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Solanum lycopersicum gene Solyc03g019790.2

Name Solyc03g019790.2	Type Gene	Organism Solanum lycopersicum
Synonyms / aliases Solyc03g019790	Length 5,788

Description

Alpha-galactosidase (AHRD V1 **** Q9SP05_SOLLC); contains Interpro domain(s) IPR013785 Aldolase-type TIM barrel

Location(s)

SL2.50ch03:61371475..61377262

GFF source

ITAG_eugene

From BOGAS: 1

Length: 5788

Genome Viewer

Related features

Features that are parts of this gene

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
mRNA	Solyc03g019790.2.1	SL2.50ch03:61371475..61377262	1,612	+	n/a

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Genomic sequence

unprocessed genomic sequence region underlying this gene

>Solyc03g019790.2 SL2.50ch03:61371475..61377262
CATAGCATTAATATAAACAATATAAATAGGTAGGTTGTCATTCACATATTAAAACCCCAAAGTTTTTTGCTTCCCCTTTCACTTAAAAGGGGCTCTCTTGAACATTTAAATATTGTTCGTAGCCAAAGCTCTAAAGCCTATCGGAAAAACGATGTCATCAACTTCACCACTTCTGTTGTGGTGCTGCTTGTGTTTGTCTCTGGCTACGGTATATGCTCGTCTGCAGCCACGAAATCTCATCGTTAATTCAAATTTAAGTGTAAATGAATTCAACCGGAGAAACCTCTTGGGCAATGGCCTTGGCCAAACTCCGCAAATGGGGTAAGATTTTGTTTAACAATATATACTGTCGGTGCACAAAACTTATTTCTGCAAGACATTATTGATTGTCTGAATATGATGTCTTTGTAAGTTACGTAGGATATATAAGAATAATGTTAAATTTGATATATTAATAATACTAATGCTCGTATTAAATAATATATTAAATTGTTTCTACAGTGCAGTGTTTGATTTTGTGTTTTAATAATAACAATCACCAATATAGTGAAGAGGTGACAATTGCGTGTTTAATCTATGTTTTTATTACTAATACTACGGATATTAGTTATATGAACTTTAATATATATATTGAAAAGTAATATATTAAACAATATATTACTAACACTTAAAACTAATACATATATTATTTTTTTTTAGTACACTGATGACCCCTCATTGTTATAATGAAAGAGAAATCACAAAGGAATGCTGTGTAGGTGGGAGTCATAATAAAAGCTCGTGAACTTGTCAAGTTGTCTACATGTTTGTTGTACCAATAAAATAATTAACTAAGGTCTGTAAATTCAAAAAATGTTTTACGAGCAAGAAAACAAAAAACACTTCAAACTTTCCAGTGGTTTATTAATTAGTAAAATAAAAATAAAAAATTATCAGTTAGCACATAATTTTCTTCGATTTTTCATCTATGTGGACCCCAACAACTCCATTTATTTCTCATAAGAAATGCGTTCCAAAGAGGACGTCAACTTACCCAAAGAGGACCCCAACACTTCTAAAAATAAATAAATGATTCAAACTGAAGTGTCATACTTTCTCTGTTCGTGGTATTTTTCGTATTTCGAGATTCAAATGAATCTTGATCAAAAATTTTTTATAAATCCTTTTAACATTTGAATTAGTAATTATTGTGACTTATAGTATTTTTTACGTTGTTTACTAATATATAAATTTTATTTCAAAAAATTTGAAGATTTCATACGCAAATGTCTATTCAAAATTAAATTATTTGACTCTTAAAAAATAAAAAGTGTCACGTAAAATAAAATAGAGAAAATAATAAATTACTTATAGTAGATGCGTCTTTTCTAACCAATAAGCACGACAGTAGAATAACACCAAAGACGTTTAAATATAACAGTAACATTTTTTAAGTAACTTTTTACCGTTAATAATGCTCACAAAGTCAAAAGGTAGTGAACACCCATTTGAATATGAAAATCTATTTCCCTTGTTAATTTTTTTATTAATATATCTGAATTAAAATATATAATTATATTTTTATAAAAAATATATGAAATAATATTGATACTTTAAAAGTACAGATGGAGCAGCTGGAATCATTTTGGTTGCAATATAGATGAGAACATAATAAAGGGGACAGGTCAGCAAAATTATTTTCTACTTTGAAATGGAAAAGAAAAGTGTAATTAAAAATATACATACATGTAACCATATAATAACATTTCATTTGCTAGCTGCACAACAGTTGTCACTTTTTTTCTCTTTTTGCTTTTTTCATGTGGCAGCTGATGCAATGGTACATACTGGACTTGCTTCTCTTGGATATGAGTACATCAATATAGGTAAAATATTATATTAAAATGTATAAATTTATTTTATTAAAAGATTTAATTAATATTACTCCACTTTTAATAGAATAATATATGTATCAACAAATATTTTTTAGTCAGTAATGATAATGACTAGTAATAGTGATTGTCATATAGTAAAATAGTAAATGACCTTTTCAATTTTATTACTAAATCATTTATCGTATATTATTCCTTCAGATGACTGTTGGGCCGAAGCCAATAGAGACTCGCAGGTATTCTACGAGTCGTCTTAGTAGCTTTTGTTCAAATAATATATCATATATATAAAAATGTTTATTATTATGTATAAATATTTGATCGTAAACCAAATTATCGTACACTTTAACAGGGAAATATGGTTGCTAAAGGTTCAACTTTTCCTTCTGGGATTAAAGCACTGGCAGATTATGTTCACGGCAAAGGATTAAAACTTGGAGTTTATTCTGATGCTGGGTAAAAAATTACTAATTAACATATTTTATTAGTTACATTTTTAGTCATAATTTTTATTAAAACTAACCATTTTAATTTTTTTTAATGCAGGACTCAGACGTGTAGTAAACAAATGCCAGGTTCATTAGGACACGAAGAACAAGACGCAAAAACTTTTGCTTCCTGGGTATTATTGTGTATGCTTGGCCTACATTATACACACATTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAACACAATACTTAATCATGGAGATTATTTTTTTTGAGTTAATTATTTTTAGTTTAGCATTTAATCATCAATATCTAACTTGTGTTATATTCCTTAGGGTGTTGATTACTTGAAGTATGATAATTGTAACAATGAAGATCGAAGTCCAAGAGAAAGGTACGAACGTACTATACTTGTCTCTCGAAAAATAATTTATATTCGCTCGAAATTAATATCAAATCAATAATATTCTATTCTGATTAAGTAACAAATGAGTTGAAAGATTATAGTGGTACGATGTAAACACCATGGGAATAAATTTTGACCGTTTCTTCCTGTCTCAACAAGAATATAGATATATTAAAATGTTCATAATTAACAATATTTGTTTCCTTAAATGGAACAGGTATCCCATAATGAGCAATGCTTTACAAAACTCTGGAAGGGCTATATTTTATTCCATGTGTGAATGGTGAGTGCATTTTCTTGAATAGTATTTTTACACAAATCGCTACTAATCTGTCTATTTTTATTTGTTATATTATTTTTAAAAAAAAAAATTAAATTGATTAATTTTTAAAGTTTAATTTGATATTTTAAATAAAAAATTGAAATACGTTATTTTGTCACTTTCAGGGGAGATGATAATCCTGCCACGTGGGCTTCCTCTGTTGGAAATAGTTGGAGAACTACTGGAGATATTACTGATGATTGGAACAGGTAAAATATAGAAATTATAAAAATAAATAACTTTAAAGTGTTATTCAGAATCTTCACTTATAAATTTTCACATTTTTATTATATTTACTTTTTAGAGTTTTAAATAATTCTACGCTAAACGTTATGACAATGAATAAAATAGTGATAGTTAGTGTGTTTCGCGTTGCAGTATGACTTCTCGGGCTGATTTGAATGATCAGTGGGCATCTTATGCTGGTCCAGGTGGCTGGAATGGTATAAAATTAATTATCAAAACTTTGTGTATTTTATTTTTTACTAATTATTAAAAAAAAACACTAAAATTAAATTTCTTTTTAACTTAAATTGAAGTGATCTTTAATTACATGGTTTTAATTTGTTATTTCAGATCCAGATATGTTAGAAGTTGGAAATGGAGGAATGAGTTTTGGAGAATATCGTTCTCATTTCAGTATTTGGGCATTAGTAAAGGTTAGTTCTAATTATTATAATTTGAATTTTAAATTTAGTAAATTCGATTTGAAAAAAAAAAAGAATTTAATATGTTATTGATATATTTGTTTTGTATAGGCACCTTTAATTATAGGTTGTGATTTAAGATCAATGGATAATACTGCCCATGACATTCTAAGTAATCCAGAGGTCATTGCAGTTAATCAAGGTAAAAGATTTTGCCTTCTTCTTTTTGGTTCCGTGTGCGTGTGGTAAAATTAACATACGAAAATATGATTTGTTTAAATTTGAGCGAGTTAATGACCTAATCCAGTTCATTTTTAGCTGTCCCATTTAACTCATCTCAAAGTTGTACATATACTCTCATTCATGAATAAGCCATAAGGAGTCTCAAGTTATGCTCAACAAAATATCTGAAGTTACATACGAGTGAAGTTCATGTATTTCCGTCTTAAGTTCAAGTAATACGGTTGGACTTCGATCATTTTTACCTAAATTTTAGTCATGTACTTTTTGCAGGACTTTAGTCATTTTTATTCAAACGTTAATTACATGATATTTCGTTTTGAATTTTGAAGTATGTACTCTGTCGAAATCGAATAACAGAGCACTTTATCAATCATTTTTGTTTTCTTCCAAGTTCAACTCAATCTGTTCATTTAACACCTCTGATTGTATTCTAAAATGATCAATAGCACGTAGTTGAAGACAAGAACATAACATGTTTTTATTTGTTGACATTGAGATCAGATAAACTTGGAGTTCAAGGTAAAAAAGTTAAGCAATATGGAGATTTGGAGGTAAATATTTTGAATTTTGATTTGTATTTCCAATTAATTCCTCTTATATTTATTTACTAAAACTAGTAAATATATACACTTTGTAACAGGTTTGGGCAGGGCCTTTAAGTGGGAAAAGAGTAGCAGTTGTGCTATGGAACAGAGGATCATATAAGGCTGATATAACTGCTTATTGGTCTGATATTGGCCTTGATTATTCCACTCTTGTTGATGCAAGAGACTTGTGGGCTGTAAGTCTTTCATTTATTTTATTTCAATTTTTTAAATTTCTCATATTTGATATTACGATCTATTAATAAATGAATATTAGGCCTAACTTAATTATAAAAATTATCTTACGAGAAAAGGGTTGTCTAAGTCATATTAAAGCGACGACTCATCCCTTAAAAAGATCAGTGTTACCCTTGAACTCTTTACTCGATCATTATTGTTAGTTTATATAGGAGAAATTCTAGTCTAATTTCTAAAATAGTGAAAACGAATTCGAAATTTTAAGTCAAAATATATAGTACTAGTATTT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Get flanking sequences on SL2.50ch03

mRNA Solyc03g019790.2.1

Ontology terms

terms associated with this mRNA

cDNA sequence

spliced cDNA sequence, including UTRs

Protein sequence

translated polypeptide sequence

Related features

Features that derive from this mRNA

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
polypeptide	Solyc03g019790.2.1	SL2.50ch03:61371625..61377031	410	+	n/a

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Features this mRNA is a part of

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
gene	Solyc03g019790.2	SL2.50ch03:61371475..61377262	5,788	+	n/a

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Features that are parts of this mRNA

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
exon	exon:Solyc03g019790.2.1.1	SL2.50ch03:61371475..61371795	321	+	1
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intron	intron:Solyc03g019790.2.1.8	SL2.50ch03:61374180..61374408	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc03g019790.2.1.9	SL2.50ch03:61374475..61374638	n/a	+	n/a

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Genetic loci

Tomato locus agal (alpha-galactosidase)

http%3A%2F%2Fsolgenomics.net%3A8080%2Ffeature%2F17751864%2Fdetails feature 17751864

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Accessions	Seedlots
Accessions		Breeding Program	Seedlot Name	Contents	Seedlot Location	Count	Weight(g)

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