Solanum tuberosum mRNA PGSC0003DMT400070439
 mRNA details
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| Name | Type | Organism |
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Description
Calmodulin
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Location(s)
PGSC_DMv3_219_ch11:41004164..41007740
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GFF source
Cufflinks
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- Mapping depth
- 38.445126
- Source id
- RNASEQ28.1153.2
| mRNA sequence
| spliced mRNA sequence, including UTRs |
>PGSC0003DMT400070439 Calmodulin
TTTTTTTCTATTTGTGGATTTACCTAGTTTGTCATGATATCTTTGACTTTATTTCTTGATGGATTGTCTCCATTTGTTCAATGTGGTAATGTGTTTGTGATGGTGGGTTTCACAACCTTCCATTCATTGCTTTATCACGGGAGGTAAAGTGCGTTCAAGTCTATAGATGTGCTTGAGAAAAACCCAAGTTTGTAATTATATGTATGTAACTATAAACATCCACTGGCTGGTAGTATGCCATTGGAATATAGCAGTAATAAGTAAAATATAGTGGTAGCAAGAGTAAGTACTCGAATATGAGTAGCTGCTGTCTTTTGAAATAGTTGATGCTTTTAGATGAATGGAATTCAAGTGATTTTGCCAATTTTATTTCTGTTCTGTTTGGAAATGAGTTTCCATTTGATTTTCCTTATAGCTGGAGATTGATGCGTAGAATTCTTATTAATGATGGTTAACTGTATTCCTCATTGTTGGGATCATTCATAGGCTTCTTATATCTGGAGATCGACGCATAGAATTCTTATTAATGATGGTTAACTGTATTGTGATGAAACTTGTGTTTCTGTTTCTCCTTTTCTTACACTCTGAATGGAGGAGTGAGGTAACCGGTCCCAACTTGTTTGGGATTGAGGCTTCCATATTGTTGTTGAAGCCTTTTCCCATCTATACATAAAGAAGAACCAAAGAGAGGGGGGAGGGGGGGGGGGAGGATGTGAATTGCTAGTTGTAAGTGTTCGTAACTTGTAAGCTCTTAAAACTTAACATGTCCAATAACTATGTGCAACTGTGCTGCAGGTTGCATCACAACTAAGGAGCTTGGAACCGTGATGCGGTCATTGGGGCAGAACCCAACTGAGGCTGAGCTTCAAGACATGATCAATGAAGTTGATGCTGATGGGAATGGGACCATTGACTTCCCTGAGTTCCTTAACCTGATGGCTCGCAAGATGAAGGACACTGATTCCGAGGAGGAGCTCAAGGAAGCTTTTAGAGTGTTTGACAAGGATCAGAATGGATTTATCTCTGCTGCTGAGCTTCGCCATGTCATGACTAACCTAGGTGAGAAGCTTACAGACGAAGAGGTTGATGAAATGATTCGCGAAGCTGACGTGGATGGTGACGGACAGATCAACTATGACGAGTTCGTCAAGGTCATGATGGCCAAGTGAGAATTGATCAACTCATCTTAATCTTTAAAATTGGAAGTACAACATAAAAGGGAAAAAAAAAGGAACGGCAGATAAGTTTGATGAGGTTTCTGTTTCCGGTTAGGATGTGTTCTTTGACATTATTAGCTTTGTTTTGGTGCTTGCCTGTTCTCCTATTTGCATTGTTTTGTAGTGCTGTTCTTTGGTATATGCTTTTCTGCTCTATTCCCATTTTAGTAGTTTGGTTGTTAGTAACTCTTCAGCATTTGGTATTCAAACCTTTCTACAATTAGGGACCTTGAATGTCCTTTTTTGAAACCTTTTGATTGAGTAATTTCATTGGTATTTCATATTCTTGCATTTGTTTGCTTTGCCTTTTTAACTCTTGTGTTTACTTGCTCTTTATGGTCTAAGAAGTTTTGAGTTTTGACGGACTTGTGTCGTAGGGCACAAGTTTGACCCTTGTGCCAAGCGATCCAAGTCTAATGCACAAGTGAAGAAGGATAGGAGGTTGAGCCCATTGTTCCTCAGTCTCGAAGACTATGGTTTCATGAAGTGAAAGGTCGCGAAATGAAGTTCAAAATTGTCTGCCAAAGGCGCTAGTGCGTACTTTGGGGTGATCATCACCACTTGTATCTCATCTCAGGACAATGGAACGTGTAACCCGCCTGCTTCTAGCTTTCGTTCTCGCTTGACGATTTCATAAAACTTTTTACATTCCTTCTACTAATATCACTTCCATAATTCTCCTTTTCCCTTTTTATCTTCTTTCCAATCTCTTCCTCTTTCCTTCTTTTCGAACAAATCTCCTCTGTCCAAATGCCATTTTCAAGCTGTATAGAATCTAATTTTGAGGAAGGGAGCGTTGGAGCAATGATTCAGTTATCTTCGTATGGTATATAGGTTATCGGTTCAAGTTGTGAAATCAACCTTCAATGTTTGCATCAGGTGGGCTACGTATATCACACTTCTTAGGTTGCGGCCTTTCTTTGAATCATACGTTTATGCGGAAGTCCTTGATGTTTGAGTCAAGCAGGTTGTTTGCGCTAACTTCTTTGGAGTGGTTCTTCCTTGAGCCTTACAGTAAAGTGAGATTTTTTGTGCATCGACCTATCATTTTCGCTTGATTTTTCGGTTTGAGGCATAGTTAATTATTGCAAGGTATCTGATAAAGTGATAAAATCTTTACAAAAAGAAGAGTTAGATTTTATTCAGTTTAGCTTAATCTCAACGCATAACTAATTGGATTTGATTTTTCACTACTTTTTGGAATAAATAGATGTTATTCCCTTTTAGTTGGGTTCTCTTGAGGCGCGGGGGGGAGGGGGGGTACTTTTTGATTTTATTTTTTTTAATTTACAGAAAATCAATAAAGAAAAATAACTCATGATTTTCTTAAATAAAAAAAATGGAGAAAATTTTGGTAGGAAAATTGTTTTCTTTTCATATTTACATTATTAAAGACGTGTTAGAAAAGAAAGAACTATTCGTCCAGTGGTTTTATTAAAACCGTGCACGTGATGCCTGAGTTAGATGCACGTTATGATTCGAAACTTATCTCAAATAAAAGTTTAACATTTAACTTATTTTCTCTTATTTATTTTTTGAGTATGAAAATGTCATTAAAGTTAAATGAGAAACATGATTAATGAAGATTTATTCGGCTGAGCTAACTTATTTGAATTGAGACATAATTAAGTTATTGCATTTAAGTTACAAATAGTAGAAGGGTTGATTTATTATCTTTGAATTTCGAATCATGTAATATCGACCATGAAATATTTCTGATGTGCAAATAATAGCATAGCCACCTAGATCATAGAGTGGTCAATCGAATATTTTTCTATCAGAAGAATGTCCTATCTCTATAAAAAATAATATTGTATATATTGGTCAAAGTTTTAACTTCCTTTTAATTAAAATACGATAAATATTTTAACTCATCAATTCATATTTGGTGTCATTTTTGGTTTTATCTTAAGTTACATGGTTTAAATTCGCTATTTATATATTGACTACAGGAGGCGAATGAAGACGGTACAAAGTAGAAGTGTGAAACCCACTTCACAGAGCAATGGAAGAAAAGGCCGAAAAAGAGACCGATGCATAATTCTTTGATCCAAAGAATGTTCTCTTTGGGATCGTTTGGTTTGGAAATTAAGTTATTTCGAGATTATAGTTCTTAAACTGATTCATCCCACTTAAAAGGTAAGTTGAAATAACACCAAATTCGATGGGATAATTAAAATTAAATTTATACTTTGTTTGATTAAGGTAACTAAACGAAGTGTAAATTTAATTTCAAACTTAATTACGAAATATCCTATCTCATTCCATGAACCAAACGACTTGTATTCTATTGTTGAAAAAAATAGCTTTTTATAATTAGCTTTGTGTTTCTTTAATTTTCTTATTAGCTTATTGTATAA
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 Genomic sequence(s)
| unprocessed genomic sequence underlying each location of this mRNA |
| Related features
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| Features that derive from this mRNA |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| polypeptide | PGSC0003DMP400047622 | PGSC_DMv3_219_ch11:41006572..41006964 | n/a | - | n/a |
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| Features this mRNA is a part of |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| gene | PGSC0003DMG400027384 | PGSC_DMv3_219_ch11:41004164..41008897 | 4,734 | n/a | n/a |
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| Features that are parts of this mRNA |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| exon | PGSC0003DME400185624 | PGSC_DMv3_219_ch11:41004164..41007740 | 3,577 | - | n/a |
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