAGTCATCATATCAAGTATATCTAATCCAAATATTAATTGTAAGAGTATGAAAGACACTAAAATCAATAAACAAAATACTTTATGTTGAAACTAAGGACATCATGTCATAGCCGAGAGAATCGAACACAAGATAAAATGAATAGCTCACCCTGGAACCTGATGTGCTAGAGGTTGGCTAGAGCTGAGGGCGAATCGAAATCGCTAGTATACTCGTTGAATTCCACAAAAGGAAAACGAAGAAAATATATGTACTAAGTAGGCATCATCAGTTGGCTCAAAATAGAAATCAATATGCATGAAGTAATAACATAGTATTAACTATAGAACTTACCAGGTGACAAGCAACAACAAACATGAATAAGTGACAACAACACTATAACAAGTATAAATTATAGTCCACAATATAGAGAACACACATGGGAACTCATACCTCCACACCACTCTCTTTTGAAATTTAGGTTCTTTGAGATTGAGTACATTAAGTTACTTTAATATATTTTCTTTAATGTTATCATGTCGGAACATGACACTCGATCCAATAATATTGTGTCAGAACATGACACCCGATTCAAATATTTCGTGCCAATTTGTGGCACCCTATCCAAATATATCGTGTCGGCTCGTGACACCCGATCCAACCATATCGCTAATTCATTATTCTTTATCATCTCTTTCAACTTTCTTAACGATATTACATTAAGCCTTTTTTATTTAAGACATCACTTTAATAGAACAAGTTCAGAATTATGGATTTCATGGTTTTGTGATTACAAACTAATCGCAACAACACCTTAATTATCCACACAACAAAAAGCAAGTGCATAAAAAAATTCACAATATCACTCAATGACTATCAATCACTATTAAGAGTCTATCTATCATATAAAATAAATTATAACCTTCCTTTATTGAAGAACCAAAAGTCAAGCAAGCAAGTTTTCCAATGTTTTTTCTTTCCCCAATGCCTCAGAGTGTTTCCAATCTATCAAGTATATATGCATAATTCATAAGTAAACAAGTCTATAGACACCCACATCACTATAATCACTTTTCTAAATTTTAATGTCAACTAATATGTCCACTCTCGTATTTCTCAAATGGAAAGCCTAGGGTTAAGTCTTAATTTCTCAAATTATTACAACTTTAATGCAACTCATATAGTACAGTTTCCTAATATTTAGTTATCTATCTTAATTTATCAAAACTTAATTATTGTATAATATCTTTTGGTGTTTGGTTTTGAATGAGAAATGTTTTGGTGTTTGGTTTTTGAATGAAAAATATTTTTGAGAAATATCTTTTATTTTTTGTACTAAAGTAGAAAATAATTATAATTTTTTTTTTTGTAAAAGTCAGACCTAAAATTTTTTTTCGGGGCGGGGGTATGGGGGTCAAGGCTAGGGATGAAAAGTAAAATTTGAAGTT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Download sequence region |
Get flanking sequences on SL2.50ch03
|
![]() ![]() |
Features this polypeptide derives from |
Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
---|---|---|---|---|---|
mRNA | Solyc03g013340.2.1 | SL2.50ch03:45899427..45907168 | 1,109 | + | n/a |
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