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Solanum lycopersicum polypeptide Solyc03g120200.1.1
 Polypeptide details
 Polypeptide details
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| Name | Type |
Length
1,041
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Organism |
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Description
polypeptide feature inferred from GFF3 feature
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Location(s)
SL2.50ch03:68651930..68665587
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GFF source
ITAG_eugene
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| Polypeptide sequence
Polypeptide sequence
| translated polypeptide sequence |
>Solyc03g120200.1.1 Regulator of telomere elongation helicase 1 homolog (AHRD V1 ***- RTEL1_AEDAE); contains Interpro domain(s) IPR013020 DNA helicase (DNA repair), Rad3 type
MPIYKIRGIDVDFPYEAYDCQIAYMEKVIQSLQNRSNALLESPTGTGKTLCLLCATLAWRKSLGGFSVRKSGRRDHISSSQQSDESSQSESSTLPSIVYASRTHSQIRQVVKELKRTNYRPKMVVLGSREQLCIHEEVSQLRGKTQTNACHALCKKRKKRYCAHFSRVAEFMKINPSIGEEPIDIEDLVNIGRSSGPCPYYVSRELHKTVDILFAPYNYLIDRGYRKSLNIQWTNSILIFDEAHNLESLCADAASFDLSSGLLTACISEAKNCIDLSIERREMSSDKSCNPDNFAILRALLLKLEKKIGEVPIDSKELGFTKPGPYIYEFLADLNITQKTANMLIDIIEEASVLLEEDTNTAEDKKTNKSKSTVCRLESMGDILQQIFRDDGNAHAQYYRVHVQEVQGNGMDSFKGKGSRTLSWWCFNPGIAMEQFSRLGVGSIILTSGTLSPMDSFAEELKLDFPVRLENPHVISDNQIWAGAVPVGPSGYTFNSSYRTRDSIEYKQELGNAIVNFARVVPDGLLVFFPSYYILEQCIGCWKTLGQSISMGSSTIWERICKHKLPVVEPRQSSLFPTAIEDYMAKLKDKSASGAVFFAVCRGKVSEGLDFTDHAGRAVVITGIPFATRTDPKVRLKREFLDQQMALQPTGSKVLTGEDWYTQQATRAVNQAVGRVIRHKDDFGAIIFCDERFTYSNRQSQISCWIQPHIKCHSKFGEVVFSLTRFFRDGRIHGPTKPEMMLLDDKETVKSLGSSQSQLHFEKLLTSLVSSVDIPCSTNQSSSSVKQGNGPGGLEDILPANKSSLRSDKIAKLLAVKHASNLLVPGRKDMPISNQKIIDLTKHELADEPPKDVVAPCSMKRPRLALTGSDCQSDHFRKPHDSPDCSSVAHHLLSESDFRYLLNNKKSQYSDNQSTRNSNLDRANLLADERTSRKIAGLVDLQNEDGILSSAPCNNEEKGSAFLVQVREKLTDTEYHEFVGYMKSLKSKAMKIGQVLQSITRLFSLPDRLPLLHRFKDYVPAKYHSLYDQYLKRNQEVAHL*
MPIYKIRGIDVDFPYEAYDCQIAYMEKVIQSLQNRSNALLESPTGTGKTLCLLCATLAWRKSLGGFSVRKSGRRDHISSSQQSDESSQSESSTLPSIVYASRTHSQIRQVVKELKRTNYRPKMVVLGSREQLCIHEEVSQLRGKTQTNACHALCKKRKKRYCAHFSRVAEFMKINPSIGEEPIDIEDLVNIGRSSGPCPYYVSRELHKTVDILFAPYNYLIDRGYRKSLNIQWTNSILIFDEAHNLESLCADAASFDLSSGLLTACISEAKNCIDLSIERREMSSDKSCNPDNFAILRALLLKLEKKIGEVPIDSKELGFTKPGPYIYEFLADLNITQKTANMLIDIIEEASVLLEEDTNTAEDKKTNKSKSTVCRLESMGDILQQIFRDDGNAHAQYYRVHVQEVQGNGMDSFKGKGSRTLSWWCFNPGIAMEQFSRLGVGSIILTSGTLSPMDSFAEELKLDFPVRLENPHVISDNQIWAGAVPVGPSGYTFNSSYRTRDSIEYKQELGNAIVNFARVVPDGLLVFFPSYYILEQCIGCWKTLGQSISMGSSTIWERICKHKLPVVEPRQSSLFPTAIEDYMAKLKDKSASGAVFFAVCRGKVSEGLDFTDHAGRAVVITGIPFATRTDPKVRLKREFLDQQMALQPTGSKVLTGEDWYTQQATRAVNQAVGRVIRHKDDFGAIIFCDERFTYSNRQSQISCWIQPHIKCHSKFGEVVFSLTRFFRDGRIHGPTKPEMMLLDDKETVKSLGSSQSQLHFEKLLTSLVSSVDIPCSTNQSSSSVKQGNGPGGLEDILPANKSSLRSDKIAKLLAVKHASNLLVPGRKDMPISNQKIIDLTKHELADEPPKDVVAPCSMKRPRLALTGSDCQSDHFRKPHDSPDCSSVAHHLLSESDFRYLLNNKKSQYSDNQSTRNSNLDRANLLADERTSRKIAGLVDLQNEDGILSSAPCNNEEKGSAFLVQVREKLTDTEYHEFVGYMKSLKSKAMKIGQVLQSITRLFSLPDRLPLLHRFKDYVPAKYHSLYDQYLKRNQEVAHL*
| Genomic sequence(s)
Genomic sequence(s)
| unprocessed genomic sequence underlying each location of this polypeptide |
>Solyc03g120200.1.1 SL2.50ch03:68665587..68651930 (sequence from reverse strand)
ATGCCGATTTACAAAATTAGGGGAATCGATGTCGATTTCCCTTACGAGGCTTACGATTGCCAAATCGCTTACATGGAAAAAGTTATTCAGTCCCTTCAAAATGTATTACATCTTTCTTCATCATTCATTGGATTTTAAATGCTTTTGGATACAACTTTCTTGTTAATGTACTTGTTTTTTGATAGCTTGTGAATGATTTAGTGAGTTTAATGTTTCAACTAGTAACCATTTGACATTAGAGAATTGAATAGGGCTTCTGTTGTCGGGAATTAGGAAAATTACCCTAATTTCTGTAGTTTCTTGATAATCACATGTGATTGCACTGGTGGAACGTGGAATTGTAACAACGGATTCAAAAAATTCGAACTTGCTATCTAAAGAAATTTTGTGAACTACCTTTGCCAATACAATGAGAACTTCCCTCATGTCGAGGGGATTCAAAAGTTTCTCTGTATATATGAAAAAAAATAATCAGTTTTTGCCCTTTTTGCGCAATGTGATGTTCTAATGAAAAGGAATTAATTAAACACCTTTCTTAGCTATGGCTCTGTCACTCGATGGTCCAATCAACATGGTATTTTCAGTTTTCACAGTAAGCAGCTGAATTAGTAATTTTGTCCTAAAGAGTCGAATTAACATCTGACATGATAGATACTATTTATTTTTTTATAAAATACAGATTTCCTATGTTTACATGAAGTGTTTTTCTATGTCTGTATTCCTTTTTTTTTTGTGTGTGTCTGTAGTCTAAAACAGTTTCTTGTTTTACTTGATGAATGCGACAGAGATCCAATGCATTGCTTGAGAGTCCAACTGGGACTGGGAAGACCTTGTGTCTTCTTTGTGCCACATTGGCTTGGAGGAAGAGTTTGGGGGGTTTCTCAGTCCGGAAGAGTGGAAGGAGAGATCATATTTCCAGTAGCCAGCAGTCTGATGAGTCTTCTCAATCTGAATCTTCAACGTTACCGAGTATTGTATATGCATCACGCACACATAGCCAAATTCGACAAGTGGTGAAAGAGTTAAAGAGGACCAACTACAGGTAGAGTCAAACTGTGATTACATTATTGAACATGTGGTTTTATTATTATCTTTTACTATTAGCATATTATTGAAGTATTTCAAATAGTCTTCTAGTTCAGTAGCAGCATTTTATTAAGAACCTTTCTTATTTGCAATACTTCACATTTACGTATGCCACAACGTGTCTGATTCTGTCAAATATAATGTGATGTATAGGCCCAAAATGGTAGTCTTAGGGTCTCGGGAACAACTATGCATTCATGAAGAAGTAAGTCAGCTGCGTGGAAAAACACAGACAAATGCCTGCCATGCACTTTGCAAAAAACGCAAAAAACGTTATTGTGCCCATTTTTCTCGAGTTGCAGGTATATTAAGCATATCTGCTTGTCGTCAAACTCTTCATGGTTGAGCTGGATTCTGTTTTTGGTTATTAACTCACTTATAAATGTTCCTTGTGTCATTTATGCTTCAGCCTTCCCACATCCCAGGTGTATTCTTCTCCTAAGGGAGGTTATTGCACTCTTTATTTTATTAATAAGTACATTTACCTGCATGGTTCAACTAAAAAATTTTGGCTCTTTTTTTCCTGCTCATATTCCTTCTCAATCCCTATGGAATTATGTAAATAGAAAGAAAAAGTATTAGACCAAATATTTGTTGATCTATTGATTTCTTGTCTTGAAGTTAAAGATTTAACCAATTATTTAAAAAGCTAAAATTGGTTGCACAGAATGATAGGTTTTCAATGTCAGCCTGGCGTCTCTTGCATTGTATAATTTTAAACTACTTTTTAAATTTTTACGCTCGTAGGACCACTTCATTCTTTTAATTTTATTGGAGAAACAAATAAGCAAAGATGCAAATTTACTCGGTGGAACATGTGGTACATGATACTCTAAGAATTTATTTAGCTTTCTAGTTAATAAAGGTGCTTTCTATGCCAGTAGTCAAACACTTTTTGATACTGAGAAAGTATGTATATCCAAATATATAATGATTGGACATATCAAGACCCCTCATAATAGCTAGTCACTTTGCACTTGCTTTTTTTTGCTTGATCATACTTTATTCGGTAAACTCAGAATCAGTTATTAATTTATCATTTGGTCCTTATATTGTTGCATCATCTGTGTATGATGTCTGTGATAAGGAGACGAGCATCTGTACCTTGAATGTTCAGGCAGATAACTCTGAAGAACACTGAAAAAGTTGTCCTATTTAGCTAAATTATATAACTGGTTTGATTGCTTGTTTGGTTAATTATTACTTCTGTCCTATGCATATGTCAGCTATATGCTCTTTGGTATTTTGACTTTTGGAACATCATAAATAGTTGACTCCTTGTATAGTTTATGTTTCCTTTCTCTATCTCATCATGATTACCGTTCCTTTTGTCCGTGTATATACTTTGTGGTCTGGAGACAATGTGTACCTTGATCTTTTAAGAAGATTTTCTTTAAGAACTTAGGCCAAATGTCCTCGTTAGCTGGATGAAATGACTGGTTTATTGCTCATATGACTTAACTTCTTCCTCCTCTGTCCTTTAATGCATGTCTGCTATATGACTTCATTGATATTACTTGGAAGATCATGAATAGTTGAGTGCTTGTATAAATAACCTGTACTTTCTTTGTCTTATCATGCTTACAATTTTACTTCTGCCTTTTTTTTTTGGATAAAGTAATAAATTTCATTAGAAAAGGGCAAAAGCTTGCCTGTAGAAAAGAAGTATATCAAATGTGGAAAACCTTACAAGAGGACATGGTTTTTTACAAATACTTCATCTGTATATAACTTTGTGATCAAGAGAAAAACATCTGAACCTTGATATGTAAGCAAATTTCTTTGAAGGATTTAGGCAAATTGTCTCTTAAGCTGTGTTATATGGCAGGTCGATTGCTTGTATGGTAAACTTCTTACTTGTTCTGTCCTCTAACACATGTCAGGTATATGTTCTTTTTTGCAGTTTGATTCTGGAATGTCGTGAATAATTTTGCTTGTATAGTCAACTTGTATTTTCTTTCATCATGGTTGTCATTTTACATGTTTTTGTTGAGTTTTTACATCTGGAACAATGTGAATTGTTGTTATTGAGGCTGGAGGCTCTTGTGACTGTTTAACCAGAGAGATTGGATATTTTAACGGTTGTGTTATAGCAACAACTCAAATAAGAGTTCTTTATTAAGTTTTTTGGTGATCTAAGAAAGATTAAGTGTTTCTTTTGATGAGGTAACATTATATTGATGCTTTCGGAGAATAAAACCTATACAAGTAGTACAAAAATAGAGAACATACACAAATATATGGTTCTCTACAAATGATATTTAGTCGTCTATACCAATTGGGATCTCTCCTCTTTCTTTCCATTCAAAGGACCAAATAAGTGCTAGGTCGTCTTCTAAATTCCCAAATATGTGTCACCCCTCATTGTCTCGAAAAGGTGATAAAGTATGAAAAAGTTTCTTCAGAATGAAGATGCCATTATTCTGTGTGTTGGTTAGTTTTGTTAGCTTCGGTTATTGTGTCGTCTTTATTGAGAGCCTCATTTGACGGGTCGACAGCCAATTGTAAGGCTAGACCAGATCCATATCTTGTTTAGCATGAAGAATCAAGTGGAAGCACTAGTATGTTTGATTTTCTAGATCGATTATCAAGATCTCACCCCCTCGACCAACTTGTTCTTTCTGAAGTTAAGCACTATCCCATCTGGACTGAGATCCATATAATGAATCATTTCAGTTAAATGACTTGCTAGCGACAACATATCCCCAACACAATCTACATTATAAAAAACAGTTAGAAATTTCAAATGTCTGGCCAAAACTTAATGGTAAATTATGAAGTGTCCGACATAAAGAAATAGAACACTAGCGCAATGACTTGCTAGCTACAATATATTCCCAACACAATCTACAATATAAAGGATAGTTGTTTACATACTTCCAAAAGATTTAGACAAAACTTAGTGGTAAATTATGTAATATCCCTGGTAAAAAAAGTTGATCATGTAGTGCCAACAGAAATTTGTAAAAGAAATAGAAGACTCCTTAACGATCCAAAAGGCTTATCTTACATTGTAGAAATGTTTGAGAAAGAGAAACTCTGCTATATACCATTAAGCTAGCTTTGGGTGCCTTTCTAGCACGTCCCTCCTATCAAAAGTGATGGAAAAATAGATGAAGTAATGAAAGTAAAGTATGTCTATAAGAAAGGACTACGAAGCATCCTGCACTCACACGTGGTTCAGAGAAGAAGTGCATCCCAAGGGGGTGTGATTTAGGCAGCCTACTTGGAGAAGCATCATGGTAGGCTAATGATTTTCTGTCGATCTAATACAATTATACAAAAATATAAAAGGTGAATGTGTAACTAAGCATATGACTTTCTTTTGTTTACTCTTTGTCTTGACTGTGCTTGGTGAATTATGACTGTTAATGCTGTCTTGTTATATACAGAGTTCATGAAGATTAACCCTAGTATCGGAGAGGAGCCTATTGACATAGAGGATTTGGTCAACATCGGAAGAAGCAGTGGACCGTAGGGTTTTCTTGTGAGTCTTGTCATTTAATGCTTGATTATATGACTGGACTCACTTCTGGTTCTTTTGTAGGTGTCCATATTATGTATCACGAGAACTTCACAAGACTGTGGACATATTATTTGCGCCTTACAATTATCTTATTGATCGCGGATACAGAAAATCTTTGAATATTCAGTGGACAAACAGTATACTTATATTTGATGAAGCTCATAACTTGGTAAATTGCACCTTCAACCGTTGCATCAGTATATTCTTAGGATGCTCACCTTTACATCATTCTTCTGTTGTAATTCAAGATTTAATTTTAATTTTTTTTGGCGCTTATCTTTTTTTTTTTAACCAGGAAAGCTTGTGTGCTGATGCAGCCTCATTTGACCTTTCTTCTGGCCTTCTGACAGCTTGCATCTCTGAAGCTAAAAATTGTATAGACCTTTCG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| Download sequence region |
Get flanking sequences on SL2.50ch03
|
| Related features
Related features
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| Features this polypeptide derives from |
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