Clone Read LE_HBa0163N16_SP6_262269

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0163N16_SP6_262269
Primer
SP6
ID from Seq. Facility
LE_HBa_163_N16-SP6
Chromatogram
[download]
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
290 trimmed for vector and quality, 1088 raw
Sequence
>LE_HBa0163N16_SP6_262269 (raw untrimmed)
AGGCAAAGATCTCAGCTTGTACATATTTCTATACTAAGATATTGCATTACACTCTAAATAGTAAATAGTTTAGACTGTTTATTTTTACAACGTTTGAATA
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TATATTTTTATTAATTATAATTATTATTGTTATGTTAAATAATATATTATAAAGTAAGAATTATATTTNTATATATATTAAAGAAATA
>LE_HBa0163N16_SP6_262269 (trimmed for quality and cloning vector)
CTCAGCTTGTACATATTTCTATACTAAGATATTGCATTACACTCTAAATAGTAAATAGTTTAGACTGTTTATTTTTACAACGTTTGAATATATAAAATTT
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Warnings:
  • Not screened for chimera
  • Not screened for repetitive elements
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
flanking vector not found in read
Quality trim threshold
20.5
Sequence entropy
0.856888
Expected error %
0.0456502
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0163N16
Clone
Clone name
hba-163n16
LE_HBa0163N16
P163N16
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
79,886
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
pBeloBAC11
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

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