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Solanum lycopersicum polypeptide Solyc09g015930.2.1
 Polypeptide details
 Polypeptide details
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| Name | Type |
Length
559
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Organism |
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Description
polypeptide feature inferred from GFF3 feature
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Location(s)
SL2.50ch09:11381753..11399380
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GFF source
ITAG_eugene
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| Polypeptide sequence
Polypeptide sequence
| translated polypeptide sequence |
>Solyc09g015930.2.1 ATP-dependent RNA helicase (AHRD V1 **** D3TRA6_GLOMM); contains Interpro domain(s) IPR011545 DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal
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MSYVPPHLRNSAAGKTTTTPTINSIGADHFSSKHTSRISSLEKSSNGYSSSARRSSLNYSLPNTFAVPDPIFPHWKPSERVLRLKSEQIEEIRLRLNVDVNVSPVSCPAPSPIESFPDMCLHASIMKDIEKHGYTAPTSIQAQAMPVALSGRDLLGCAETGSGKTAAFSIPMIQHCLAQQPLQRGDGPLALVLAPTRELAQQIEKEVTAFSMSLDSFKTAIVVGGTNISEQRSELRAGVHIVVATPGRLIDHLQQGNTSLGRIAFVVLDEADRMLDMGFEPQIREVMRNLPVKHQTLLFSATMPAEIEALAQDYLTNPVRIKVGKVSSPTANVSQTLEKVPENDKIDRLLDLLVEEAAQAEKSGHPFPLTIVFVERKTKCDEVAEALTQQGLLATALHGGRSQNEREAALRDFRHGPINILVSTDVASRGLDVTGVAHVINLDLPKTMEDYVHRIGRTGRAGSTGRATSFYTDRDMYLVAQIRRAIADIGSGNDVTIAMGKTARRKEREAAAAEKEARSELSKFSLVGSTVNVEDKYRHMIAPSMIKKEGAADDAWDD*
| Genomic sequence(s)
Genomic sequence(s)
| unprocessed genomic sequence underlying each location of this polypeptide |
>Solyc09g015930.2.1 SL2.50ch09:11381753..11399380
AATGTCTTATGTACCTCCTCACCTGAGAAATTCTGCTGCCGGAAAAACCACTACCACCCCTACTATAAACAGTATAGGCGCCGATCACTTCTCTTCCAAACACACATCCAGAATTTCTTCTCTCGAAAAGTCTTCCAACGGTTACTCCAGTTCAGCTCGCCGGAGTTCCCTCAATTACTCCTTGCCCAACACTTTTGCTGTCCCTGACCCCATCTTTCCTCACTGGAAGCCTTCCGAACGTGTTCTTCGTCTTAAATCCGAGCAGGTTCCTCGCTAAAAAGTTCTTTTTTTCATCTTCTTAGGGTTTTGTGAAATATATGTTATAATTTATTCCATCTGAAAACTTTTCCAAAATGGCTGCTTAATTTAGTTTGTGTTGCTTCAAATCTTACCTTATTTCTTGTTTAGCTTCAAATTAGTGCCAATACACTGCGCTAATTGGCAGTTGAACTGGATTCTACAAACACTGCATGATATTTTTGTGCTGTAATTTTTTTTACTCTCAGATTTATTTCTCAGTTATTCTCTTCACATACTTTTATCTTTAGGCCTTCATTGCGCATTATAATTATTATCATTTTCTGACCAACTTTGGATATTTCAATTTTACAACACAGTTATATAACTTTTACTACAAAAAGATAATGTTATGATCCTGATTTACGTCCTTGATGTGCATTTTTGTGTGCAGATAGAAGAGATTCGACTGCGGCTTAATGTAGATGTCAATGTTTCTCCAGTCTCATGTCCTGCACCCTCACCTATTGAGTCATTTCCTGATATGGTTTGTTGAATTCATTATTCTGACAAATCACTCTATTGGGTTCTCTATATAAGGCCATAATTTAAAGTATTTGGACCCTGGTTGTTTCTTCTCTCTGCAGTGCTTGCATGCAAGTATAATGAAGGATATTGAAAAGCATGGCTACACTGCACCGACTTCTATTCAGGCTCAAGCCATGCCTGTTGCTCTTAGTGGCAGGGATCTCTTGGGGTGTGCAGAAACTGGTAGTGGGAAGACTGCTGCATTCAGCATACCTATGATACAGGTTGTGTATTAAATTTGTGTTATTATCATCTCATACTGTGATTTTGTCACTGTTGTACTTGATCTGACTAATAGGAGTGTTTACTGTATAATAAATATTATACATATTTTTATCGATATAGCATTGCCTAGCTCAACAACCTCTTCAACGTGGTGATGGACCTTTGGCATTAGTGTTGGCACCTACAAGAGAGCTTGCACAACAAATAGAGAAAGAGGTGGGTCTGCGGGCACTTTAAAACTTACTGTTTTTTTCTGTATCCTGCATATATATGTTTCATTGACCCTGCTTTCAATGTGAGCAGATCCTTGGAACACCCTCATCTGTCTTTTGTTTTGTAATTCATCTATATAAAATAACTGGTTTCTTTTCCTTTTCTCAGTTTCATAAAAACATAAAATACTTTCTCGGGTGTTAACTGTCTAATAACCATATCAAAGGGTACTGAAAAGCATAATGTGCTGCTACTATACGGTTGCTTCGCTTCTTCAAAATTGAATAATGCTCATCTTTCAAGAAGTCTGGTTTAGTCAATTATATGAATTACTATCTTTTATTTGTGAAGCATCTTGTATCCCCTTGGCTTTCTTTGGTCGTGGCATGTTAATAAAGTAACTGGGTCTCTGTGATTCATAAGGAGTGGACTTCAATATCACTATGTCCCAGCTACTCATTGTGTTGCTGATGTCGTTTTATTACTGTGCAAAGCTCATCGTCTTGCTTCAATAATTTTCCTCATAACCAATAATTTCGCATGTGAATGATCCGTGTTCGTTATTAGCAATATATGTAGTTTGCCAATGGTGTAGACAAGATAAAACTCAAATTATTGTATTTTGCCTTTAAATATTATCTTTGTACTTGAACTGCTGAACATTGTCTTTTCAGGTTACGGCTTTCAGCATGTCTTTGGATTCCTTTAAGACCGCAATTGTTGTAGGTGGGACAAACATTAGTGAGCAGGTAACTTCATTTTTATTATCATTATTAGGGTGCTATCTGTGAGGTTCATACGTCTACAGGGTGATAAGTAAACCAAATATCTCTTCTTTTGTTCTGGACTTGTTACTGGGTTGTGCCTTGGAGCATTCATTTTTATCTTTATGTTACATGATGATGCAAGTCTAGCCTTACCATATTTTGTTATTGTGGTTTTCCATTGGATGCTAAGACAGAGGTCTGAGCTTCGAGCAGGAGTACATATAGTTGTTGCTACTCCGGGAAGACTTATAGATCATTTACAACAAGGAAATACTTCCCTCGGTAGGATTGCTTTTGTAGTTTTGGATGAGGCTGATAGAATGCTTGACATGGGGTTTGAACCTCAGATAAGAGAGGTATCTTCTTTTTCAATTTGTTTATTTTTTCTTTTCAAGGGAACATTATTTTCCATTTACCTGTTTGTCCGGTCTTCTGTAACTCATTTTTGAATCTCCCTGATATCTTGAGGAATATGCTATTGTTTTCTTTATTTTTGCACACGTTTACCTGCCAATGTAGTAGCTGTTTTGCAACCATAAACTATATATCAGTGCTTGATAATGCTTTTTAGTTATTTAATCTGTTATTATCTTTCTGTAAAATCAGAAAACATCTTATGTCATTGACTCCTGAATTATTATCTTTGCCTTTTTTTCATTGACTTTTGTAATATGTTACAGAGACCAGATTAGCATTAAACTAGAATGATTCAATTGTTGTTTTTGCTTGTTCTGCACGACTAAGTATGCTTATCAAACATCATAAATGACAGCTTCCAAGTTCGATTGTCTGCTTTTGTTTGCCTCTTGGTGTTGACTGGGTTATGTAAAGGATGCTGATACCATGCTGGAGGCTTTAGGACTTCTACATGTATATATGAGGCTCTAATAGTCAGCCAAATCTACCTTTGCTCTAGTTTCTGCTTGCTCATCTCCTTTCTTTTTTACCTTCTCTAGTGTTAATGTTGTAAAATCCCAGCACTTGGTGCTGTTTTGACTCGACGAAATACCATTTACCTTTTCAAAATTAAAATATAAATGGAAACTTCCAAATGTTACTGTGTCATAGGTGATGCGAAATCTTCCGGTAAAACATCAAACACTGCTCTTCAGTGCCACCATGCCAGCAGAAATTGAAGCATTGGCACAGGTTAGGTCTCTATTTACTTCTTCGTTATATTAGCCCATGTATTTAAAATGGTATCCTGGTAGGCTTATTTTGTCGATACTAGGCTTATCCTGGTAGGTCTCTATTCTATGCATGATCAGATTCTGCAGACATCATCATTGAGTTTCTCTCCATTGAGTAGTCTCCGTCCCCTTATTTTCTTTTGGTATAATCACAAATTTCCTTGATGTATGGAGGATTGGGAGGAGTTCGTAGAGAATCATATTCTAGAGATTCTTTACTTTTTGGTATACCACTTGTACATGGCCTGTGTGGCCATTTTATGGACAAGAATACCTTTACTTGATGAAAAATGATATACCATGTGAATTCAGTGTCTGGAAAAAGAAAGCAATTAGGTTAAGCTAGAAATTACTCTAGGTTTGATGTGGCAATTCTTCTTATAAAGGGTAAAGCTCTTAAACGATAAAAAATTCACTTAAAGGAAACTTATATGGCCTGGGATCTTGAATTCAGTTTGAGATCTCGTTCATAAAGCACTTGCTTTGATATTTTGTTGTTTTTCTCCAACTTTGTCATTTTCCTTGTATATGCAATTCATCATCACTTAACATGTCTTCAGGTTTGATAAACATATGATTTGGTCAATGCTATTATTCTGTAGAAGAGGTGTCACATCTCTTTTGATTGTTGCAGGATTACTTGACTAATCCTGTGCGAATAAAAGTTGGAAAAGTAAGCAGCCCGACAGCAAATGTTTCCCAAACTTTAGAGAAGGTACCCGAAAATGATAAGGTATGTTCATTGTTGAACTGAAATAGTAAAGTAAACAGATTGATTCGCATTACTTTTAATAGTTTTGATGGCACCATTTTTGTTGCAACCCTTCTTTATTTTTTATATTATTCAATTTTCATCTTGCTTGTTTGTTTCTTGTATACATAGTTGTTTGAGATATGCATCTAACAATTTTGCATTCTTCATTCTTTGCCGATAGCGTGTGCCTTTTCTGCCTTCTCCGTCTTTGACATTTATGGTGATGAAGTATAAAGATTCAATAATAAAATCCATCTCATCATTATATTGGATACATCCACATTAATGTTGATACAAGTTATATGTGTATGGTTTTGGGTTGGTCATAGTGGGTAATTAGACTTGACAATGCTGTCTCAGTCAAGAATTCTCTAATGCATAAGGAGCTAACTCTTGCTGTATGAAGTGATGAGATCCCAATCAGCATGAGTGGCTGTCCTTACTGGTAATATTTTTCAGAGCTGGAGCTCATTAAAGTGTTTTGCATCTTTAATATGAAATTCTTGCATATTATTGTATTACTCGTGAAATAACAGTAAATCAGCAGAAGAACCTTATGTATGAGAGTTAGCTGTCTTCTCCCCATTTTTTGTCATTTAAAATGGTTCGAACACTATTTATGTCATTGTTTTATAAAAATAATTAGGTCGAATGCTTATCTCTTAGGATGTTATTCAAGTCTTGATAGAAATATATATAGGTATCATATTTCACAGAACGGGGGATATAAATGTAGATGAATCCATACTCAAATCTTTCTTTCTAAGAAATCTAACAATCACCTACACAAGGAGGACTTTATGAAGCACAACTAGGTTGAATCCTTATTTTTAGGATACTATTCATGTCTTGATAGAAATATATATAGGTATTTATCTATAAACTTATACTTGCTATCATAAAAGCATGAACGCCCTAATTTGAATATTAAATTACTATAGTACCCCCAACTTAAAAAAAATTCGATTAAATATATCTTTTGTATTTTATTTATATTTATTTATAATTCATTATGTTAAAAGCAAA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| Download sequence region |
Get flanking sequences on SL2.50ch09
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| Features this polypeptide derives from |
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