Clone Read LE_HBa0001O06_T7_683

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0001O06_T7_683
Primer
T7
ID from Seq. Facility
Le-HBa001_O06-T7.ab1
Chromatogram
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
771 trimmed for vector and quality, 1415 raw
Genbank Accession
Sequence
>LE_HBa0001O06_T7_683 (raw untrimmed)
TTAACCCGGGTACCGGGGGTCCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTAAGAAGTTTTTATTTACCCTTTTTCTATTCCATGGTAGAGAGGGCTCA
ATTTATATATATTTGTCTCCTCCTTTTTTCCACTCTAGGTATTTTGTGATATTTTTGTTGAAATATTAAAAAATGTAATCAATTTATATAATTTTTTGTG
AAGTGAAATAACGCGTATTGCTTTAAATAAGTTTGAATGGTGTTAAGATTGTGTTTTACATATAAGGAAATAAAATGAATGCATGGTTGAATCTTAATGA
TTAAGATTCAGATCATATAAACAAACACACTAAGAGCCCGTTTTGATTGGATTTAAAAAAAAAAACAGCTTTTAAATCAAAAATAAAAAGTCAAACTGAA
ATGATTCAAAAAATGAAAAGTAGGGAGACCTACTTTTGGTCTGACTTTTTTAAAGTTATTTTGAACTTATTTAAAGTTATTTTTCACCTATCCAAATACT
TTCCAACTTATTTTAAATTATTTTTTATATTTGTCAAACACTTATTCGAGCAACTCTTAAATCAATTCAAACAATCTATAAATAAGTTGAATCTTAATAA
TTAAGATTAAAACCTCTATTAAATACAAATAGACGAGGCCTAGGTTCAAGACTATGTTCAATTCATGTGTGACAATTTTGTTTTGTTTTATTTCCATGAG
CTAAAAATATTCCCTTGATAAATGAAATATTTTACTTATTAATTAAAAAAAAAAAGGACCATGTGGACAAAAAAATGTCCTTGCAATAATGATTTCATAT
CATACATCCTTGGGGTTGAGAAAGATAAAAAGAAGTTATAACCTATCATATAGACCAAATATTTGGGATTATGAAGGAAAAAATTTAATTTAAGTTTTTT
TTCGAAATAAAAGGGGGTAAAGTTCATTAAAATTAACCAAAAATTTTTTGTTTTTTTTGGCCCAAATAAAAAAATTCTTAAATGGGTAAAAACTTTTAAA
ATTATCCCTATTTTTTTTTACCAATTTTTTCCAAAAAAAACCCAAAATTTTATAAAATTTGGCTAAAATGCTTATTCTAAAAGCTTTTTCTAAAAAAATT
CAAACTTTATTTTAAACAAAACTTTTTATTTTTAATAAAAAATAAAAATTAAAACTTAAAATTGGAGGGTGATCCTGGGATTTTTAAATAAAAACCTCCC
CCCCAAGAGAACAAAATTTTTCCTTCTTCCTGCCCTAACACTTTTCAATTTCTCACCAAAAAAATCAATAAATGAAGGCGTTGCTTGTGTGCTAAAAAAT
CTATTTTTCTTGGGGTACGAATTTCGCGGGGGTGGCTGGAAAACTATAATTATATTTTATCCACCAAAATGAAATATCTGTCAACACCATGCCTGCGCAG
ATCAAAAAACTACAA
>LE_HBa0001O06_T7_683 (trimmed for quality and cloning vector)
AGCTTAAGAAGTTTTTATTTACCCTTTTTCTATTCCATGGTAGAGAGGGCTCAATTTATATATATTTGTCTCCTCCTTTTTTCCACTCTAGGTATTTTGT
GATATTTTTGTTGAAATATTAAAAAATGTAATCAATTTATATAATTTTTTGTGAAGTGAAATAACGCGTATTGCTTTAAATAAGTTTGAATGGTGTTAAG
ATTGTGTTTTACATATAAGGAAATAAAATGAATGCATGGTTGAATCTTAATGATTAAGATTCAGATCATATAAACAAACACACTAAGAGCCCGTTTTGAT
TGGATTTAAAAAAAAAAACAGCTTTTAAATCAAAAATAAAAAGTCAAACTGAAATGATTCAAAAAATGAAAAGTAGGGAGACCTACTTTTGGTCTGACTT
TTTTAAAGTTATTTTGAACTTATTTAAAGTTATTTTTCACCTATCCAAATACTTTCCAACTTATTTTAAATTATTTTTTATATTTGTCAAACACTTATTC
GAGCAACTCTTAAATCAATTCAAACAATCTATAAATAAGTTGAATCTTAATAATTAAGATTAAAACCTCTATTAAATACAAATAGACGAGGCCTAGGTTC
AAGACTATGTTCAATTCATGTGTGACAATTTTGTTTTGTTTTATTTCCATGAGCTAAAAATATTCCCTTGATAAATGAAATATTTTACTTATTAATTAAA
AAAAAAAAGGACCATGTGGACAAAAAAATGTCCTTGCAATAATGATTTCATATCATACATCCTTGGGGTTG

Warnings:
  • Not screened for chimera
  • Not screened for repetitive elements
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
5' read, flanking vector found
Quality trim threshold
12.5
Sequence entropy
0.895642
Expected error %
0.865222
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0001O06
Clone
Clone name
hba-1o6
LE_HBa0001O06
P001O06
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
85,830
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

Other Reads:
3 sequencing reads found