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Solanum lycopersicum polypeptide Solyc02g084700.2.1
 Polypeptide details
 Polypeptide details
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| Name | Type |
Length
645
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Organism |
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Description
polypeptide feature inferred from GFF3 feature
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Location(s)
SL2.50ch02:47798592..47812178
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GFF source
ITAG_eugene
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| Polypeptide sequence
Polypeptide sequence
| translated polypeptide sequence |
>Solyc02g084700.2.1 MORC family CW-type zinc finger 3 (AHRD V1 *--- Q4VBZ9_HUMAN); contains Interpro domain(s) IPR003594 ATP-binding region, ATPase-like
MPPKVEKLPINVVELDSSDDEGTGVPVVGMTKPEINHGGNSLSKSPVIENPNAVVPPDSNYRPLDSRSFWRAGNFEVGRIKSSAIHGELEHARVHPKFLHSNATSHKWAFGAIAELLDNAVDEVSSGATFVKIDRISNPRDNSPALLFQDDGGGMDPDRLRKCMSLGYSSKTSNSTIGQYGNGFKTSTMRLGADVIVFSRSSRSGRATQSVGLLSYTFLRRTGQDDVIVPMIDYDITGHWAEPIVYGSQDDWSTNLNTILEWSPFATKLDLLQQFDDIKSHGTRIIVFNLWLNDEGIYELNFDDDDEDITLRDEANHGNTSKTNKRGRELQSHISYRLRYSLRAYTSILYLKKFTNFSIILRGKPVEQYNILDELKLTKVITYRPQLAGTSKEILVETSLGFVKDTPSSVCGFNVYHKNRLIRPFWKVTADGSSKGNGVVGVLEANFIEPAHDKQDFERSSLFFKLETKLKQIVMDYWKGHCHLIGLKPLEPHLQNLLRESFVPPQVQVANAQTPSPTKFQTVTDLAAHPRPHLRSAQSGNSRRTNCNMELPGVQPMTGNATESVKKDTQISSSSCMSIDQICEENIQLFRRCESFIQRETELKRTIEELEKELEDTKKKTSELSTRLESQKKLKLLKQLGQKA*
MPPKVEKLPINVVELDSSDDEGTGVPVVGMTKPEINHGGNSLSKSPVIENPNAVVPPDSNYRPLDSRSFWRAGNFEVGRIKSSAIHGELEHARVHPKFLHSNATSHKWAFGAIAELLDNAVDEVSSGATFVKIDRISNPRDNSPALLFQDDGGGMDPDRLRKCMSLGYSSKTSNSTIGQYGNGFKTSTMRLGADVIVFSRSSRSGRATQSVGLLSYTFLRRTGQDDVIVPMIDYDITGHWAEPIVYGSQDDWSTNLNTILEWSPFATKLDLLQQFDDIKSHGTRIIVFNLWLNDEGIYELNFDDDDEDITLRDEANHGNTSKTNKRGRELQSHISYRLRYSLRAYTSILYLKKFTNFSIILRGKPVEQYNILDELKLTKVITYRPQLAGTSKEILVETSLGFVKDTPSSVCGFNVYHKNRLIRPFWKVTADGSSKGNGVVGVLEANFIEPAHDKQDFERSSLFFKLETKLKQIVMDYWKGHCHLIGLKPLEPHLQNLLRESFVPPQVQVANAQTPSPTKFQTVTDLAAHPRPHLRSAQSGNSRRTNCNMELPGVQPMTGNATESVKKDTQISSSSCMSIDQICEENIQLFRRCESFIQRETELKRTIEELEKELEDTKKKTSELSTRLESQKKLKLLKQLGQKA*
| Genomic sequence(s)
Genomic sequence(s)
| unprocessed genomic sequence underlying each location of this polypeptide |
>Solyc02g084700.2.1 SL2.50ch02:47812178..47798592 (sequence from reverse strand)
ATGCCGCCTAAGGTAGAGAAGCTTCCAATTAATGTCGTCGAACTCGACAGTAGCGACGACGAGGGCACCGGCGTTCCCGTCGTCGGGATGACAAAACCAGAAATTAATCACGGTGGTAACTCACTGAGTAAATCACCGGTAATAGAAAATCCCAACGCCGTTGTTCCACCGGATTCTAATTACAGGCCACTGGATTCTCGAAGTTTCTGGAGAGCTGGCAATTTTGAAGTTGGTCGTATCAAATCATCTGCTATACACGGTTCATCTCTCATCTTTTTTTTTTTTTCGCAATTCACAATTTAATTTTACTTGTAACATGAGGTAAGAATTACGTTGGTTGGTTAACTGTAGGTGAATTGGAACATGCTCGTGTTCATCCCAAATTTCTGCATTCCAATGCTACTTCTCATAAATGGGCGTTTGGAGGTAAATTTTATGGTTAAGTAGAGTTAGAATTCAATTGCTTTTTGTTGTATTTGTTGCAAGGTCCTATTCATGTTCCAGTGTTGTCTTTTGTTGGATGGACTTATTTTATAATCAGAATTATTTTCTATCTATCTTAATGAGATTGTGAAAGAAAACGTCTTCTATCTATCTTAATGAGATTGTTAAAGAAAACCTTTTTTATCTATCTTAATGAGATTGTTAAAGAAAATCTGCATGACACTTGTTCTATGCCGAAGCAAAAGTGCCTTGTCCTCGGAACATAAAAACTAACCCGAGGATACTTTCGAGGTTGTCTAACAATTATTGTGTGCTGTACATTTACATGTGGCACTTTGATCTACTATATTATTTTTGGTTGATAGAAGAGCATAGTGCCAATCTTATCAGTCGTAGTTTTGTGGTAGTGGGAGATAGTTAATTAATAAGTACATTTCTGTGTGGATCCATTCTGCTCTTACTATTGCATGACCATTGATATTTTGAATGTCATTGCAGCAATAGCTGAGCTTTTGGACAATGCTGTTGATGAGGTATATTTAGAAGTTCAGTATTTCATGTATAATATATTGATTCTATCGATTCTACTTGAAATTTGGTATCTGTTGAATTGGAGCTTGTCACCCATATGTCTTTGAGAGTTCTGCTATATTTTGTTGTCCGACACTGTCTTCTTGATAGTTTGTAAGTAATGCAATAGAAGAACTTTTGCAGGACGAACAAAGCTCAATGATTCAGTTAAAAAGCACATTTTCTTCTTTTTGTATTTTGGAGGAAACATAAATTACCCTTTTTAAATATAGTTGGACAGTTCCTTGAGTTACTTAACCATGTAGTGTCCTTGAATGCGGCTGTATACTGGGTTTCCCCTGTTCGCCAATTGTATCCTCATAAAAAAAATTAGTTGTGAATACTACCTAGGATTTAGGCATCTTTGGATTGGTTTTTGGCGAAAAACATAGCTTTTAATTGTTCATACGGACATTATATTTTTATCTGATTGGTCTTAAAGTGATGTTCACAGTTGGATTGGTGGAAATCACTACTTGTAAGAGAACCATTCTCTTTTTGTTTCTATTATTATTTTCATTTGTCTTCTTGTTGTCTAAGTGGACCGTGGCCCTCAGATGTTGTTGTGGATACATTTTTTTTGGTACTTTTCAGAGATTATTTAATCCGCAAGAGGTTTTGCAATTGGAATATGGTTCCTGTGTCTATGTTTCTTTGAAGAGATAGACATATGAGGTATCACGATCATCTTTTCAGCCAAGAGCTTGTTGGGTCTCCATAGGGAAGTTTGATTGGGTTTTGTAAATTTTGTTACCAACAACTTTTTAAATTACTATGGCACCAAGTCATTAGAACAAGAAGGGTACAAGTTTACCCTTCTTTCTCTCCCCTTGTCTATTAAGTAGGAAATGGAAGATCCCTTTTGGTTAGAATTTTAGGTCAGATGCCAGTTTGTTTTGGATACCTTCACAACTTTATTGACTTTCTAACCTTCAGTGTGTTTCATTTCCTCCTTTGCCATTTTGATAGAAATTCAACTTTTTAGAGACTTAAATGTCTTAACAATAATTCTCACTAACCTTTGGTTTCTTCAATTATACCTAGTAATTCTCAAGGTAATCGAGTTTGGCTCCCAATGTTTTGGTAATTGCCGTTGTAAATATTTCTTTCTCTCATTCTTTTTTGTTCAATGGATAAGGTTTCACTCACAATAAGTGCATCCTCTTCGATTGTTGTTTCGAACACAACATCATCAAGTTGAGAGTGCCTTATATTAATGTCTAATGTGCACATTTCCTTTGACAAGGAAGAGCTGTGAGACACATTCTATATGTACTGTTTTACTGTTTTGCAACAAAGTAGGGACTGCAATTGTTATTATTCTAAGGAATCACTTGCTTTTCCCTCTTCAATTTTGTACTTTCTGGTCTTGAAAAAGCGGGCCTTGAATTTATAGCACTTACAACATTCTTATATTGATTTTTTCTTTATAAATGTGAGCGTAACTATCCTCCATTCTTCAAGACTAGAGATCTCTTCAATTTTTTGCTTCTCAAGTTCTCCTCTTCTTTTAGATCTACAATAGAAATTGTTATGTTGGTTCTACTTAAATTGTTTGTTGCTTGAATTTAGGGTATAAATGCCTAGATCTCTTGATGTGTTTTCTTCTTGATTATGACATGCAGACAACTTAGCTGATAATTTTGCTCTTTCGACCTGAACCCAGCACATCTGTCTATCTGTAGTTCTCTGGGGAGTTTTCCTTTTACTGAAGATTATATGCTCACAAACTCATATCATCTCATTATTACCCATCCGTTAACATCGAAGGTCTTATGATTTATAAGGATGACATCCTTCTCCCCCATGCCTTCTTGTAAAAAGAAAATTCTGTCTCTGCTGCTTGCACTGATAGATTATGTGGTTTCACTTTCATGTAATATCTTATTAAGCAATTTAGATAATGTGAATAAAAATAAGATTTTATGTTGAAATCAATCTCTCTTGCACTTGCATAAATTTTCTTTTGTCTAATGACAATTGTTCTGTCTTTAATTGCATGTTAGGTAAGTAGTGGCGCAACATTCGTGAAAATTGACAGAATCTCTAACCCAAGGGACAACTCTCCTGCATTGCTCTTCCAGGGTGTGGTATCGCTGTTACTTAACCTTCATCACTATCATACTATACCTTGTTACAATTGCCGTAACATGTATTATATCATATTGAGCAGACGATGGGGGTGGTATGGATCCAGACCGCCTTCGCAAATGCATGAGCCTGGGTTATTCTTCAAAAACATCAAACTCAACAATTGGACAATGTGAGCTTCTTCCTAGAGTTACAAATAATTGGGTCTGGTGTACTAATTTGTGTTACTGCCATAATCAAATTTTTGCACTCATTGCTGCTTGGGAATCACTTATACTCCTGTTAGGTTTTGAGGCATTTTATGCTACTTGACTTTTCTTTTTGATGAATAAGCTGCTTGAATATTTTTTTAAAGCTATAGCTTTACCTGGATTTTAGATGGTAATGGATTCAAGACGAGCACCATGCGGTTAGGCGCTGATGTAATTGTCTTCAGCCGTTCATCCCGTTCAGGGTATCTTCTCTTTCCACCTCTCTGTCTACATATATCTATATATCTATCTATCTTGAAGATAGGGGCAAGGTCGCGTATATCCTTACTGCACTTGTTGGATTACATTGGGTATATCGTTGTTGTATATATTGCATCTTTAACATACCAATGACAATACCTTAGATAGGAGGTTATGAAGGTCGCAAATTGGTGTAGATGGTTAATGGTTAATAGGTAGTTGAGCGTTGTCTCGCTTTCCCAAGAATAGGTGTGGTGGTAGTTTGGTGCACTCTACCAATTTCCCCTTCATACCAGTTGTAGTAGCATCTTTCTCGTAGTTGTCTGTCCTATGATTTTTGATGCTACTTGTTATTTCTTGTACTTCAGTTATCACATTATTTGATTATTTGGCTCCTTGTTTTCTAAATACTATGTTATGTGTTCCTTTTATTTGCTATGTCTTCTTTACTTCTGTGTTCTTCTTTTTTAATTGCTTTTATATGCGTTACTCATGCTGAGAGTCTTTTGGGATCAACCGCTCTACATCTACGAGGTAGGGATAAGGCTTGTGTACACTTTACCCTTCCTAGGCCCTACTTATGAGATTACACTAGGTATGTTGTTGTGCGCGCGTGTGTATATATATAATTATATATATTAATTATGGAACCTTAGGTTCTTCAAGAAATCACATTGGGTTCTTCATGAGTTGTTTTGCGAATTACCAACTCTATAAGGTTTATATTATTTCCCTTCAAGAATAGCTTATTATATAATTTAATTACAAACAAAATCCCCTGTAACGGACACCAAACCACTCACCTTTCAAACTCTTCTATTGGTAAACATGTAAACCTAACTAAGATATTCAAGACCAAGGAAGTGACGTCTCTTATGACTTTGGTGGTTAAAATGCCAGTTTTCATTATAACAACATTTGTAATATCTCTGATGACAGCGTGCCTTCCAATTTCCATAGAGAACTATGTTCTTGTGTAGTTTCTCTACTTACTGTATACTTCTTGTTTACGTGATGGATTCGGGGTGGGGGTGTTCCCACAACATCAATACACTACTTACTTTATTTAAAATTTACGACGTCTCAGATATCATTGTAAAATACCTAATTTCATTTACAAAAGAGTAATCTTTGTTTTTTTTTGTTATGGTTGACTTATGAAACTGAAAATAAGATTATTTTCAATTTTAGTTATCTGTTAATACTTTCATTATTGTATGTCTGATATAAAACTAGTGATGTCAATTATAACTTGGATTTTACAAGTACCGAATTGACACATTAGGTATTTACTATAGCTTCGTTAAGCTGTGCGCATCAGTTGGAAGAAGAGTTCACATTCTATTGAATCGGTTTTGCATAAGCTGTTTCTTGCTAGCCCATCAGTCTTGTGTTTTTCTTGGCACTTTTTGTTTTTAGAGTATATTGGTTATGTGTAGTGAA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| Download sequence region |
Get flanking sequences on SL2.50ch02
|
| Related features
Related features
|
| Features this polypeptide derives from |
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