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Solanum lycopersicum gene Solyc04g050150.2
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Features that are parts of this gene |
Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
---|---|---|---|---|---|
mRNA | Solyc04g050150.2.1 | SL2.50ch04:45656390..45692928 | 3,916 | - | n/a |
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![]() ![]() | unprocessed genomic sequence region underlying this gene |
>Solyc04g050150.2 SL2.50ch04:45692928..45656390 (sequence from reverse strand)
ATGCTTGGTGCTAATGTGCTTTTGCCCTTTGCTATTCATAATTGTCAAGTGGGCATTATGATATTATTTCCTGATTCTTACCAGTGTTGTGGCAAGTATACTGTAAACTTACAATGGTATTCTTGATCACAAAAAATATTCACATGGTATTCTATATTCGAGAAACTTTTTGCCGCATTATAACAGTACTGTGTTTTTATATGCCGTCGTTTACTTCAGAGGATCTTTGGTTTGATTTGTCTAGGAGACTACTTAAAAAGTATCAGTTATCTTATATGCAATCGAATCTCAGGTTGAGGAGATTGATGATATTGAAGACAGTTCTGGTGATCCATTTGTTGCGGATGCCATTGCAAATGAAAGAGAGTTAAATCTTTCTGAAGAGCAGAAGAGGAAGTTTAAGAAGGTCTGTGCATGGTATATTCTAGTTCTTTTCTTTGACATTGACACTTCATTTCTTGAAAATATGGAGCCGGATCATTGCATTTTTTTTCATTTTATCTTTTTTCTCCAAACATGTTCTTTCCTTTTTCTTTTAATTAAAGAGTTCAATGTATGTTTGTGTCTTAATTTAAATTTTCAGCTGATGAGAGGTAACTTCTGATGTTGTCTCTGGGCTGTTGATTCCATTGTTAACAATTCTTTTTTTACTTCTCTGTCTTCCAGGTTAAAGAGGAAGATGATCTAAAAACTGATCTGAAGCTTAGGAGATGTTTGAAACAGAGAAGACACAAGAACAGACAGAAATTGGTAATTGCATGCTTTAAACCATCTTTTTAGCTTCTCATATGTTTCTAGAAGTGTATCATCTGGGAAGGGCTTGAACCATTGCACTTGAGTGTGAACTATTATGAGCAAAAGATCTGACCTCTGGAAATTCACTACTTCCATGGAGGGAGCCGACAGACTTCACATCGCCGCCCATTTTTTTTGCCATGAATGGTGCTTAAGTTTCACTCACCTAGCCAGCCTATCCATATTCACAACAAAAGTCCGATAGTGTCCTCTGTGCCCAGAGCATCCCCATTGTGTTATCCGTGAATTAATCACATCAACACAAATCAATGGCAATAACTATTTTTTTTTAATAATCAACAAAAACTAGATTTGTATAATCAGTTCTGGATCTTCAAGAATGACTAGTGAAAGCATAACTTCAGAAATATGTCCAAAAATTATAAAAGGGGCCTAGTGTTTTCTTTATTAAGAAAAGGATAGAAGAATGAGAAGATAAAAGTTCTGAGAGTAGCTATCGTTGTGTACCTGTCATAATTGGATAAAGGAAAAAGGTTGAATGTTAACCTGAACTTTGTGTTACTCATTTGAGTCTGTATAGGAAATGTATGTAAGTGGGTGTGCTATCCAAAATTGCATTGTTCTGATTATATATGACTACGGTACCAAAGAACTATCAAGGTCTTCTTGTTCACTGTGTACCTTAAGTTTTCTTCTTCAGGCAGTAATGTTGATGAAGTTCACAACGGTTATGCAAAATCTTCTATCAAGTCAGAAAAGTAGTTTGATTGCACAAGCTTGGCTGTTTAATTTTCTTCGACCCATTCATATTTATTGGATTTTCCTATTTTATATTCTACTTCATTTGGTACTCTGTTATTTCAACCAGGAGGAGATACAGGAAGATACAACAGATGTCACTACTGGTTATTTATCTCAAGATTTTGGCTTTGACAAGAAAGAGTATTCCACCGTTGATGATGGGGATGCGCCAAAAAGCAATGAAGTTACATCGGTTATTGATGCCACAGTTTCAGAACATGAAATTGATGCTGAGGCCAAAGGATTGAAACTTTTACACAACTTCGAAGAGATGGAGCCTCAAAGTAAAAAGGCTCGGATCATTATACCAGATAGTGATGAGGAGGATCTTCCTGGGAAAATGTTGTCTCCTACATGTAGTTTGAGCGAGACAGAAGATCAATCAAATCCACAAAGAGATGGAGATAATGTGCTTCCAGTTAGTTCCCTTCCTGTATGCAATGAGAAGCAAAATTTTCGCTGCACTGCTTGTGATAAAGTGGCTATTGAAGTCCATGCACATCCTCTTTTGAGAGTTGTCCTTTGCCTGGACTGCAAAACTTCAATGAAAACAAAGATGCAGGTAAGTTGTAACCATCCTTGCTTAGTTAGAATAAAGATAGCATAGTAGAGCTATTTTTTCAAATTGCTATTAACACATAGATTGCATAATCTCTTTTTCCTATCAATTTTTTTTATGCAATCTATGTGTTAATAGCATTTTTGGAATTTTTTTTAGCTGTGTTTCTGTTTAGACGCATTAAGAGATTGCTATAGTGTTGGATATTTGCAATCAGGGATATGCATGTCATTACCTGTTATTTTTTTTACTAATGTTGGTTGACTTTAAATTCAGTCAATAACTAGATGTGATTCACAGTGGTCTGTTTCTCTCACTCTACATCTTGTTACATTGTACAGGATGTTGATTGCTCAGAGTGCTACTGCAGATGGTGTGGGCGTTGCAGCGATCTGTTAAGCTGTAAATCATGCAAAAGGTTATTTTGTAGTGTGTGTATAAGGAGGAACCTTGGTGAAGAAATTTTAACAGGAATTAAAACATCTGGGTGGCAATGCTGCTGTTGCTCCCCAAGTATCCTGCTTCCGTTGGTTTCAGTGTTGGAGAAGATCATGGAGTCTCAAGGTTTGGTAGATTCAAATACAGACACGGATTCAGATAACTCAGATGCTGATATCAACGAGCATAAAAGGTACACCATGTACTTAATAATTATGTCAATGTGTATCCCTACATCATTAAGTTGCATATCTTTAGAATTTGCCCTAATTTTGTGTATTTTTGCATGATTAAGGCAATCAATTAAGCTCATACAGCATGTGTGCTCGATCGAGCTACTCTTAGTTTATTAATAATACAAAAGAAGTTTGCATTCTCTAGATAAATAGATTTTATTTTAAGCAGTTTCACCCATGTTTTGGAAAATGCTGTGTCTCATTCTAATTGAGAAGTGTTGTGGCGAGGGGGTATTAATGCTTAATGTGTTTGCTGTTTTCCTATTCTCTTTTTCCGCGGTTGTTGATGACACCAATGAGAGTTTTTCTGGAGCATTTTGTTGCACAATTAGTTTGAAAAAAAAGGGTATTTTCTGCCTCATATATGGAGGTCCAATTCTGTTGCACCCAAATGGACTTAATGATTTTATATTAGTATTTATGCTCTATAATGGTTGATGAGCCTCCTCATTTTTTTTTTTGAAATTAGCAATGTTAAAGTTGATGAACCTCCTTTTTTCCCAGCGCGTTTACCATTTTCATCTCTGTGCTACAAAATAGACTGAAAATAATGGAAGGACTGTGTTTCTTAATATAATGAAATAATGGAAGGACTATATTTTCTTGAAGCAGCACCAAGAGAAGGCCTAAAAAGAAAATTAGAAGAATCCTGGATGATACTGAGTTAGGGGAGGAGACAAAAAGGAAGATTGCAATTGAAAAGGTAAAATTCCTAGCAATTACATTTTTTCCTGTCAACGCTTGCTTCTTAAGGCATCTGTTAATGCCCGTATACTTGCAGGAACGCCAAGAACGCCTCAAATCTCTGGGAGCAAAATTTTCAAGCAAGACTATGTTCATGGATTCTGGGGGTTGTAGCAAAAGCTCGTATGAAACTGGTAGCTTGGAAATGCTTGGTGATATTCAAACTGGTTACATAGTTAATGTGGTGAGGGAGGAAGGGGAAGAGGCTGTCAGGATTCCACGCAGTATCTCCGCAAAACTAAAATCTCACCAGGTCTTGTTCTATGCAGTTGTTGATCTCGTGTTTATTAGTTTCTTGCCCTCCCAAGTAGTATACTGATTTCACATCATGACAATTTTGATATTTTGAACTTGTGAATAGTACTTTAATCTGTTGCAAGAATGAGAAAGTTGACCCTGTTTTTCCCTCTTTCCTTCATCACTAAGAAAACAATGATGAAGCTCCTTGGTCTTCTGTTCTTTATTTGCTAAATGCTACATTATTCAGACCCTTCACTTTGATGAGGAGCACTTCTGACATGATCCTATTCCATTGGGATCTTTGGCAGATCCTAGAACTAGTAGAAATTGTGTTAGATTCAGTCGAGGTCTCGGTGAGTTTGATCTTTCACGGGCAAAGAAATTGAAAAAATGTAATAGAATTGTTGGTAAAAAAGTATTATACCTATTTGCATATCTTGTCTACACCTAATTAATCTCTGGCAAATCGTTCTTACTTTTGGCATAAAAAACTTATACTTCAACGATAGCCAAGGTTGGAATCTGAAAAGATCCATGGCAGAGATAAACAACTAAATCATCTTATGGTGTAGTGTGAGGAAGGGGGAGGGGATGGGGGTGGGAAGAAGATAGAGAGACTACAATGTGAAAATCACAAAACCAAAGCAACTGAAAGATTTTGCTATTTTGGGACAGTGGGTATGTTGCATGGTGGCTGGAAAATTTTCTATATTACTGTCGTGTTTTGTTTAACTGGCTTTTTACCAAGTAAAGATAGTTTTTCTTGGTTTTTCCAGATAATTAGAAAAGTGACATGTCTCCATTACTTTAGTAATACTAGTTATACCCAAGTAGAACTCAAATAATTTCATACATTTGCTTAGGCAAATCTTTTGTACCCGTATCCAGTACTTTCTATGTACTTGTGAAATTTTTAAACCAAATTTGACATCTCACAAGGATCATAATTTGACATTTTTCATAAAAAGAAAAAGAAAATTTGGCACCAGCACCCAGGTCCATTAAACGTAGGATAAAAGCAAAGATATATAAAACAGTGGAAAAGAAGTTGGCATATGATGTACATCTTTTCTGATTCCGTCATTTTCTCATTTTTTTCCTTCTTCTGTATGCTGATCCAGCAGATATCAATCAATCAACTAGCTGCAAGTTTCTACATGGAATCAGAAAGGTTTTTGCATGCATTGTTTCAGTTTTCTATAAGTTCAGTTCCACTCTGTCATCAC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Download sequence region |
Get flanking sequences on SL2.50ch04
|
![]() ![]() |
![]() ![]() | terms associated with this mRNA |
![]() ![]() | spliced cDNA sequence, including UTRs |
>Solyc04g050150.2.1 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7 (AHRD V1 *--- CHD7_CHICK); contains Interpro domain(s) IPR000330 SNF2-related
ATGCTTGGTGCTAATGTGCTTTTGCCCTTTGCTATTCATAATTGTCAAGTTGAGGAGATTGATGATATTGAAGACAGTTCTGGTGATCCATTTGTTGCGGATGCCATTGCAAATGAAAGAGAGTTAAATCTTTCTGAAGAGCAGAAGAGGAAGTTTAAGAAGGTTAAAGAGGAAGATGATCTAAAAACTGATCTGAAGCTTAGGAGATGTTTGAAACAGAGAAGACACAAGAACAGACAGAAATTGGAGGAGATACAGGAAGATACAACAGATGTCACTACTGGTTATTTATCTCAAGATTTTGGCTTTGACAAGAAAGAGTATTCCACCGTTGATGATGGGGATGCGCCAAAAAGCAATGAAGTTACATCGGTTATTGATGCCACAGTTTCAGAACATGAAATTGATGCTGAGGCCAAAGGATTGAAACTTTTACACAACTTCGAAGAGATGGAGCCTCAAAGTAAAAAGGCTCGGATCATTATACCAGATAGTGATGAGGAGGATCTTCCTGGGAAAATGTTGTCTCCTACATGTAGTTTGAGCGAGACAGAAGATCAATCAAATCCACAAAGAGATGGAGATAATGTGCTTCCAGTTAGTTCCCTTCCTGTATGCAATGAGAAGCAAAATTTTCGCTGCACTGCTTGTGATAAAGTGGCTATTGAAGTCCATGCACATCCTCTTTTGAGAGTTGTCCTTTGCCTGGACTGCAAAACTTCAATGAAAACAAAGATGCAGGATGTTGATTGCTCAGAGTGCTACTGCAGATGGTGTGGGCGTTGCAGCGATCTGTTAAGCTGTAAATCATGCAAAAGGTTATTTTGTAGTGTGTGTATAAGGAGGAACCTTGGTGAAGAAATTTTAACAGGAATTAAAACATCTGGGTGGCAATGCTGCTGTTGCTCCCCAAGTATCCTGCTTCCGTTGGTTTCAGTGTTGGAGAAGATCATGGAGTCTCAAGGTTTGGTAGATTCAAATACAGACACGGATTCAGATAACTCAGATGCTGATATCAACGAGCATAAAAGCACCAAGAGAAGGCCTAAAAAGAAAATTAGAAGAATCCTGGATGATACTGAGTTAGGGGAGGAGACAAAAAGGAAGATTGCAATTGAAAAGGAACGCCAAGAACGCCTCAAATCTCTGGGAGCAAAATTTTCAAGCAAGACTATGTTCATGGATTCTGGGGGTTGTAGCAAAAGCTCGTATGAAACTGGTAGCTTGGAAATGCTTGGTGATATTCAAACTGGTTACATAGTTAATGTGGTGAGGGAGGAAGGGGAAGAGGCTGTCAGGATTCCACGCAGTATCTCCGCAAAACTAAAATCTCACCAGGTTGCTGGGATTCGATTTATGTGGGAAAATATTATTCAATCTATCAGGAAAGTCAAGGCTGGGGATAAAGGTCTTGGTTGCATCCTAGCTCATACTATGGGTCTAGGTAAAACGTTTCAGGTGATTTCTTTCTTGTATGCTGCTATGAGGTGTGTGGATTTAGGATTGAGAACTGCTCTCATAGTCACGCCTGTAAGTGTTCTGCATAACTGGCGGCAGGAATTTATAAAATGGGAACCATCAGAAATGAAGCCTCTCCGTGTCTTTATGCTTGAAGAAGTTCCAAGGGAGAGAAGGGCCGAGCTACTCCAAAAATGGAGAGTAAAAGGTGGCGTTTTCTTAATTGGCTACACTGCTTTCAGAAATTTGACACTAGGGAAGAATATAAAAGAGCGCCACGTGGCCAGAGAAATTTGTCAGGCTCTTCAGGACGGACCTGACATTCTTGTTTGTGATGAGGCTCATATTATCAAGAATACCAGAGCTGATGTTACTCAAGCCTTGAAACAAGTCAAGTGCCAGAGAAGGATTGCATTAACTGGATCTCCTCTTCAAAACAATTTGATGGAGTACTATTGTATGGTTGATTTTGTGAGGGAAGGATTTCTTGGCAGCAGTCATGAATTTAGAAACCGCTTTCAGAATCCGATAGAAAATGGTCAACACACCAATTCTACAGCTGATGATGTTAAGATTATGAATCAGCGATCTCATATTCTCTATGAACAGTTAAAAGGATTTGTTCAAAGAATGGACATGAATGTCGTGAAAATGGATTTGCCACCAAAAACTGTCTATGTGATGTCTGTAAAGCTTTCTCCTTTACAGAGAAAATTGTATAAAAGATTTCTAGATGTTCATGGCTTCACCAAGGACAAGGTTTCTGGTGAGAAGATAATGAAGAGATCATTTTTTGCCGGGTACCAAGCCTTGGCTCAGATATGGAACCATCCTGGGATTTTGCAATTGACGCGAGAAAACAGAATCTCTAGTCGTCCTGAAGATCCTGTTGAGATCCTTCTTGCAGATGATTGCTCAAGTGATGAGAACACATATTATAATGTGGTTTCTGGAGAGAAGACGAATAGCAACAATGAAGCTCTCAAAAAAAATCATAATGGCTTCCTCCATGGGGATTGGTGGAGTGATCTTCTAGATAATAATTGCAAAGAAGTTGATTATAGTGGCAAAATGGTTTTGCTACTCGACATCCTGACAATGAGCTCTAATGTTGGTGACAAAGCACTCGTGTTTAGTCAGAGCTTGTCAACCCTAGATCTCATTGAACAATACCTTTCAAAACTAACGCGCCCAGGGAAAAAGGGGAAGTACTGGAAACGGCGGAAAGACTGGTACAGGATTGATGGAAGAACAGAATCATCTGAAAGGCAGAAACTTGTTGACTGTTTTAACAGTCCATTGAATAGAAGGGTTAAGTGCGTACTGATATCTACTAGAGCTGGATCTCTTGGTATCAATCTTTATGCTGCCAACCGTGTAATTATAGTTGATGGCTCTTGGAATCCTACTCATGATCTTCAAGCTATATACCGAGCTTGGAGGTATGGTCAAACAAAACCTGTTTTTGCTTACCGTTTACTGGCACATGGAACGATGGAGGAAAAGATATACAAGCGCCAGGTAACAAAGGAAGGTCTTGCAGCACGGGTGGTTGATAGGCAACAAGTACATAGAACTATATCTAAAGAGGAAATGTTGCACCTTTTTGAATTTGGAGATGACGAAAGCTGTGATATACCTCTGGAATTGAAGCAAGTTAGAGAACATGCTGGTGAAGCAAACTCAAATGTAAATGTTGGAAGTGTTCAGAAACAAAAATTAACCTTTCCAAATGGAAGTTCTTCTTCTGACAAGCTAATGCAAAGTTTGATTGACAGGCATCATCCGCGGTGGATTGCGAATTATCATGAACATGAAAGTCTCCTGCAAGAGAATGAAGATGAAAAGCTATCAAAAGAAGAGCAGGAAATGGCGTGGGAAGTGTATCGGAGATCTATTGAATGGGAAGAGAGGAGAGTTTTGCCTGATGAACCTGTTGAACAGCAGCATATCTCTACCACTGAATCATTGTTAAAGCAAAAGCCATTTGTTCCCAGGGCCACCGTTTTTCCGCCAGCGGACCGTAATCTTGTATTTGCAGTGGGGAGTTCTAGATGCCGTTTGGTGCATAGGAAGTGCACAAAGCTATCACATTTGCTTACTCTTAGAAGTCAAGGCACAAAGTGGGGTTGCAGCACCGTTTGCGGGGAGTGTGCTCAAGAGATCAAGTGGGAGGGTGTTAGATCAGCAAAGTAATGCCATCCATGTATTTATATTATAGTTCAGCCTTTTTTGGGGCGATTCAATACACTGTGAGGGACTTGGTAAACATTCAGTTTTAGGTTTCAGCCATGACTTGAGAAAACAATCTACTCATTTTGGGGTAAGGGAGATGGAAATGTTCTACTGAGATTTGGCTCTTTGTTAAGTGAAACTGTTGTCATCATTTGTATTTTGAAAAATGCAGAGGGATATCTCTTTTGTCTGAACTGCTACATCATATTGCAAAGAAGGAAAT
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![]() ![]() | translated polypeptide sequence |
>Solyc04g050150.2.1 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7 (AHRD V1 *--- CHD7_CHICK); contains Interpro domain(s) IPR000330 SNF2-related
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MLGANVLLPFAIHNCQVEEIDDIEDSSGDPFVADAIANERELNLSEEQKRKFKKVKEEDDLKTDLKLRRCLKQRRHKNRQKLEEIQEDTTDVTTGYLSQDFGFDKKEYSTVDDGDAPKSNEVTSVIDATVSEHEIDAEAKGLKLLHNFEEMEPQSKKARIIIPDSDEEDLPGKMLSPTCSLSETEDQSNPQRDGDNVLPVSSLPVCNEKQNFRCTACDKVAIEVHAHPLLRVVLCLDCKTSMKTKMQDVDCSECYCRWCGRCSDLLSCKSCKRLFCSVCIRRNLGEEILTGIKTSGWQCCCCSPSILLPLVSVLEKIMESQGLVDSNTDTDSDNSDADINEHKSTKRRPKKKIRRILDDTELGEETKRKIAIEKERQERLKSLGAKFSSKTMFMDSGGCSKSSYETGSLEMLGDIQTGYIVNVVREEGEEAVRIPRSISAKLKSHQVAGIRFMWENIIQSIRKVKAGDKGLGCILAHTMGLGKTFQVISFLYAAMRCVDLGLRTALIVTPVSVLHNWRQEFIKWEPSEMKPLRVFMLEEVPRERRAELLQKWRVKGGVFLIGYTAFRNLTLGKNIKERHVAREICQALQDGPDILVCDEAHIIKNTRADVTQALKQVKCQRRIALTGSPLQNNLMEYYCMVDFVREGFLGSSHEFRNRFQNPIENGQHTNSTADDVKIMNQRSHILYEQLKGFVQRMDMNVVKMDLPPKTVYVMSVKLSPLQRKLYKRFLDVHGFTKDKVSGEKIMKRSFFAGYQALAQIWNHPGILQLTRENRISSRPEDPVEILLADDCSSDENTYYNVVSGEKTNSNNEALKKNHNGFLHGDWWSDLLDNNCKEVDYSGKMVLLLDILTMSSNVGDKALVFSQSLSTLDLIEQYLSKLTRPGKKGKYWKRRKDWYRIDGRTESSERQKLVDCFNSPLNRRVKCVLISTRAGSLGINLYAANRVIIVDGSWNPTHDLQAIYRAWRYGQTKPVFAYRLLAHGTMEEKIYKRQVTKEGLAARVVDRQQVHRTISKEEMLHLFEFGDDESCDIPLELKQVREHAGEANSNVNVGSVQKQKLTFPNGSSSSDKLMQSLIDRHHPRWIANYHEHESLLQENEDEKLSKEEQEMAWEVYRRSIEWEERRVLPDEPVEQQHISTTESLLKQKPFVPRATVFPPADRNLVFAVGSSRCRLVHRKCTKLSHLLTLRSQGTKWGCSTVCGECAQEIKWEGVRSAK*
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Features that derive from this mRNA |
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---|---|---|---|---|---|
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Features this mRNA is a part of |
Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
---|---|---|---|---|---|
gene | Solyc04g050150.2 | SL2.50ch04:45656390..45692928 | 36,539 | - | n/a |
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Features that are parts of this mRNA |
Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
---|---|---|---|---|---|
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intron | intron:Solyc04g050150.2.1.13 | SL2.50ch04:45670984..45671057 | n/a | - | n/a |
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intron | intron:Solyc04g050150.2.1.16 | SL2.50ch04:45661829..45662030 | n/a | - | n/a |
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intron | intron:Solyc04g050150.2.1.19 | SL2.50ch04:45659156..45659234 | n/a | - | n/a |
intron | intron:Solyc04g050150.2.1.2 | SL2.50ch04:45692637..45692880 | n/a | - | n/a |
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intron | intron:Solyc04g050150.2.1.7 | SL2.50ch04:45689358..45689435 | n/a | - | n/a |
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