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Solanum lycopersicum polypeptide Solyc03g115390.2.1
 Polypeptide details
 Polypeptide details
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| Name | Type |
Length
910
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Organism |
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Description
polypeptide feature inferred from GFF3 feature
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Location(s)
SL2.50ch03:65108843..65124047
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GFF source
ITAG_eugene
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| Polypeptide sequence
Polypeptide sequence
| translated polypeptide sequence |
>Solyc03g115390.2.1 ATP-dependent RNA helicase (AHRD V1 **** Q16S17_AEDAE); contains Interpro domain(s) IPR011709 Region of unknown function DUF1605
MVVKDEEDDRRVRRRTSQDQDDSDNSESEEEILRDQREREELERHIRERDAAGTRKLAEPKLTRKEEEEAIRRADALEQDDIGSLRKVSRREYLKKREQKKLEELRDDLEDEQYLFEGVKLTEAEERELRYKKEIYELVKKRSEDTGDMDEYRIPDAYDLEGGVNQEKRFSVASQRYRDPDAAEKMNPFAEQEAWEEHQIGKANLKFGSKDRKSRSDDYQFVFEDQIEFIKAAVMDGVNVDQEPSTDSIEKTMANSAFEKLQEDRKTLPMYPYRDDLLQAVNDHQVLVIVGETGSGKTTQIPQYLHEAGYTKRGKIGCTQPRRVAAMSVAARVSQEMGVKLGHEVGYSIRFEDCTSEKTILKYMTDGMLLREFLGEPDLASYSVIMVDEAHERTLSTDILFGLVKDISRFRPDLKLLISSATLDAEKFSDYFDCAPIFKIPGRRFPVEIHYTKAPEADYLDAAVVTALQIHVTQPPGDGDILIFLTGQEEIETAEEIIKHRIKGLGTKIAELIICPIYANLPTELQAKIFEPTPEGARKVVLATNIAETSLTIDGIKYVIDPGFSKMKSYNPRTGMESLLVAPISKASANQRAGRSGRTGPGKCFRLYTAYNYMNDLEDNTVPEIQRTNLANVVLSLKSLGIHDLLNFDFMDPPPAEALLKALELLFALSALNKLGELTKVGRRMAEFPLDPMLSKMIVASDKYKCSDEIISIAAMLSVGNSIFYRPKDKQVHADNARMNFHVGNVGDHIALLKVYSSWRETNFSTQWCYENYIQVRSMKRARDIRDQLEGLLERVEIELTSNDNDYEAIKKAITSGFFPHSAKLQKNGSYRTIKHPQTVNVHPSSGLAQVLPRWVVYHELVLTTKEYMRQVTELKPDWLVEIAPHYYQLKDVEDSSSKKMPRGTGRAS*
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| Genomic sequence(s)
Genomic sequence(s)
| unprocessed genomic sequence underlying each location of this polypeptide |
>Solyc03g115390.2.1 SL2.50ch03:65124047..65108843 (sequence from reverse strand)
ATGGTAAGCTGCTGTAATATTGAATCTTGTTTTAACAAGTTGCTTTGTTTTGACTGAATATGATGGTGCAGGTAGTTAAGGATGAGGAGGATGATAGACGGGTTCGGAGACGAACATCCCAGGACCAAGATGACAGTGACAACTCTGAGGTACGACATATGGTGTATTCTTTTGACTTTCTTGCTTGTTCACCTTTCTCTGTACTCAGAAATCCCGATCCACTTGACGTCAACTGCATGTCTTTCGGTTGCAGTCGGAAGAAGAAATACTTCGGGACCAAAGAGAGAGGGAGGAGTTAGAACGACATATCAGAGAGCGAGATGCTGCCGGGACTAGAAAGGTGAGCAATCTTAACTTTGTTTGAACCTCTGTGTGCTTAGATACCAGGCGGTGCTTCTATGATTTGAATTCGCTGTCAGTTTGTTTTCGGTGGATTGGTAGATAAATCTATTTGTTCTTGAGCGTTTTCGAGTTGTAAAATTGACGCGCGAATGCACTCTCGACATTAGAGATTGGTCCCTTACAATTACAAATAAAGTGGGGTTGTCTTGTGGATTTAACTAATTTTAAGCATCTTAAACCAGCAACAACAAACACACATGACAGAACAACTATGCCTCAATGCTAACAAATTTGGATCAGCTGTATGAACCCTCACTGGCCATGCTCCCCAATTTAATTCATCTCAGTCCAACCTATGTGAGGATTCATCATGCATTGACTAGTTTGACCATTTTTACAACATACCACAACCCTTGTCCTTTTCCCGGGCTTGGGACTGGCGATGTAAGCATCTGAAGCCAGCAATGCAATTGTAGATAAAGTTTTTTTATTTGAACGCCTTTGTTTCTTTTAATTGTAGAAGTGTAGAGCTGTGGCATATATTCACTACTACTAGGTATTTCTGTGTTTTATTTGCTGTCATATTCATCGTCTTCTAATAGGTTGCCAGTCTGAGCATCACATGCTTTAATTGTGTTTTCTTTTGAATCTTTGCGGTACCTTCTTGGTACTAGCCTTAGTAAACACTTCATCTCAAAAAAAATAAAAGGAAGAAGCTTTGATTTGTTTTTTGCGTTGATATCGCTAATTCTTTGAAGGCCTCTCTTGATTAGTTGGACTTCTCATTTTTAAAGCGGTAAAATGGAGGCACGTATGCAGCCGTATTTTCTGTGTTATTTTACTATTATACATCATTTGTGATTGGTTTAGTTGGAATATCACACCCCTTTTTGTATTTCTGCTTTCACATATTTACTTGAAATCACCTGATATGATTTCGTTTGTGTCTATTAATGAAGGTCAGACTTGTTTCTTGTATGCCAACATTAACTTCTCGTCTTTGTTATAATGTGGTATTTTGTCTTCAATAACAGTTGGCAGAGCCAAAATTAACAAGGAAGGAGGAAGGTACCTTATTGTAGTTACAATTCTTGCTGTATATTTATTTGTTTATTTTTCCTGTTTTTCAGTAGAAAGAACAGTTTATGCAAATGAGCTCACACACTCATAATTAATAAATGACAGAAGAAGCAATCAGGAGGGCTGATGCATTGGAGCAAGATGACATTGGATCTTTAAGGTTAATGACCATAGAATCTGGTTCAGTATTCTATTATTATCTTGTATCTCACCAAAAATTTTTTCGCTTTAATAACCACGTAGATCCATCCTTAACTTGGAATACCTCTTCTTTTGTGGTTCTTTTACTTGTCTATTTTATTCAAAGAAAGTAACTGAGGTGTATTTGAGTAGTTAACATCCAAAAAAGAAAAGAAGAAGAAAGAAATGGGAGGTAGATTAAATAGGTCTTGTAGTTCCAATGTTGTTGATCTTGGGAAAACATAATTTTGCTTGATGGGGGATATGATAATAATGGATTTAAATTGGAGCCTTTTGACTTTCTTGGCTTAGAGCTTGGATATCAATTTTTTGGTTATTTAAATATTTCACTCTTAAAGAAAAACCAAACAATAGATAGATCTGTATATCAGTTAAATTTTAATTCAGGCATATCTGCAGACAATTGACAAGTACATGCAGATTAAGAACTCGGTTTACGAAAGTCATTCGTCAAATCATCCTGACTGTTTAGTTTGCATCAAAAGTATTGATGGAACAGTAATTTTTTAAAAATATGGAGTGCGTCTGTCCGAATAATCTCATACTTCTTTCATTCTAAACAAGTTAAAGAAGATTTAATGGCGTTGCACTTCAAGCAACTTTCTTTCTTTTTATCTTCTGCACTCTCCAACTCGTGATGTTTCATCTGTTGTCCTTTATTCTTCATAAAAACAAAGAATTAAAGATATTTTCTTCTACTGTCCACCAATGAATCGTTGAACATCAAGATATGGGAGTTCCTATTGAATTTCCAATGCATCCGGTGGGGGTTTGTGTCCTCAGTGTGACACGTGCCTGACAACACCTGTTCATGACAATCCCATCTCCTCTTTTAAGTTCTTGCATGTCAGAGTTGAGAGGAGAGGTAGTACTATGGACAGAAAAAGACACATCGTTGCGTTTTGTACTAGAGAACTATTTTCCTATTCATCAGTTCTAGGGTTGGTTAGGTATATAAATGAGGAGCACTTGGTGTTAATGCAGAACAAGGTCTTGTTGAAAATAGACCGATATTATGTTATTGATTGAATAACTCTCACATATTATTTGATCCAGGAAAGTTTCAAGGCGAGAATACTTGAAGAAAAGGGAGCAGAAGAAGCTAGAGGAACTCCGGTATTTACATGATTGTACATTATAGCTCACATCTTCACTTATTATATGGAAGTAATTTACATTGTTCTATGTGATATGATGTAAAAATATTTCATTCTGGTTACTGGTCAATGTCTAACCACATTTGTGGTTTTCCAGAGACGATTTAGAAGATGAACAATACTTGTTTGAGGGAGTGAAGCTGACAGAAGCAGAGGAACGTGAGCTAAGGCAAGGAAATACACTTTCCCCCCTTGTTTTGATGCCCATTCCGGACATATTCTTAATTTGAGATTTTGTTTGTACTGATTTCTTCTTGCAATTGATTATATAGTGAATTCACTCCGTGGCACTTGTATATTTCAAGCCTTGTTTGTTGCTACTTGGAGATTGCATGCTGTGAAGAGCATCTACTGTTTTGGTATTGAATCCTAAAGTGAATCCTAAAGTGCCTCGTGTTTGTCATTCTCTTCTAGGAGCTTATATATGGATGGGTATACATGCTTATCTTTCCTGCTTCAGTGGAAGTCCTAATTCTAGTTAACATGAAATCATCTAGTGTTTTTCATCATTTGTCTGTTTGGTTATGAAATACATATTCCTGTGATCATTCAGAGAGATAAAATTTCATCGTTCCGTTATCATATGAAGATTCTGATGATTACTTACTGAATTCTTGTGAACGTGGAGTTAGTGCCTTTCTGCATTTTTTTTTTGTGTCCATTCTTTATAATAGGTTCTGGTTGAATGTGGGATTGCTTTGTATATGCATGTTGTTGTGTACTCAGAACCTGTACATTTGCAGATATAAGAAGGAAATATATGAACTTGTTAAGAAACGATCAGAAGATACCGGTGACATGGACGAGGTATTTAATATTCTGAATATTTTATCGTTCCAAGAACATGTCTCATTACATTCGTTATTTTATTGTCTCTGTCGTTTATTGCTTGTCATAGTCGCTAGTATCTCCGTTGCTTTCCCTCCCCCACAACATACATACAGAAAAGTAAAAAAGAAAAATGAGGTCTAGATATCACTGTATCTTTGTCTATTGTTTTCTATATGAGTTATTTAGTGCTTTGATCCAATAAAGGCTACATCTGGGTACTTCTACCTAAAGGATGAGCTTTCCTTGCGCTAATCTTCCTTTATGAAAGACTTCTCTTTATCCCATAACAATATTGTTTCCTTATATATTCTCTCAAGGCTTGATAATAATTTTGTGAACTTGAGGAATAGCCTTTTATCCATTCCTTAATGCTTTTTGATGCACCCAAGAGGTTTTATATGTATAGATGATTCAATGTCATTTATAGGAAATTATATCTTTTTTATCGTTTTCTGCTTTTACTGTTTTAGTGTACTTCTTGTATTCAGATTTTTTCCGTCCTTTGTAAATAAAATTTGTTACTTAATGAAAAAAAACCTCTCTTAAAGCTTAAGTCCAGTTAAATTCAGAACTTCGAATGAAAAAGCTTAACTTGTGGATTTGTTGTCTAAATTATATGTTTCTTTCATAGTTAAAATAATGAATGATTTTACCTTTTCTCGAAGGCCTCCTTAAAAGTATCAAGAATCGGAAAAGAAAACCTCAAATGTTTGTTTTCACTCTTTCCTTCTCCGAATATATTAAAAGATATTGGTTATTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGAGGGGGGACTGTAATTTGAATTTTATGAACTATTGTAAGCCCTATATTATTATTTATACGTGGTTTATTTTCGTATCCAATGTTTACTGTACCAAATAATTCATAAGATAAGTCCAAATCATAGCTAGTGGCTGAGAGGAATTTGATTAAGGGGATCAAAAAAGTTTAAAAATTGTCACATTTTGGATATGAACCTATGTCAAGGGGATTCAACAACTTAATATATACATAAAAGAACTGTTTTAACCTTATTGCATTGGTTAAATTTTTCGGTTAAGGGATTCATTATAACCCCTTTTACAAAAGGTAGCTATGTCGCTAATCATGTCGAGTTGAGTTTGATTCTTTGTTACTAGTGCCACCAATCTGAAAAATATGTGAACCAATTGTAAATATTAGAAATAGGGGATATAAAATAAGTTGATTCTGAGAGACGGAATATGAACTCTATGCCTTTCTCCAGTTTCTGTCAGTTCTCATATGAAGATCCCTTATAGTTGCTTGTTTTAAATACAGTATAGGATACCTGATGCTTATGATCTTGAAGGTGGTGTAAATCAGGAAAAGAGGTTTTCGGTGGCTTCGCAGCGATACAGGTTAGTTATATTGA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| Download sequence region |
Get flanking sequences on SL2.50ch03
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| Related features
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|
| Features this polypeptide derives from |
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