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Solanum lycopersicum polypeptide Solyc11g028020.1.1
 Polypeptide details
 Polypeptide details
|
| Name | Type |
Length
224
|
Organism |
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Description
polypeptide feature inferred from GFF3 feature
|
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Location(s)
SL2.50ch11:19912269..19920394
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GFF source
ITAG_eugene
|
| Polypeptide sequence
Polypeptide sequence
| translated polypeptide sequence |
>Solyc11g028020.1.1 Agamous MADS-box transcription factor (AHRD V1 ***- B2CDE2_9ASPA); contains Interpro domain(s) IPR002100 Transcription factor, MADS-box IPR002487 Transcription factor, K-box
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MGRGKIEIKRIENNTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEIALIVFSTRGRLYEYSNNNVKATIERYKKATAETSSAYTTQELNAQFYQQESKKLRQQIQMMQNTNRHLVGEGLSSLNVRELKQLENRLERGITRIRSKKHEAILAETEDLHKREIQLEQENAFLRSKIAENERLQELSMMPSGGEEYNAFQQYLARNMLQLNMMETALPSYDPLSPDHKR*
| Genomic sequence(s)
Genomic sequence(s)
| unprocessed genomic sequence underlying each location of this polypeptide |
>Solyc11g028020.1.1 SL2.50ch11:19920394..19912269 (sequence from reverse strand)
ATGGGTCGAGGAAAGATAGAGATAAAGAGGATTGAAAACAACACAAATCGACAGGTAACATTCTGCAAGAGAAGAAATGGATTACTGAAAAAGGCATATGAACTTTCAGTTCTATGTGATGCTGAGATTGCTCTCATTGTTTTCTCTACTCGTGGTCGACTCTATGAATACTCTAACAACAAGTAACTCCTCCTCATACTTTCTTACTTTCCTTATTTACACATGTTTATTCCTAATTAACTTAAAATATTTTTAAAACAAAAAAAAACATTATAAGCGATTATTGTTTTAAAAAAAAAACTTGGTTGAATCTCAAAATTTCTACTATAACACATAAATTGAAACAGAGGAGATAAGAATAAACTTAAAGTAAAAAAAATGTTTTTTTTACTAGTTTGTAGTATATTTAAGAAATATTTGTTGTTTTAGTGAATTTGTTTATACTGTAATGTAGTTTAGTGGATGAATGAGCTTTTGAAATTGATCATGCAGGCGTAGAGGATCGTTCTCAGCTCCTAATTATGATTGGTTTAATGGGGTCCGATAAATCTGAAAATTAAATTCTAAAAGAAAAAAGAAAAGGGATAGCTCATAGCTTAGTGTTTAATTTAGGTTAAAAGTATTAATTTTTAATTGTTATATTGTGTTTTTCAAAAATCAATTCGATTAATTTTTAGAATAAAATTAGATTATATTAATTCTATATTAATATATATATATATATATATATATATAAATTGATATTTAAAAGATATACAAAAAGTACTATAAATTGTAATTTTCCGTATATCAATATGATGAAAATACATTATAACTGTTACTCAAAGTCATTTCATTTAACTCAAAAAAAAAATCATGACAATTGAAAGTGAACGGAGATATCGCTACATTACAATTTCTAAAACTTCACATCCTCGTTAATTATGAATTACTCCATAATAACTTTAAAATAAAAGATAAGTAAATATTCCTAGTTGATTAAAAGTATACAACATTTTAAAATGAGGAGAAGCAAATTAATTGAACTTGTTTTTTCCTAACTTCTAGCTACAATCAAAGAATTAACTCAGATAATCTCAAGTAGTTAATGTTAAAAGTGTGTGATGTGTCTTGTCTAAAAGTTAATTAGAGAATTAGGAGTAACACACTTTTACCACTTAATTTTGTATTCGTGCACTTGATTTTGAAGAATTATTAAGGACACCAAGAAAAATATAAGTACATTGGAAATATAGAGTTTCTTATAGAATTTTGTAACCCAAAATTTGTTACGCTTCGGGGTAAGTTTTATAAAAAATTTCTCTAATAGACAAAAAATAGTCTCTAACAATGATTCTTCATAAAAATCGATTTCTTATTTCGCCTGTAATATTATTACAAATAATTTTTTTCTTCAATGTGTACTTGTTCCTTTTAGTAAATTAAGTGGAGCGATTTTTTCGATCTATTTGGTATTAAATAATTACATAAAGTAATAATATATAATAGTCAAATTTACATTTTCAAAATATCATTAATAAAGTTAGTTAGTAAGATATAATACTGGTGATAATATTCTTTTTTTAAGAATTATATCACATCAACATGAGTCAAGTAAAAATAAATGGAGGATTAAATAGTTGTAGAAAAAATCAGAAAAATAAAAGAAGCAATAGTTTCCAGATTAGTTACAATTGATAAGTGAAAGAGATTAAATTTAATAAGCCTCCTCAACAACAACAGTTTGTCTAATTACACTTTATAGCTATAATTTCTAGTTGCTATGGGCAGTTGTGCTTGTATATTTCGTTTGTCAATAGATAAACAGGGTAAGTATACATACATTTTGTATATATACATTTTTTAACTTTTCAAAAGTCTATTTACATATTTTCATTTTTCAATGTATAAACATGGTAATTTATTATGAATTTTTTATAACTTATATAAATCAAATGTATCAACAACTTGTATGAAAATAACTAGGGTAAGAATACATAAATTCTGAATTTATACAATCAAAAATCGCATTATACAAATCATATCAAATATTCAAAATTATAGCTAAAATAAATAATAAACTATAAATATTGTCATTTCGCGGGATAAATATATAAGCACATTTGGTGGATTGAAGTTTGATCATATGGGCTGTTAATGTGTGTCTTTAGGAACCATAGTCCACATATATCATTACAATAATAAGCTAAAAAAGGGCAACAAAATAGAAAGAGAAAAATGGAATTAAGTGAATCAGCAGAAAAACTGTGAGTTCTTATATGGAGAAGTGCAAAGTTAGCTTTTGCATTGTTTGAGGACTTGTGGTTGTAGGAGTAGTTTGATTTCTACTTGTAGCTTATACACTGTTAAAAGCTCATTTAGCTTTGTGTTTTGCTTTTTTGCTTTTAGTATGCAACAAATATATTTTCATAATTAGTTCAGGTTTTGAATATATATACACATATATTCTCTTCTCTCTGTTAATGATACATACATGCATGCATGCTACTTTTCCCCTTGCATGCATAAGGCAAGTCTTGGTACTTTGGGACTGTCTCTTTTATATATATATATATATATATATAATATATATATATATATAATGTTGTTAATCTTGTATTTCAAATATACTTAGAACAAAACTTTGATCGTCTTTGTAAGACAACAAAGTTTAAGAACATTTTCACAACTAGAAAATTAAAACTAGTAGCGAAACTAGAACCAGAAACAGATTTAAAAACAAAATACGAAATATTTTTCTTAAAAAAGAATTGTTGTTAATATGTGTCTAAAGAGTCTTACTGATTCCAACAAACTTTGCAGAAATACGAAGTTACCAAGTTTAATGAACTAGTGAAGAACAAAAGAATAGAAGAACTGAAATTATTTACAAATCTAAAATTTATAAACACGTTATAATATATATGCATTAATCTAATACATAGTAATGCACCTTTCTGTGCTTTAGGAGAACTATTTATATACATAAGGCCAAATATGTGAGTTAATATCTTAAAATATCACTCAACTTTAGAAATTGATCTAGCAAAATCATCAAAGTTTATTTTGTATCAAAAAAATTACTTAACTTAGATTTTTATATCAATAAAATCACTTAACTTTAGGAATTGATCTAGCAAAGTCATTAAAGTTTATTTTGTATCAAAAAAAATCACTCAACTTAGATTTTCATATCAATAAAATCACTCAACTTAGACATTTGTGTTAGTAAAATCACTAAACAAAATTTATCATTATTTTTTTTTGTTTCATATATAATAGACCCTACAAATAAATAAAATTAAGAAAACTAATTTAAATTTTTTATGGGACTAAATAAAAAGAAATAACTAGTAGTTCTATTTATTGGTTCACTAGTTTATCTGTTTTTGAGAATAGCATGAACAAATTATCGATAAAATTTATATTGACAAATCTAATTAGGTTAATTTTTAAAAGTAGTGTTAATTTTTAACTAATAACTGTTCAGAGAATTAACACAAACAAATTATCTAATAAAATTTGTCTTTTTTATTTTGTAACTTTTTTTTAAAAAAAATAATATTATATATTATTGTACTTCTTCATTGAAGCTTAAAATTATTTTGGCTCTGTTAATCTTAATCTTTTTTTATAACGTTAAAATTTTTCAACTTAATTTTTTGCTTTAACTAGTCAATTTTGTGTAAATTTTTTTTGAAATAATTATAATAATGTCATAATGCTTACATACTTTAATATTATAAAAGTATGTATTTCATTAATTAAGTTTGTTCCTAAAGTTATTAACAATTTTTTTATTTTTTAATTCATTTATAGGGTGCATATTTATATGAACATAGAAAATATTTTTTTTACTATATCAAATGTTTTTTTAATGATAAATTTAGTTAAATAATTTTATTTAAATAAAAGTCTAAGTTGAGTGATTTTATTGATACAGAATAAAGTTCAATGACTTTGTAAGATAAATTTTCAAAGTTGAGTGACCTTTTGAAATATTAATTCCCAAATATATGGACAACATGTCTAATTTATCATCATTTTTATTTTATTTTCGCACTTTATCTCGATTTGTATTTCATTCTGAGTTGTTCAATTAATGCATTTTGTAGGTATCATTTAAAATACAATGTTAATTAATATTTACGCCTTTACTATTTTATTTCTACTATTTAACTCTAGTTTTACACTCCCTTTCTTTATCTTGCCTAATATATATAGGATATATTACTAAATTAGGTATAGATAAAAATTTGGCCAAAGATAGATGGTTGGAGACTTCTCTTCTTCCTTTCCTTTCGTTCATTTGTATGAACAAGGAAGAGATACAATATTGTATCAATCATATTTGAAAGAGTATACAACACACAATTCAAATGTATACACACAACATTGTATCAATCATATTCTAAAAGAATATACAACACATTATTATTATTATTATGATACAAATATAATCTATGTCACTTGTAGCCTTAGAAAACCTCGAACCTCTTCTCTTGTGACTGGAGTAATCAGTTATTGTTCGAGATATATATATAAAAAACATGTTAGAGAATGAGATTTGAACTCAGGCTCAACAACACAAGCACCTAATGTGAGTTATTGGACCAATTAAACCATTTGCTTAAGTGTTTTGTGTTAAATTTATACAACTTTTTCTTAATGTCTACATGAATAGATATAGTACGATATAAGACTAATGGGTGCTCGAGCACCGGAGTCCTGTTAATTGTCTGATAGCTAGTTAATTAATTAAGTTGATTAGTTAAAATTAGTTAGTAGGTGGAGACGACAAGTTTGTTAGTGGAGTTTATACATAATATTGATATACAAATCAATTCAATAAATTGTATACGTCCTCTTTTTATCTATACCAAACATAGCTCGATTGTCTCCTCCCTCTTCCAATCTCTCTTCTATTCCTAAAAATATATAAATTGCAATACATTAAGCAATTTATAACTATAAATATTGTTGTATATGTTTATGTTTATATGAAAGAGCTAAAAAATGTT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ATGGGTCGAGGAAAGATAGAGATAAAGAGGATTGAAAACAACACAAATCGACAGGTAACATTCTGCAAGAGAAGAAATGGATTACTGAAAAAGGCATATGAACTTTCAGTTCTATGTGATGCTGAGATTGCTCTCATTGTTTTCTCTACTCGTGGTCGACTCTATGAATACTCTAACAACAAGTAACTCCTCCTCATACTTTCTTACTTTCCTTATTTACACATGTTTATTCCTAATTAACTTAAAATATTTTTAAAACAAAAAAAAACATTATAAGCGATTATTGTTTTAAAAAAAAAACTTGGTTGAATCTCAAAATTTCTACTATAACACATAAATTGAAACAGAGGAGATAAGAATAAACTTAAAGTAAAAAAAATGTTTTTTTTACTAGTTTGTAGTATATTTAAGAAATATTTGTTGTTTTAGTGAATTTGTTTATACTGTAATGTAGTTTAGTGGATGAATGAGCTTTTGAAATTGATCATGCAGGCGTAGAGGATCGTTCTCAGCTCCTAATTATGATTGGTTTAATGGGGTCCGATAAATCTGAAAATTAAATTCTAAAAGAAAAAAGAAAAGGGATAGCTCATAGCTTAGTGTTTAATTTAGGTTAAAAGTATTAATTTTTAATTGTTATATTGTGTTTTTCAAAAATCAATTCGATTAATTTTTAGAATAAAATTAGATTATATTAATTCTATATTAATATATATATATATATATATATATATAAATTGATATTTAAAAGATATACAAAAAGTACTATAAATTGTAATTTTCCGTATATCAATATGATGAAAATACATTATAACTGTTACTCAAAGTCATTTCATTTAACTCAAAAAAAAAATCATGACAATTGAAAGTGAACGGAGATATCGCTACATTACAATTTCTAAAACTTCACATCCTCGTTAATTATGAATTACTCCATAATAACTTTAAAATAAAAGATAAGTAAATATTCCTAGTTGATTAAAAGTATACAACATTTTAAAATGAGGAGAAGCAAATTAATTGAACTTGTTTTTTCCTAACTTCTAGCTACAATCAAAGAATTAACTCAGATAATCTCAAGTAGTTAATGTTAAAAGTGTGTGATGTGTCTTGTCTAAAAGTTAATTAGAGAATTAGGAGTAACACACTTTTACCACTTAATTTTGTATTCGTGCACTTGATTTTGAAGAATTATTAAGGACACCAAGAAAAATATAAGTACATTGGAAATATAGAGTTTCTTATAGAATTTTGTAACCCAAAATTTGTTACGCTTCGGGGTAAGTTTTATAAAAAATTTCTCTAATAGACAAAAAATAGTCTCTAACAATGATTCTTCATAAAAATCGATTTCTTATTTCGCCTGTAATATTATTACAAATAATTTTTTTCTTCAATGTGTACTTGTTCCTTTTAGTAAATTAAGTGGAGCGATTTTTTCGATCTATTTGGTATTAAATAATTACATAAAGTAATAATATATAATAGTCAAATTTACATTTTCAAAATATCATTAATAAAGTTAGTTAGTAAGATATAATACTGGTGATAATATTCTTTTTTTAAGAATTATATCACATCAACATGAGTCAAGTAAAAATAAATGGAGGATTAAATAGTTGTAGAAAAAATCAGAAAAATAAAAGAAGCAATAGTTTCCAGATTAGTTACAATTGATAAGTGAAAGAGATTAAATTTAATAAGCCTCCTCAACAACAACAGTTTGTCTAATTACACTTTATAGCTATAATTTCTAGTTGCTATGGGCAGTTGTGCTTGTATATTTCGTTTGTCAATAGATAAACAGGGTAAGTATACATACATTTTGTATATATACATTTTTTAACTTTTCAAAAGTCTATTTACATATTTTCATTTTTCAATGTATAAACATGGTAATTTATTATGAATTTTTTATAACTTATATAAATCAAATGTATCAACAACTTGTATGAAAATAACTAGGGTAAGAATACATAAATTCTGAATTTATACAATCAAAAATCGCATTATACAAATCATATCAAATATTCAAAATTATAGCTAAAATAAATAATAAACTATAAATATTGTCATTTCGCGGGATAAATATATAAGCACATTTGGTGGATTGAAGTTTGATCATATGGGCTGTTAATGTGTGTCTTTAGGAACCATAGTCCACATATATCATTACAATAATAAGCTAAAAAAGGGCAACAAAATAGAAAGAGAAAAATGGAATTAAGTGAATCAGCAGAAAAACTGTGAGTTCTTATATGGAGAAGTGCAAAGTTAGCTTTTGCATTGTTTGAGGACTTGTGGTTGTAGGAGTAGTTTGATTTCTACTTGTAGCTTATACACTGTTAAAAGCTCATTTAGCTTTGTGTTTTGCTTTTTTGCTTTTAGTATGCAACAAATATATTTTCATAATTAGTTCAGGTTTTGAATATATATACACATATATTCTCTTCTCTCTGTTAATGATACATACATGCATGCATGCTACTTTTCCCCTTGCATGCATAAGGCAAGTCTTGGTACTTTGGGACTGTCTCTTTTATATATATATATATATATATATAATATATATATATATATAATGTTGTTAATCTTGTATTTCAAATATACTTAGAACAAAACTTTGATCGTCTTTGTAAGACAACAAAGTTTAAGAACATTTTCACAACTAGAAAATTAAAACTAGTAGCGAAACTAGAACCAGAAACAGATTTAAAAACAAAATACGAAATATTTTTCTTAAAAAAGAATTGTTGTTAATATGTGTCTAAAGAGTCTTACTGATTCCAACAAACTTTGCAGAAATACGAAGTTACCAAGTTTAATGAACTAGTGAAGAACAAAAGAATAGAAGAACTGAAATTATTTACAAATCTAAAATTTATAAACACGTTATAATATATATGCATTAATCTAATACATAGTAATGCACCTTTCTGTGCTTTAGGAGAACTATTTATATACATAAGGCCAAATATGTGAGTTAATATCTTAAAATATCACTCAACTTTAGAAATTGATCTAGCAAAATCATCAAAGTTTATTTTGTATCAAAAAAATTACTTAACTTAGATTTTTATATCAATAAAATCACTTAACTTTAGGAATTGATCTAGCAAAGTCATTAAAGTTTATTTTGTATCAAAAAAAATCACTCAACTTAGATTTTCATATCAATAAAATCACTCAACTTAGACATTTGTGTTAGTAAAATCACTAAACAAAATTTATCATTATTTTTTTTTGTTTCATATATAATAGACCCTACAAATAAATAAAATTAAGAAAACTAATTTAAATTTTTTATGGGACTAAATAAAAAGAAATAACTAGTAGTTCTATTTATTGGTTCACTAGTTTATCTGTTTTTGAGAATAGCATGAACAAATTATCGATAAAATTTATATTGACAAATCTAATTAGGTTAATTTTTAAAAGTAGTGTTAATTTTTAACTAATAACTGTTCAGAGAATTAACACAAACAAATTATCTAATAAAATTTGTCTTTTTTATTTTGTAACTTTTTTTTAAAAAAAATAATATTATATATTATTGTACTTCTTCATTGAAGCTTAAAATTATTTTGGCTCTGTTAATCTTAATCTTTTTTTATAACGTTAAAATTTTTCAACTTAATTTTTTGCTTTAACTAGTCAATTTTGTGTAAATTTTTTTTGAAATAATTATAATAATGTCATAATGCTTACATACTTTAATATTATAAAAGTATGTATTTCATTAATTAAGTTTGTTCCTAAAGTTATTAACAATTTTTTTATTTTTTAATTCATTTATAGGGTGCATATTTATATGAACATAGAAAATATTTTTTTTACTATATCAAATGTTTTTTTAATGATAAATTTAGTTAAATAATTTTATTTAAATAAAAGTCTAAGTTGAGTGATTTTATTGATACAGAATAAAGTTCAATGACTTTGTAAGATAAATTTTCAAAGTTGAGTGACCTTTTGAAATATTAATTCCCAAATATATGGACAACATGTCTAATTTATCATCATTTTTATTTTATTTTCGCACTTTATCTCGATTTGTATTTCATTCTGAGTTGTTCAATTAATGCATTTTGTAGGTATCATTTAAAATACAATGTTAATTAATATTTACGCCTTTACTATTTTATTTCTACTATTTAACTCTAGTTTTACACTCCCTTTCTTTATCTTGCCTAATATATATAGGATATATTACTAAATTAGGTATAGATAAAAATTTGGCCAAAGATAGATGGTTGGAGACTTCTCTTCTTCCTTTCCTTTCGTTCATTTGTATGAACAAGGAAGAGATACAATATTGTATCAATCATATTTGAAAGAGTATACAACACACAATTCAAATGTATACACACAACATTGTATCAATCATATTCTAAAAGAATATACAACACATTATTATTATTATTATGATACAAATATAATCTATGTCACTTGTAGCCTTAGAAAACCTCGAACCTCTTCTCTTGTGACTGGAGTAATCAGTTATTGTTCGAGATATATATATAAAAAACATGTTAGAGAATGAGATTTGAACTCAGGCTCAACAACACAAGCACCTAATGTGAGTTATTGGACCAATTAAACCATTTGCTTAAGTGTTTTGTGTTAAATTTATACAACTTTTTCTTAATGTCTACATGAATAGATATAGTACGATATAAGACTAATGGGTGCTCGAGCACCGGAGTCCTGTTAATTGTCTGATAGCTAGTTAATTAATTAAGTTGATTAGTTAAAATTAGTTAGTAGGTGGAGACGACAAGTTTGTTAGTGGAGTTTATACATAATATTGATATACAAATCAATTCAATAAATTGTATACGTCCTCTTTTTATCTATACCAAACATAGCTCGATTGTCTCCTCCCTCTTCCAATCTCTCTTCTATTCCTAAAAATATATAAATTGCAATACATTAAGCAATTTATAACTATAAATATTGTTGTATATGTTTATGTTTATATGAAAGAGCTAAAAAATGTT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| Download sequence region |
Get flanking sequences on SL2.50ch11
|
| Related features
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|
| Features this polypeptide derives from |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| mRNA | Solyc11g028020.1.1 | SL2.50ch11:19912270..19920394 | 672 | - | n/a |
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