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Solanum lycopersicum polypeptide Solyc03g119760.2.1
![]() ![]() |
Name | Type |
Length
466
|
Organism |
Description
polypeptide feature inferred from GFF3 feature
|
Location(s)
SL2.50ch03:68304591..68318655
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GFF source
ITAG_eugene
|
![]() ![]() | translated polypeptide sequence |
>Solyc03g119760.2.1 Baculoviral IAP repeat-containing 4 (Predicted) (AHRD V1 *--- B0KWH9_CALJA); contains Interpro domain(s) IPR019396 Transmembrane Fragile-X-F-associated protein
MSWRSVGKSFQALSAHLLLLCFTVLLVVKLDHYSDFSWWVVFSPVWVFHAVVARGRFSLPAPSIPYDRHWAPCHAVVATPLLVAFELLLCIYLESIYVYHSAAVNLKFVFLPLLAFEITILVDNFRMCKALLPGDEESSNDELLWETLPHFWVAISMVFFVAATLFTLLKFCDFNALGWWDLFVNFGVAECFAFLVCTKWSNPAIHRSSDALGASSSSATIRRLNWNSGLVVSSEEEPQSRICGLQDLGGHIMKIPIILFQVLLCMRLEGTPAAAKHISLPVIFLPIFLLQGAGILFATLRFVEKTVLLLRSGAAVGQYHVISSRVRDCFAFMHHGSRLLGWWSIDESSREEQARLYHDGFPGYSTFCGYPPEIVKKLPKKDLAEEVWRLQAALGEQAEITKLSQQEYERLQNEKVLCRICFEREISTVLLPCRHRVLCSSCCEKCDNCPICRVCINERLPVYDV*
MSWRSVGKSFQALSAHLLLLCFTVLLVVKLDHYSDFSWWVVFSPVWVFHAVVARGRFSLPAPSIPYDRHWAPCHAVVATPLLVAFELLLCIYLESIYVYHSAAVNLKFVFLPLLAFEITILVDNFRMCKALLPGDEESSNDELLWETLPHFWVAISMVFFVAATLFTLLKFCDFNALGWWDLFVNFGVAECFAFLVCTKWSNPAIHRSSDALGASSSSATIRRLNWNSGLVVSSEEEPQSRICGLQDLGGHIMKIPIILFQVLLCMRLEGTPAAAKHISLPVIFLPIFLLQGAGILFATLRFVEKTVLLLRSGAAVGQYHVISSRVRDCFAFMHHGSRLLGWWSIDESSREEQARLYHDGFPGYSTFCGYPPEIVKKLPKKDLAEEVWRLQAALGEQAEITKLSQQEYERLQNEKVLCRICFEREISTVLLPCRHRVLCSSCCEKCDNCPICRVCINERLPVYDV*
![]() ![]() | unprocessed genomic sequence underlying each location of this polypeptide |
>Solyc03g119760.2.1 SL2.50ch03:68318655..68304591 (sequence from reverse strand)
ATGAGCTGGAGGAGTGTCGGAAAGTCTTTTCAGGCGCTTTCAGCGCACCTTTTGCTTTTGTGTTTCACCGTTTTGCTTGTTGTCAAGCTCGATCACTATTCTGATTTCTCCTGGTGGTGAGTTTTTTGTTTCCCCCAATTTTTTTTTTTGAGTTTAATTGATGAATTCTGAATAATGAATATGTTTGTTTTTTGTTGAATGTTAGCATTAGTAGTTTATTTCCTTGGATGCTGATGTTGATAGTTTAAACTATGAGTAATCTTGTCTAGGAAACTTATTTATTCATGGGTCGGTTAGGGGTGACAAAACTAGGAATGACAAGGGTCTGTATATGGTAGTAAATAAGCTTGAGTTTGGTTTATATGAGTGGTCAATATGAACACCCTTCTCATTGTTTGTTGGTTGATTTTAACCTGATTAACCCCAAGGTTCATTGTTCCTTGAAATCGGGTTATGCAATCTATGGTGTAGGGGCAGTGAATTTTGCTAAGAGTGTTTGTGGTTTAATAAATATGTATAAAAAGTAATATTTAACCAACATACACATTATAATTTTTGAGCAAAGGGTGTGTAACTGATCACGCGTGAGCTTATGTAGCTAAACTACTGAGTAGGGGACAAAGATAACTGATGCCTGTTTATAACCCTCCATTAGAGACAGAAAGATCTGTTTTTATAGACAAAGGAACTACTAGTATAGTGCCCTTCTGTCCTTTCACCATGTTTAGATTTAGAAGTTTTTCACCATGACTTTGACTTGGATATGCAGGGTTGTATTCTCCCCTGTGTGGGTGTTTCATGCAGTTGTTGCCCGAGGAAGATTCTCTCTGCCTGCTCCATCGATTCCCTATGATCGCCATGTATGACTTTATGCATTAACTTCTTTAAAATTTTGATAAGAAAAAGAAAGTCTGTCCAAACAAAATTACTGATCAAATTTCACTTCTGCTTTTATATTCCATCTATTGTGGGTGTTGCCTCCATGTGGATAGTGGGCTCCATGTCATGCTGTTGTTGCGACACCTTTGCTTGTTGCATTTGAACTACTTCTCTGTATATATCTTGAGAGCATATATGGTAAGAAAGAAAAACTCCACAGTCCTTTTTTATATGATTCCTCAAGTTTTCTGTTTCTCGGTTTTATGTTACTAAGTACTAATTCATGGTGCGTCTTGGTTCCTATTAATTTGTTAACCAGAATTGTCCTTTACTTACTCTTCTTTTCTTGTGTTTTTCTGCAGTCTACCATTCAGCGGCTGTGAATTTGAAATTTGTCTTTCTTCCCTTGTTAGCATTTGAAATAACTATTCTCGTTGACAATTTCAGGTACTGCTGACATGTTTTTTGTGATTTTGACTAATTTGTTTGATTGCTTTACAATGAGAAAACAATCTAGTGGTTCTTGTAGTGCTAGAATTCTTAAAAGAATCTCCAAAATGCCGTTCCTCTTAGGACCTAGTTTTGTTTATAGCTTTTCATTGATATATTTGTGTGTACAGATAAGCATTCATTTCTAAAGGTATTTTAGAAAATCATACCATAAAGGCTTCAAAAGTGAACTATTTGCCCTCTGATAGGGTTAGTGTTAACATTGCTTGGGCCTCCAAGTAGAACTATGTCATTTGTTCAACATATTGGTCACTTCGAATATTTCTTGCCTTTTAGTCCCTTTCTGCAATATTAGCTGTTAAATTTTTGTGCATGACCTGCTGTATGGGAAGTAATGAAAATAAGGATAACTAATAATGGAATGGAAATTGTAATACACTCGCTTATATTTACTTATAAAACAATCATGGGATTTGGATTATACATTCACCTTTCGTCTATATCCGTGTCTTACTGATGGATAAATAACTTTTAACATTTGGGGCAGAATGTGTAAGGCATTATTACCTGGAGATGAAGAAAGCTCGAATGATGAGTTATTATGGGAAACACTTCCGGTAAGTTCATTTATTTGTCCTTGGTGATATAGTAATAGTATAGTTTAGGTTCTCATTGCGGAATTCGTACTTATCTGATTTTCAATTTCTTGATTTTGTGAATTTATCTTATAATTTGATTTGTTCTAGTGTAGGATATGTATCCTGGTCGACCTATAGTTGAAATCATTTGAGATGTGTCTGTACTCTTAGGCATAGTAATCCAACCTATGTTTTAATACCTTTAGTATCAATTTTGAAGCATATAGAACTAAGATCTCTATAACGTGAAGTCTCGTGAGATTAGAAGTGTTTTTCTGTGAAAAACTTATCTAGCTAAGATCTAACAAATTGGATAACTGACCTGTAACTGCATTGTTATTTTCCCTGCTTGTTGACGCCTAAAAGTGTTAGGGGTTTCTATCAACTATGAGAGTGCACTATTCATCACTTAGTTACAAGGATCAGAAATGAAGAAACTAAGATAGTGGAGTTTTAATTTAATAAATACCGGAATAACTTACCTTTGATCTGTTTCTCTGATCCAATAATGATCATATAACTTATAGAAGTTAAATAAGAAGGCGGTTAATAGTTATGCCTTCTATGAAATCTATTATCTTATAAAAAATAAGGCGTTCAATAGTTATCGACACTTAATAAGCGATCGGAAGATTTGTATACCTTAGTTTGTTAATTCTTCACAAAAAGTGGCGTACTATCCTCTTCTGTTCATTGCAAAAAAGACTTGACTTCTTTCTTTTGAAGCAGAATATTCCCTCCTGTAGTTCAAACTATAAACTAATTCTGTTCTTTTTTTCTTGGTTGAACTGGAATTAATACTTTTCTACATTGTTTCAAAGTTTATTCATTAGCTACTCTACTTTTTCATATATCAAACTTTCCCTTCTACAGTCTACCCCAATGATTACATGAGAAGACTTAGATGTGAGTTGTTTAGAAAATGTCCAGGAACATGGGGGACCATTTCTTAAATCTTCCGTCTTTATTTTTCTTGATCCAAAAAAATAAAAAAATAAGAACAATCGTATTCTCATAAAAAAAGTATCTTTCGAAGATAAAAAAAAAGTACAGTATTAATCCTTTTGACCATTTAACCATATTTAAATATGCAATTTTTAGAAAAGTGGGTTCCATTTTGGAATAATAAAAAAGAAAGTCACTATAGTACTCTTTTCTTGAGACCGAGAGTGTTTGTTCTCCAATTTAATACAATGATTTGTTCAAAGAGCTTACCTGTGAGCTAGTTAAACTTGGTCATGCCTTCTGAGTTGGAGGACTGTTATCAATGACTGCATATTGTAATTGATCAGGGTGTGATTGAATGATTTTATGGTGTGTCATTGCAAAGTTTTATGGTTTGAAACAAGTAACTTAGTATTAATTATCAAAAAGAAAAATAAAAAGATACGTATTGGAAAATAATTTGGTTATGGCTATTAAACCGCTGTTCTTGTTTTTTAATAATGTGGAGAATATAGAAGATGGCTTTACTAAATGACGATCTTATGCTTGCTAGCATTTTTGGGTTGCAATCTCCATGGTCTTCTTTGTTGCTGCCACATTGTTCACCCTTCTCAAGTTCTGTGGTATGTACCTCTGACTCTCTGTGGATTTTATTTATTCATTTTTGTTGGTTTGAAGGGTACAGCCCAAAGTATTTCCACTTCATGTTCTTTCCTTGACCTAGAGATCATCTATTCTTTGTACGATGGGATTCCTGCAAGTTTTATGCATTCATTTTGACAAAGAGTGGATGAATTATGTGTGTGTACCTTGAGTTATAGGATTACATTTTAACATGTCCTTAGTTATGTTTAGAGGGAAAGTAGTCATGTTTAGAGGGAAAGCAGGGGCTTGCAAAATAAACAAGTTGTATTTTTTATGGTTTATTGCCAGTTTTTCTAGAAGCCCATGTCAATTCCTCATTTACTCTGTTTAATTATAAAGTAAATGTCATCAGAAAAATAGAGTAAATGAAGAAACTGAAAGAAACCCAAATACAGGCCAAGGTCACTCTGAAAGTGACGTTACAAAAGAAACTGAATGAAGCACCCATAATTTTTTAGCAGAATGGTACAAAGTCTTCTCAATGTTTAGTTGCTGAATTATCAAGACATCTTAAACACTTCTTTTAAGGAGAAGCCTGAAGTAAGGTAAATATTTGAGGTCCACTTTTAATCATTAGGGAGACATTATAATTTTCAGAGTTGTTACTATTGAACCCAATGTTCTTTCCATAAATGATATTTGCGCTGACAGACCAATTATCAAGATGCGTCAATCATTCTTGCTCCATTGCCTAGGCCTTCACGGGTTTAGATTTCCGAGAAGCATAACTGGAGTACCTACTTTTTAAGTGTATGACATAATTAAGGATGCCAGGGAATCTTAAGTTGTCCAAGAGTTCTGTTGGATACAACAAATCTTCATCATCAGTGTCACGATTGCTTTACATACATTGCCTGAGATAAAATATGTTCTTCCTTCATCTGGTATTGTTTTCATAATTGTATCATTCAACTCATGCACCATTTCATTTTATGGCATTAGTATTGCTCTTTCTTTCAAATATGCTGGGTCATTGTATGGATAAACTGCCTCGACAAATGATCCGATTGGATCGTTGAATGATTTGATGCATATATCAGTAGGCAATTTAACAAACTTCCTGTAACATTAAGCGAAGTGAAATCCTTTGTTACATATTGCTGATTTAGATGCTCGTTTTAGTTCATGATATTCATTTAATTATGGCCAGTTATGGTCTTGAATCCACCAGATATTTCCTGCATCATTTAAAAATTAGAACATATACCTTACTGATATCTGGATACTGAATAGAAGAAACATCCTCTAGGAAAAGCAAAACATTAATAATGATCAGCATTTTAGAACGGCATGTTTTTTATGCGATAACTTTTAGGTCTGACAGGATGTGCCCTAAAGAGGTCTCTGTATATTCGCCGTCTATGACCATTTCATTGGTCGATGAAATATTAAAATGGAATAGAGAACTGGAAGACCCTATTATTCGTGTTCCTTCAAGGGCAG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Download sequence region |
Get flanking sequences on SL2.50ch03
|
![]() ![]() |
Features this polypeptide derives from |
Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
---|---|---|---|---|---|
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