Clone Read LE_HBa0222C18_T7_398636

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0222C18_T7_398636
Primer
T7
ID from Seq. Facility
LE_HBa_222_C18-T7
Chromatogram
[download]
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
2 trimmed for vector and quality, 1904 raw
Sequence
>LE_HBa0222C18_T7_398636 (raw untrimmed)
GGGGGAGGGGGTAATAGATATAATTGAGATAATTAGGAGTGGTGGAGGGAAGGGATATAAGGGCATTTGTGTTCTAGTGAGGATATCTATATTGTGATAG
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TGGT
>LE_HBa0222C18_T7_398636 (trimmed for quality and cloning vector)
TT

This is probably not a useful sequence.

Problems:
  • Short cloning insert
  • Low complexity
  • High predicted error rate
 Warnings:
  • Not screened for contaminants
  • Not screened for repetitive elements
  • Not screened for chimera
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
flanking vector not found in read
Quality trim threshold
20.5
Sequence entropy
not recorded
Expected error %
10.1019
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0222C18
Clone
Clone name
hba-222c18
LE_HBa0222C18
P222C18
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
65,181
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
pBeloBAC11
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

Other Reads:
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